Характеристика транскрипции в митохондриях жгутиковых простейших

• Автор: Бессолицына, Екатерина Андреевна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 118 с. : ил.

Введение

Обзор литературы

Структура митохондриального генома различных организмов.

Инициация митохондриальной транскрипции.

Инициация транскрипции животных.

Инициация транскрипции в митохондриях беспозвоночных животных

Инициация транскрипции в митохондриях грибов.

Инициация транскрипции в митохондриях растений.

Транскрипция митохондриальной ДНК у различных групп организмов.

Процессинг митохондриальных премРНК у различных групп организмов

Нарезание полицистронных пре мРНК, сигналы процессинга

Модификация Зконца митохондриальных мРНК.
Сплайсинг митохондриальных нитронов
Редактирование митохондриальных мРНК.
Структура и экспрессия митохондриального генома у представителей отряда
ii.
Организация митохондриального генома.
Транскрипция митохондриального генома представителей семейства
Т i.
Процессинг митохондриальных премРНК у представителей отряда ii.
Урилиловое редактирование премРНК.
Нарезание и сигналы процессинга премРНК в митохондриях трипаносоматид
Материалы и методы.
Выделение суммарной и митохондриальной РНК.
Выделение кинетопластной ДНК.
Электрофоретические методы.
гибридизация
Полимеразная цепная реакция ПЦР
3 29.
5 I2 и 9 рРНК
Клонирование продуктов.
Выделение митохондрий i
Компьютерный анализ
Результаты и обсуждение
Транскрипция и созревание митохондриальных рРНК i
Транскрипция и процессинг белоккодирующих генов максикольцевой ДНК
i
Выводы.
Список цитированной литературы


3, которые находятся на разных цепях ДНК, однако, в данном случае, они не перекрываются. Перед каждым восьминуклсотидным элементом находится АТ богатый участок, без которого промотор не функционирует. Таким образом, по первичной структуре митохондриальный промотор курицы представляет собой два инвертированных относительно друг друга нуклеотидных повтора. Эта последовательность способна образовать крестообразную структуру, причем сайты инициации для обеих цепей окажутся в петлях см. С . Для других птиц, структура митохондриального генома и механизмы его реализации изучены только у уток. В их митохондриальной ДНК содержится тот же набор генов, что и у кур, и они расположены в той же последовательности. Контрольная область содержит ориджин репликации и промотор для инициации транскрипции на обеих цепях ДНК с той же консенсусной последовательностью, что и у кур i Н. Т., i V. Млекопитающие. Митохондриальный геном млекопитаю. петли располагаются два промотора для тяжелой цепи и для легкой. Промоторы расположены очень близко друг к другу, но не перекрываются, и инициация транскрипции с них осуществляется независимо. В митохондриальном промоторе человека выделяют два функционально важных элемента см. . Первый прилегает к сайт инициации и является участком связывания РНК полимеразы. Второй элемент расположен за нуклеотидов перед стартовой точкой транскрипции и представляет собой ряд повторов. Он определяет специфичность инициации. С ним взаимодействует транскрипционный фактор белок, содержащий два домена i ii , ДНКсвязывающий домен, имеющий высокое сродство к АТбогатым областям, соединенных короткой линкерной последовательностью и Сконцевой хвост . ., . Расположенные элементы и очень схожи по первичной структуре. Они представляют собой ряд повторов и отстоят друг от друга на расстоянии нуклеотидов. За счет работы этих элементов, каждый митохондриальный промотор может вызывать инициацию транскрипции в двух направлениях т. ДНК, однако преобладает синтез одного транскрипта эффективность инициации на разных цепях различается приблизительно в раз. Стартовые точки транскрипции в обоих направлениях для каждого промотора соответствуют одной и той же паре нуклеотидов i . Р., . В регуляции транскрипции митохондриальных генов, помимо РНКполимеразы и Л, принимает участие протсаза. Она сайтспецнфически связывается с одноцепочечными участками ДНК промоторной области. Кроме того, известно, что протеаза взаимодействует с транскрипционными факторами, вызывая их дщрадацию. Таким образом, этот фермент осуществляет репрессию транскрипции и репликации за счет протеолиза белковых факторов, которые взаимодействуют с ДНК вблизи участка петли. . ., . За пределами петли, со стороны I1, находятся еще два участка, с которыми может взаимодействовать Л. Функциональное значение этих областей неизвестно. Однако, их положение на ДНК относительно аналогично положению промоторных элементов относительно . ДНК i . Р., . Сходная организация промоторных элементов характерна для других видов позвоночных i Т. С., . Однако, при изучении контрольной области мтДНК мыши было обнаружено, что транскрипция тяжелой цепи осуществляется с двух независимых промоторных элементов . . . ., , . Инициация транскрипции в митохондриях беспозвоночных животных. . О., . . АТ богатой области . Для других беспозвоночных информации значительно меньше. . . Инициация транскрипции в митохондриях грибов. vii и . Рисунок 2. Схемы организации митохондриальных промоторов грибов. Флажками обозначены участки инициации транскрипции, серыми прямоугольниками консервативные последовательности с которыми взаимодействует Кполимераза. Белым ЛТ богатый участок. А промоторный элемент дрожжей. В промотор Меигозрога сгазза.