Молекулярный анализ генома Lemnaceae

• Автор: Мартиросян, Елена Володяи
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 159 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ6.

Глава 1. Обзор литературы.8.

1.1. Ьептасеае морфологическая, таксономическая и

генетическая характеристика.8.

1.1.1. Ботаническая и таксономическая характеристика

Ьетпасеае8.

1.1.2. Современная систематика и классификация семейства Ьетпасеае 8.

1.1.3. Морфофизиологическое описание представителей

семейства Бетпасеае9.

1.1.3.1. Род 1.етга

1.1.3.2. Род рпос1е1а

1.1.3.3. Род ЬагкЛоШа.
1.1.3.4. Род ФоеИа.
1.1.3.5. Род Уо1ГГш
1.1.4. Пути распространения Гетпассае
1.2. Использование Гетпассае
1.3. История филогении, систематики и таксономии Т.етпасеае.
1.3.1. Таксономические и филогенетические отношения Ьешпасеае
1.3.2. Филогенетическое родство Бепшасеае и Агасеае Существующие представления о возможном общем происхождении Ьстпасеае и рода РкИа семейства Агасеае
1.4. Геном растений и методы его исследования.
1.4.1. Уникальные последовательности генома растений.
1.4.2. Характеристика основных семейств генов растительного
генома.
1.4.2.1. Семейство генов устойчивости растений
1.4.2.2. Семейство МАТЗБЬох генов
1.4.2.3.Семейство генов МУВ транскрипционных факторов растений .
1.4.3. Молекулярные методы анализа растительного генома
1.4.3.1. Метод АБЬРанализа.
1.4.3.2. Метод КАРШанализа.
1.4.3.3. Метод БЭРанализа
1.5. исследование полиморфизма хлоропластного генома для определения таксономии и филогении растений.
1.6. Исследование полиморфизма митохондриального генома для
определения таксономии и филогении растений.
Глава 2. Материалы и методы.
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1. Молекулярный анализ ядерного генома Ьетпасеае
3.1.1. Анализ генома Ьетпасеае КАРИ методом
3.1.2. Анализ генома Ьетпасеае АБЬР методом
3.1.2.1. Подбор АРЬРкомбинаций праймерфермент, выявляющий внутри и межвидовой полиморфизм у представителей Ьетпасеае.
3.1.2.2. АЬЬР маркирование представителей Ьетпасеае
3.1.3. Комплексный анализ генетического разнообразия представителей Ьетпасеае с использованием АЬЬР и КАРИ систем молекулярного маркирования
3.1.4. Молекулярный анализ основных адаптивнозначимых семейств
генов у представителей семейства Ьетпасеае.
3.1.4.1. Молекулярный анализ семейства генов резистентности у представителей Ьетпасеае.
3.1.4.1.1. Подбор КВ8комбинацпй праймерфсрмсит, выявляющий внутри и межвидовой полиморфизм у представителей Ьетпасеае
3.1.4.1.2. ИВБ маркирование представителей Ьетпасеае
3.1.4.2. Молекулярный анализ семейства МАОБЬох генов и их аналогов у представителей Ьетпасеае
3.1.4.3. Молекулярный анализ семейства генов МУВ факторов транскрипции у представителей Ьетпасеае
3.1.5. Сравнительный анализ полиморфизма адаптивнозначимых семейств генов и селектшшонсйтральной части ядерного
генома Ьегппасеае
3.1.6. Анализ полиморфизма гена рибосомального оперона 3 у представителей Ьсшпассас
Обсуждение полученных результатов.
3.1.7. Оценка внутривидовой полиморфизма Ьетпассае.
3.2. Анализ полиморфизма последовательностей
хлоронластного генома Ьепшассас.
3.2.1. Полиморфизм последовательностей
интрона гена грБб Сегппасеае
3.2.2. Полиморфизм последовательностей
спейсера гпТтУ.етпассае .
3.2.3. Полиморфизм последовательностей
спсйсера ГтТтЬ Ьстпасеае.0.
3.2.4. Полиморфизм последовательностей
спейсера .тгЬстпасеас.5.
3.2.5. Внутривидовой полиморфизм хлоронластного
генома Петпасеас на примере вида Зргосеа роуга.8.
3.2.6. Комбинированный анализ данных четырех областей хлоропластного генома Ьешпасеае
спейсеры гпТгп, гпТтУ, гпЬтР и интрон гена гр6.0.
Обсуждение полученных результатов но четырем обласгям хнДНК Пешпасеае.1.
3.3. Анализ полиморфизма последовательностей
митохондриального генома .етпассае.7.
3.3.1. Характеристика протяженных инсерцин
в нитроне Ьс гена паг Ьетпасеае.8.
3.3.2. Характеристика последовательности Ьс
интрона видов Ьетпасеае3.
3.3.3. Внутривидовой полиморфизм митохондриального генома у представителей Ьетпасеае5.
3.3.4. Анализ доменов интрона ядеН представителей Ьешпассас.5.
3.3.5. Филогенетическое родство Ьешпасеае и Агасеае на основе анализа полиморфизма интрона Ьс гена пасИ митохондриального генома9.
3.4. Филогенетические отношения у анализируемых видов 1етпасеае данные молекулярного анализа ядерного, хлоропластного и
митохондриального геномов. 4.
Заключение 6.
Основные выводы9.
Список литературы


Цветут крайне редко раз в несколько лет. Перед цветением, которое происходит по второй половине лета, образуются специальные, так называемые, плодущие листоподобные пластинки, отличающиеся меныпими размерами и более темной окраской. Опыление производят, повидямому, мелкие насекомые в начале цветения и ветер в конце цветения. Плоды округлые, снабженные на пжней стороне крыловидным выростом килем, который облетает плавание. Через некоторое время плоды разрушаются, а семена либо прорастают, либо погружаются на дно водоемов до весны. Так же перезимовывают и листовые нластитгки, которые перед наступлением холодной погоды накапливают большое количество утяжеляющего их крахмала. Род . Данный род состоит из четырех секций, которые объединяют видов табл. I.I Вегетативное тело плоское за исключением вида . А Фронд плоский, гладкий, овальной формы, обычно симметричный. Правильная симметрия листовой пластинки и отсутствие красноватой iтоциановой окраски на внутренней поверхности фронда являются отличительными признаками, по которым, как считается, можно различить Ii от нсгиббоидных форм вида . На поверхности поды растения . Вид . Б. Вид . Северной и Южной Америки, Европы, Азии, в том числе и России, Австралии и Новой Зеландии интродуцированы. Рис 1. А. Ь. Б Карта распространения Ь. Наиболее морфологически легко отличимый вид из рода етпа рис. Вегетативное тело Ь. Растения часто соединены между собой тонкими стеблями в ветвистую цепь по штук, формируя спутанный клубок, плавающий в толще воды. Корни отсутствуют или может присутствовать один корень. Г. пуиса широко распространенный вид, ареал которого охватывает территории Европы, Африки, Азии и Австралии. Интересно, что на территории Южной и Северной Америк Ь. Аляске. Рис. Иг. Фронд округлый, мм в длину, с тремя жилками, часто асимметричен, имеет антоциановую окраску на внутренней стороне, с одним корнем. Главным отличительным признаком данного вида является наличие на внутренней поверхности фронда клеток аэренхимы с большими воздухоносными полостями до 0. А. Степень гиббоидности может зависеть от условий окружающей среды. Негиббоидные формы . Вид широко распространен в областях с теплым умеренным и тропическим климатом, включая Северную и Южную Америку, Европу, Африку и Азию рис. Б . Рис. Б. Карта распространения I. Фронд плоский, округлой или овальной формы, мм в длину. Наружная поверхность листовой пластинки обычно блестящая, темнозеленой окраски, покрытая мельчайшими узелками вдоль средней линии рис. А. Растения . Вид широко распространен на территории Северной Америки США и Канада и имеет ограниченные ареалы на территории России Дальний Восток, Центральная и Западная Сибирь рис. Б.
Рис. Вид близкородственный и трудноотличимый от . Считается, что вид аропса имеет гибридное происхождение и одной из родительских форм является . Имеет более ограниченный ареал обитания, чем . Может встречаться также в Дальневосточных районах РФ. ИаНл. Фронд плоский, асимметричный скошенный в сторону, . Листовая пластинка с тремя слабозаметными жилками. Корень один с двумя крыловидными выростами. Обитает в областях с тропическим климатом на территории обеих полушарий. Вид . Отличительными признаками этих двух видов являются лишь количество граней на поверхности семян и способность к выпадению семян из плодовой оболочки. На территории России вид . Рис 1. Фронд овальный, плоский, гладкий, . Жилкование слабое. На поверхности воды плавают одиночными фрондами или соединенными по растения. Америки, формируя гетерогенные популяции с другими видами и i. Вид . Одним из основных отличительных признаков этих двух видов являются разные ареалы обитания. Ареал распространени . США. Род i. Род i многокоренник. В состав рода входят два вида . Вегетативное тело плоское, округлое, с 7 жилками. Корней от 5 7 до . Растения плавают поодиночке или соединенные по листовых пластинок. Северной и Центральной Америки, Европы. Африки, Азии и северной части Австралии. Рис 1. Вид . Аргентины до Венесуэлы и в северной части Гватемалы , 6.