Модульная организация регуляторных систем транскрипции и трансляции на примерах преинициаторного ТАТА-комплекса и регуляторной ВС1 РНК

• Автор: Кондрашов, Александр Владимирович
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 135 с. : ил

Однако, регуляция взаимодействия между ними носит скорее общий, нежели специфический характер, а специфичность достигается благодаря локализации мРНК в соответствующих местах белкового синтеза в клетке . Уникальным примером регулятора, совмещающим особенности как специфической регуляции на уровне локализации, так и общей на уровне взаимодействия между кэп и полиА структурами, является ВС РНК. ВС РНК является во многих отношениях интересным и уникальным объектом для изучения. Вопервых, это малая цитоплазматическая, некодирующая белок РНК. Являясь в эволюционном измерении производной аланиновой тРНК, ВС РНК также транскрибируется РККполимеразой III ii, i, . Однако, что довольно редко встречается для транскриптов такого рода, паттерн экспрессии проявляет четкий тканеспецифический характер и ограничивается только нервной и репродуктивной системами. ВС РНК до настоящего времени остается неизвестным. Не ясным также оставался вопрос относительно функции ВС. Опять же, исходя из ее происхождения от транспортной РНК, предполагалось участие ВС в трансляции. Последнее следует кроме всего и из того факта, что эта РНК после своего синтеза в нейронах головного мозга транспортируется в дендриты и колокализуется в местах локального белкового синтеза iv . РНК особого вида ВС1. Изучить функционально значимые белковые факторы, образующие комплексы со специфическими участками ВС1 РНК. В результате проведенного исследования нами был предложен подход, названный бинарная система ретардации, позволяющий тестировать изменения в связывании белков ядерных экстрактов с ДНКпоследовательностями ТАТАбокса в присутствие различных энхансерных элементов. ТАТАпоследовательности генов и ВС1 связываются с транскрипционным фактором 1. ВС1 РНК. А также неоднократно на научных семинарах Института цитологии РАН и центра молекулярной биологии воспалительных процессов Университета города Мюнстер. Работа изложена на 5 страницах машинописного текста и иллюстрирована рисунками. Модульность, как общий принцип организации и регулирования сложных систем. Универсальность рассмотрения организации и регуляции сложных мультихомпонентных систем с точки зрения модульности следует из применимости этого подхода для довольно широкого спектра биологических и небиологических дисциплин. Так, например, модульность считается одним из базовых принципов, а также преимуществом при создании операционныхсистем . Важным здесь представляется выделить принцип взаимозаменяемости компонентов модульной системы. Однако понятие модуля может несколько отличаться и применяться поразному в разных дисциплинах, например, в экологии и биологии развития , . На организменном уровне выделяют организмы, построенные по унитарному или модульному плану. Модуль в данном случае определяется как независимо функционирующая физиологическая единица. В некоторых теоретических моделях функционирования клетки , , v , , принцип модульности берется за основу. Цель при этом состоит в упрощении понимания контроля клеточных функций благодаря введению ограниченного набора несвязанных, но взаимозависимых функциональных модулей. На конференции по Модульности в развитии и эволюции , i, определение модуля выглядит как относительно независимая функциональная единица или единица развития, являющаяся компонентом сети взаимодействующих элементов. При попытке более строгого определения модули были разделены на три основные категории, к первой из которых относится определение модуля как протяженной нуклеотидной или аминокислотной последовательности, ассоциированной с определенной специфической функцией. В качестве примера приводится, например, модульная архитектура цисрегуляторной области гена i дрозофилы, а также ряд других примеров, общий смысл которых сводится к тому, что различные комбинации ограниченного набора транскрипционных регуляторов связываются с комплексными цисрегуляторными областями. Этот комбинаторный принцип контроля экспрессии генов может представлять достаточно общий механизм, когда определенный набор сигналов используется для координирования дифферекцировки различных развивающихся модулей.