Идентификация и картирование LTR HERV-K на 21 хромосоме человека

• Автор: Курдюков, Сергей Георгиевич
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 104 с. : ил.

1V i iii vi

ii i ген ретровирусов, кодирующий . и белки iV i i vi

IIV vi эндогенный ретровирус человека IV vi vi

IV iii vi
II Vi человеческие эндогенные Vподобные ретровирусы одно н названий V класса II IIV iiv vi V
IIV i vi

АГ ii i V V грызунов, образующие

внутриклеточные V

I i iii раза

I аопроилРОтюгалакгоиираноид

Vi vi
I i
i длинный конченой повтор
ix i марнксшй белок
i ii vi
V V.v vi
XV i i vi
МДР ii i
I ii i
V Vi vi Vподобные ретровирусы ретровирусы млскопгтаюицх С типа
V i i vi V vi V i vi V i ii vi V i i vi
i i нуклеокапендный белок
Обезьяны Нового Свега или широконосые
Обезьяны Старого Снега или узконосые i ii i сайт связывания тР1 Кзатравки V i vi
i ген. кодирующий белок с ревертлзной протсазнои и иктегразной активностью.
i прямой повтор на концах ретровирусной геномной РНК v xi vi i регулятор экспрессии вирусных белков белок IV
V iii vi
viv Ксучувстшггельмая последовательность РНК V vi
v i обратная транскриптаза
V i vi
V vi ii
I i
IV ii iii vi
V V i vi
V ii vi
V ii i vi
i поверхностный гликопротеин
ГМ i i трансмембранный гликопротеин
V vii i вирусподобие частицы
V vi
i 5бром4хлор.Яиндолш1галяктозид
iii дрожжевая искусственная хромосома i i гсн кодирующий цинксвязывающмй регуляторный белок
Сдержание
РЕТРОЭЛЕМЕНТЫ В ГЕНОМАХ ПРИМАТОВ ОСОБЕННОСТИ САЙТОВ ИНТЕГРАЦИИ И РАСПРОСТРАНЕНИЯ У РАЗНЫХ ВИЛОВ. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1 Номенклатура пепкплементов.
2. Особен пост сайтов интеграции ретро элементов.
3. Распространение петоо1эдеме ггов в геномах приматов.
4. Примеры функциональной значимости ретроэлементов.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ММХМНМХНММ.ММММКМОМНМ
МАТЕРИАЛЫ.
Сг1и.1 и г.учи иты
г выделение ДНК РЕКОМБИНАНТНЫХ космил
2. И СТРИШИЯСМШШОйДЫК
лнкпнжрв.
6. ПОЛИМЕРА IIАЯ ЦЕПНАЯ РЬАКПИЯ
7. СЕЛЕКТИВНАЯ ИЦРАМПЛИФИКАЦИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭФФЕКТА ПЦРСУПРЕОСИИ.
КЗ ЛЕГКОПЛАВКОЙ АГАЮЗЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ ЭКСПЕРИМЕНТОВ И ИХ
ОГГУЖ 1Г II

ЦАИ К 0Д1ШУДАЦЖМ1ЦВУ НАЛ А1 ЧКЩЬЬЛ
ггумуры 1.Т.К идимцдинцич.ЗИМЩ.У.Х Р, йУКЗтшЦ лУп .ТИ НР.КУК,.1СкЧ1Н1влц1Ы Пл 2 хгомм пмкчьнжккл.
ФЕИИ ТИК ГНЧК КИИ ЛНЛ.1И ЛОКУС ОН. С ОДЕГААИНЧ 1.1 К НЕКУ К. I
АН.УПУЧАПМИ ИНН ГДНН .ТК. Локл ГДЦЯ ИЧУЧАГ.МЫХ Л К УГКК ИТГ.ЬОВГХ 1НЫЧ
ВЫВОДИ
СПИСОК ДИТЕРЖРЬ
Ретроэлементы в геномах приматов особенности сайтов интеграции и распространения у разных видов. Обзор литсратуры.
Введение


СПИСОК ДИТЕРЖРЬ
Ретроэлементы в геномах приматов особенности сайтов интеграции и распространения у разных видов. Обзор литсратуры. Введение. Рстроэлементм составляю значительную часть генома млекопитающих, но не только этот факт заставляет нас выделять их в отдельную группу. Элементы, кодирующие обратную транскриптачу, также как и элементы, не кодирующие ее, но использующие КТ активность для размножения стоят особняком среди прочих элементов генома млекопитающих. Существуют различные точки зрения на появление К Г активности, образование вирусов и эндогенных ретровирусов. И если I элементы принято считать геномным реликтом, оставшимся в геноме со времени преобразования РНКмнра в мир ДНКсодсржащих геномов, то эндогенные ретровирусы являются производными экзогенных форм вирусов и. Здесь мы касаемся важного вопроса, касающегося различий между сателлиты ми элементами и паразитическими организмами, производными которых являются эндогенные ретровирусы Во первых, хотелось бы отметить важную особенность, отличающую эндогенные ретровирусы от экзогенных вирусов, особенность очевидную из самой классификации эндогенные ретровирусы не способны существовать и размножаться иначе, как только вместе с размножением хозяина. Хотя в определенных условиях рстроэлементы способны к безудержному размножению, мы можем рассматривать этот факт аналогично развитию раковых клеток, т е . Данные утверждения базируются не только на логических построениях, но на фактах изложенных в книге Ричарда Докинза Эгоистичный ген Докинз Р. Главный вывод, который мы можем сделать из вышеизложенною, заключается в том, что рстроэлементы, повышающие приспосабливаемое своих хозяев, одновременно повышают свои шансы на выживание. Многочисленные примеры, приведенные ниже, показывают, что рстроэлементы действительно часто используются клеточными генами как промоторы, энханссры. Сатсллитные рстроэлементы генома. I, конкурирующие за активность с носителями обратной транскрнптазы, могут быть рассмотрены как побочные продукты функционирования генома, как в прочем и сами . I. элементы. И данном случае уместно провести аналогию с вкрои дам и короткими кольцевыми РНКсодержашими внутриклеточными паразитами растений, которые, вероятно, конкурируют за активность РНКполимеразы в клетках и не кодируют никаких белков. Номенклатура ретроэлементов. Повторяющиеся последовательности составляют от до генома человека. Предполагается, что большая их часть образовалась в результате обратной транскрипции РНК и последующей интеграции в геном. Различают следующие большие группы повторяющихся элементов составляют . I1 . I2 2. I 1. Вес они являются стабильно наследуемыми генетическими элементами, образовавшимися за счет ретротранспозиций, произошедших в клетках зародышевого пути. V 0 п. I п. Рисунок 1. Основные группы ртроэтмекто генома человека. Нерпам руиа не кодирует белкой необходимых для ретротранспозикии и использует в основном чужую обратную гранскриптазу Г. К этой фуппе относятся, прежде всего, пссвОогены, которые образуются в результате обратной транскрипции некоторых видов клеточной РНК и последующей их интеграции в геном К. Пссвдогенм, как правило, лишены собственного промотора и поэтому транскрниционно не активны Псевдогсны, которые какимлибо образом приобрели промотор и поэтому транекрипционно активны получили название ретрогент. К этой же категории можно отнести и короткие диспергированные элементы ЛIi ivx . Iэлементами называют короткие 0 до 0 п о. Кполимеразы III. А последовательность или простои тандемный повтор. И геноме Iэлемент фланкирован дуплицированной последовательностью геномной ДНК, возникшей в результате интеграции регроэлемента. Считается, что все Iэлсмснты произошли от структурных клеточных РНК таких как тРНК, 7 РНК ii, . Некоторые Iэлементы получили свои названия эндонуклеаз рестрикции, специфические сайты расщепления которых они содержат Аи повторы. Ко второй группе относятся элементы, кодирующие собственную обратную гранскриптазу. К этой группе относятся ретропозопых нтюпчюпепо юпы и эндогенные ретровирусы.