Альфа-субъединица РНК-полимеразы Е.coli как потенциальный модулятор транскрипции

• Автор: Пуртов, Юрий Александрович
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 88 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СОДЕРЖАНИЕ ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. Общая характеристика структурных н функциональных свойств ДНКзависимой РНКполимеразы . i

2. Особенности нуклеотидной последовательности промотора

I

3. Образование транскрипционных комплексов РНКполимеразы с промотором

4. Структурные н функциональные свойства асубъединнцы РНКполимеразы

5. Топология мест связывания асубъединнц с промоторной ДНК

6. Участие а в формировании тройных комплексов с белкамиактиваторами.

7. Общая характеристика структуры комплекса асубъединицы с промоторной ДНК

8. Взаимодействие свободной асубъединнцы РНКполимеразы .i с ДНК

асубъединица РНКполимеразы как потенциальный модулятор ц транскрипции заключение и постановка задачи
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1. Свободная асубъединица РНКполнмеразы может взаимодействовать с промотором и влиять на его матричные свойства.
2. Комплексообразование свободной асубъединнцы с ДНК зависит от
. нуклеотидной последовательности в области контакта.
3. Избыток в клетках i асубъединицы, способной взаимодействовать
. i с ДНК, влияет на экспрессию многих генов.
4. Свободные димеры асубъединицы влияют на активность промоторов и 2 i vi.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ СТРУКТУРА И СВОЙСТВА аСУБЪЕДИНИЦЫ РНКПОЛИМЕРАЗЫ К i Адекватная реализация генетической информации опосредована множеством регуляторных механизмов, оптимизирующих протекание жизненного цикла клетки в соответствии с окружающими условиями. В настоящее время накоплен большой фактический материал, отражающий разнообразие механизмов, контролирующих транскрипцию конкретных генов, стабильность РНКпродукгга и трансляцию мРНК. Наибольший интерес традиционно представляют механизмы, действующие на ранних этапах, т. За счет них происходит избирательная утилизация конкретного гена или группы генов из всего массива генетической информации. Эффективность регуляторной системы обусловлена, с одной стороны, наличием универсальных механизмов, координировано влияющих на активность генных ансамблей, а с другой вариабельностью их функциональных проявлений в случае каждого конкретного гена. Одни и те же регуляторные белки на разных генах или в зависимости от кофакторов могут быть как ингибиторами, так и активаторами транскрипции, т. Максимально полная информация о действующих в клетке регуляторных элементах необходима для реконструкции сети функциональных взаимоотношений. Поэтому изучение свойств уже известных регуляторов транскрипции, так же как идентификация новых регуляторных элементов, являются актуальными задачами. Инициация транскрипции является сложным и многостадийным процессом, начинающимся с обнаружения ДНКзависимой РНКполимсразой промоторной последовательности гена и заканчивающимся синтезом первых фосфодиэфирных связен и диссоциацией фактора промоторной специфичности асубъедшшцы из инициирующего комплекса. Помимо РНКполимеразы в инициации синтеза РНК задействован целый набор регуляторов различной природы, которые контролируют частоту копирования гена, но специфичность взаимодействия РНКполимеразы с промотором, т. Исходя из этого, целесообразно кратко рассмотреть имеющиеся в настоящее время данные, отражающие особенности строения и функционального взаимодействия промоторов с РНКполимсразой. ДНКзавнсимая РНКполимераза . РНКнуклсотидилтрансфераза 2. РНК в клетках . Она является мультисубъединичным белком и состоит из так называемого корфермента, или минимального фермента, в состав которого входят две асубъединицы 2 , Мг и Мг . Кроме этого, в состав РНКиолимеразы может входить полипептид с 5 , названный сосубъединицей , i, . Он присутствует во всех препаратах РНКполимеразы, выделенных из бактериальных клеток. Эта субъединица может диссоциировать из комплекса с ферментом без потери его функциональной активности . В образовании полного, или холофермента, кроме коровой части также участвует асубъединица. Таким образом, стехиометрия полного фермента РНКполимеразы описывается формулой Мг7х3 . При этом следует отметить, что в данном случае стсубъединнца соответствует целому классу белков, в число которых в настоящее время входят с, а, а, а, а, а, а. Являясь факторами специфичности к определенному типу промоторов, эти белки поддерживают сбалансированный уровень активности различных групп генов. Стехиометрия инициирующего транскрипцию фермента является постоянной и для синтеза одной молекулы РНК в каждом конкретном случае используется только одна из асубъединиц. Наиболее востребованной является а, инициирующая транскрипцию большинства генов бактериальных клеток при экспоненциальном росте и поддерживающая базовый уровень метаболизма клетки. Два белка, а и а, контролируют экспрессию генов теплового шока, т. При переходе клеток к стационарной фазе роста, при недостатке кислорода и ряде других, неблагоприятных для роста клеток условиях, о в составе РНКполимеразы замещается на ст. Число асубъединиц в клетке зависит от ряда условий, при необходимости увеличивается в десятки и сотни раз и регулируется с помощью целого ряда относительно хорошо изученных механизмов, контролирующих транскрипцию соответствующих генов гроН, гроЕ и , эффективность трансляции и стабильность их мРНК.