Исследование ассоциации ряда генов-кандидатов с диабетической нефропатией, ишемической болезнью сердца и инфарктом миокарда

• Автор: Воронько, Ольга Евгеньевна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 120 с. : ил

1 .ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. Полиморфные маркеры.

1.1.1. Типы полиморфизмов и методы их исследования.

1.1.2.Использование полиморфных маркеров в исследовании генетики многофакторных заболеваний.

1.3. Характеристика многофакторных заболеваний, исследованных в

данной работе.

1.3.1. Сахарный диабет типа 1 общая характеристика заболевания

1.3.1.1. Диабетические ангиопатии. Диабетическая нефропатия

1.3.2. Ишемическая болезнь сердца .ИБС

I 3.2.1 Основные аспекты этиологии и патогенеза ИБС.

1.3.2.2.Генетические факторы риска ИБС

1.3.3.Инфаркт миокарда ИМ.
1.4. Характеристика исследованных в работе генов и полиморфных
маркеров
1.4.1.Система окиси азота и эндотелиальная КОсинтетаза. Ген эндотелиальной 0синтетазы 3.
1.4.2. Гены липидного обмена.
1.4.2.1 .Ген аполипопротеина Е АРОК
1.4.2.2Ген аполипопротеина В АРОВ
1 4.2.3. Ген липопрогеинлипазы ЬРК
1.4.3.Ген параоксоназы1 РОК1.
2.МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1.Реактивы и ферменты
2.2.Буферные растворы
2.3.Формирование групп больных и здоровых индивидов
2.4.Выделение геномной ДИК .
2.5. Амплификация ДИК
2.6.Расщепление продуктов амплификации рестриктазами .
2.7.Электрофоретическое разделение ДИК.
2.8.Статистическая обработка результатов.
2.8.2.Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов.Точный критерий.Фишера. Поправка Бомфсррони.
2.8.3. Оценка относительного риска. i. Доверительный интервал.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.
3 1 .Анализ ассоциации многофакторных заболеваний.
3.1.1 .Диабетическая нефропатия при СДтипа
3 1 1 1 Исследование ассоциации полиморфных маркеров 4 и
гена 3 с ДН при СД типа
3.1.1.2.Исследование ассоциации полиморфного маркера е2 еЗ е4 гена АРОЕ с ДН при СД типа
3.1.1.3. Исследование ассоциации полиморфного маркера I гена АРОВ с ДН при СД типа 1.
3.1.1.4. Исследование ассоциации полиморфного маркера 7 гена с ДН при СДтипа
3.1.1.5. Исследование ассоциации полиморфного маркера II гена I с Д при СДтипа 1
3.1.2.Ишемическая болезнь сердца ИБС.
3.1.2.1. Исследование ассоциации полиморфных маркеров 4 и
гена 3 с ИБС
3.1.2 2. Исследование ассоциации полиморфного маркера е2 еЗ е4 гена АРОЕ с
3.1.2.3 .Исследование ассоциации полиморфного маркера I гена АРОВ с ИБС 3 1.2.4.Исследование ассоциации полиморфного маркера 7 гена I. с ИБС
3.1.2.5. Исследование ассоциации полиморфного маркера гена 1 с ИБС.
3.1.3.Инфаркт миокарда ИМ
3 1.3.1. Исследование ассоциации полиморфных маркеров 4 и
гена 3 с развитием ИМ.
3.1 3.2. Исследование ассоциации полиморфного маркера е2 3 е4 гена АРОЕ с
развитием ИМ.
3.1 3.3 Исследование ассоциации полиморфного маркера I гена АРОВ с развитием
3.1.3.4.Исследование ассоциации полиморфного маркера ХегМУТсг гена ,7, с
развитием ИМ
.5. Исследование ассоциации полиморфного маркера 1пАг гена РОЫ1 с
развитием ИМ.
4.ВЫВОД Ы.
5.СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ


Факторами риска развития данных патологии является носительство аллеля 4а и гетерозиготного генотипа 4а 4Ь в то время как аллель 4Ь и гомозиготиость по данному аллелю связаны с пониженным риском развития заболевания. Для полиморфного маркера 8 этого же гена показана ассоциация только с ишемической болезнью сердца. Носительство гетерозиготного генотипа ч рассматривается как генетический фактор риска для данной патологии. Полиморфный маркер 1 гена аполипопротеина В ассоциирован с диабетической нефропатией и инфарктом миокарда. Нами показано, что аллель сЗ и гомозиготность по данному аллелю полиморфного маркера 2. Е является фактором риска развития диабетической нефропатии у русских пациентов г. Москвы. Все вышеизложенные результаты получены впервые. Полученные результаты позволяют оценить вклад генетических факторов риска в развитие сердечнососудистых заболеваний и диабетических ангиопатий для московской популяции и могут быть использованы для прогнозирования течения и профилактики осложнений данных заболеваний. Полиморфные маркеры. Типы полиморфизмов и методы их исследовании. Полиморфные маркеры нашли широкое применение в различных областях современной молекулярной генетики от физического картирования хромосом до ассоциации с заболеванием и идентификации личности. Полиморфизм типа вставкаотсутствие вставки. Микро и минисателлитные последовательности представляют собой многочисленную группу рассеянных по всему геному относительно коротких тандемных повторов. Микросателлиты это класс нуклеотидных повторов, включающих от двух до пяти звеньев. Размер повторяющихся единиц в минисателлитных последовательностях может меняться от 6 до нуклеотидов. Отличительной особенностью микро и минисателлитов является наличие среди них большого количества участков, вариабельных по числу копий в кластере. Вариабельные микро и минисателлитные повторы являются чрезвычайно информативными системами Это связано с тем, что они, как правило, состоят из большого количества аллелей с уровнем гетерозиготности, достигающем . Количество высокоизменчивых микро и минисателлитных последовательностей в геноме человека, повидимому, превышает несколько десятков тысяч, они достаточно плотно и равномерно расположены в каждой из хромосом. Так, более из идентифицированных повторов СА являются полиморфными, причем в большинстве из них уровень гетерозиготности значительно превышает i , . Микросателлиты, или , стабильно наследуются и также обладают высоким уровнем полиморфизма, исходя из числа коровых единиц. К гипервариабельным минисателлитным последовательностям относят варьирующие по числу тандемные повторы V vi Общее число высокополиморфных минисателлитных последовательностей в геноме превышает , . Примером V может служить полиморфизм в 4 интроне гена эндотелиальной синтетазы минисателлит, аллели которого содержат либо четыре, либо пять членных повторов. Мононуклеотидные полиморфные участки могут быть локализованы как в некодирующих интроны, промоторные и регуляторные участки, так и в кодирующих областях генов. Подобный полиморфизм в некодирующих областях гена проявляет себя как нейтральная мутация, т. Наличие полиморфных сайтов рестрикции в регуляторных и промоторных областях сопровождается количественными изменениями соответствующего продукта гена, не затрагивающими структуру и функциональную активность белка. Проявление мутации, в конечном счете, определяется пороговым уровнем концентрации белка, при котором его функция еще сохранена. Наличие нуклеотидной замены в кодирующей части гена довольно часто приводит к аминокислотным заменам в полипептидной цепи белка и может влиять на функциональную активность продукта. Полиморфизмы типа вставкаотсутствие вставки I наблюдаются как в межгенных областях, так и внутри генов. Полиморфные участки, возникающие в результате вставок и делений, встречаются гораздо реже нуклеотидных замен. Как правило, они локализованы вне кодирующих областей генов. Размеры вставок могут сильно различаться Примером крупноразмерной вставки может послужить наличие элемента длиной 7 п.