Структурно-функциональный анализ гена рибосомного белка L11 человека

• Автор: Воронина, Елена Николаевна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 100 с. : ил.

Содержание.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ...
ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР. СТРУКТУРА И ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ РИБОСОМНЫХ БЕЛКОВ ВЫСШИХ ЭУКАРИОТ. И

1. Организация и структура генов рибосомных белков

Картирование генов РБ

Экзоиишпронная структура генов РБ

мяоРНК.

2. ТРАНСКРИПЦИОШЫЙ КОНТРОЛЬ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ РБ.

СрОостровки.

Олигопиримидиновый тракт и точка старта транскрипции.

Транскрипционные факторы, участвующие в регуляции транскрипции генов РБ
Тканеспецифичная экспрессия генов РБ у растений
3. Пост ранскрипционная регуляция синтеза РБ.
Смайсинг.
Антисиысловые РНК
Транспорт мРНК в цитотазму
Деградация мРНК
4. Трансляционный контроль синтеза рибосомных белков
Овэлементы трансляции.
Тгапзфакторы трансляции.
Участие рибосомного белка , в регуляции транаяции ТОП мРНК. .
5. Заключение.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Материалы
Методы.
РЕЗУЛЬТАТЫ Ж1чИМИИЖМИИ1ИИММИМММИНШИИММ1ИЧМ1М1МЧИИН1ЧМ
1. Получение РАСклонов, включающих интронсодкржащий ген рб Ы человека.
Получение интронсодержащего фрагмента гена РБ И1 чаовска
Скрининг РАСбиблиотеки
2. Структура гена.
Картирование гена рибосомного белка И1 человека
Определение нуклеотидной последовательности экзоны и интроиы, промоторная область
гена рибосомного белка А1 человека.
Определение точки инициагии транскрипции6
Поиск мяРНК
3. Взаимодействие промоторного района гена ИКРЫ 1 с белками ядерных экстрактов
КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА.
Взаимодействие участков промотора, первого экзона и первого интрона гена с
белками ядерных экстрактов клеток человека.
Сравнение промоторных районов генов , и
Взаимодействие промоторных элементов гена 1 с белками ядерных экстрактов
клеток различных клеточных линий.
Репрессия транскрипции приводит к появлению нового ДНКбелкового комплекса в паттерне
связывания ядерных экстрактов опухолевых клеток с промоторным районом гена II
ТФ 1 является одним из компонентов участвующих в активизации транскрипции гена человека
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Структура гена .
Взаимодействие промоторного района гена II с ТФ.
Сравнение промоторных районов генов , и .
входит в сложный ДНКбелковый комплекс, формирующийся в районе 6. гена
Функциональное значение ТФ в регуляции экспрессии гена I 1
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Нуклеотидные последовательности большинства генов РБ и рРНК уже определены, однако лишь для небольшой части генов РБ млекопитающих исследована регуляция их экспрессии. В отличие от рРНК, которые кодируются несколькими сотнями генов и кластеризуются в несколько локусов, каждый эукариотический РБ кодируется только одним геном кроме 4, различные гены которого находятся на X и хромосомах и эти гены распределены по всему геному 9. Единственная функциональная копия гена генерирует большое количество процессированных псевдогенов , что осложняет клонирование и функциональный анализ генов РБ. Для достижения эквимолярного количества РБ в большом разнообразии условий клеточного роста используется координация различных уровней экспрессии генов. Так регуляция на транскрипционном и посттраискринционном уровнях экспрессии генов РБ необходима для достижения примерно равного количества всех рибоеомных белков. Это демонстрируют эксперименты, показывающие равное привлечение РНКполимеразы промоторами различных генов РБ, равное количество мРНК, сравнимую степень экспрессии репортерных генов 3, . Эти данные предполагают, что гены РБ используют промоторы примерно равной силы. Исследования регуляторных элементов промоторов генов РБ выявили сайты связывания ТФ как в выше, так и ниже точки старта транскрипции . Наиболее распространенными из используемых генами РБ являются ТФ , , 1 Г. Если связывание любого индивидуального ТФ с промотором гена нарушалось сайтспецифическне мутации, транскрипционная активность гена уменьшалась, но не прекращалась. ТФ. Однако, регуляторных факторов характерных только для генов РБ не выявлено. Особенностью генов РБ высших эукариот является наличие ОПТ в районе старта транскрипции. ОПТ играет важную роль в определении точки старта транскрипции, а также является цисэлсмснтомтрансляционного контроля экспрессии генов , . Трансляционный контроль ТОП мРНК мРНК с терминальным ОПТ выражается в селективном выходе данных мРНК из полисом репрессия трансляции при блокировании прохождения клетки через фазу 1 недостаток питательных веществ, контактное ингибирование или конечная дифференцировка, 1 ингибирование синтеза ДНК и 2 ингибирование сборки веретена деления, а также при недостатке аминокислот. Когда же покоящаяся клетка индуцируется на клеточное деление или рост или происходит восстановление запаса аминокислот, ТОП мРНК рекрутируются на полисомы активация трансляции. Точных механизмов регуляции трансляции ТОП мРНК пока не выявлено. Интерес к биосинтезу рибосомы также стимулируется находками, что мутации в генах, кодирующих компоненты рибосомы или белки, вовлеченные в созревание, сборку или экспорт рибосомы из ядра, могут приводить к развитию некоторых наследственных заболеваний у человека. Так, например, анемия i врожденная наследственная форма парциальной красноклеточной аплазии, причиной которой являются мутации в одном или нескольких генах РБ. Мутации, приводящие к развитию , были найдены в генах около случаев , 2, и 5 по и др. Во всех случаях наследование является аутосомнодоминантным. Считается, что в основе заболевания лежит гаплонедостаточпость РБ, которая приводит к недостаточному созреванию рибосом, что в свою очередь вызывает синтез малого количества гемоглобина и гибели предшественников эритроцитов. Особый интерес представляют результаты, указывающие на участие многих рибосомных белков в регуляции клеточного цикла. Важность рибосом в регуляции роста и гибели клеток неудивительна, но рибосомныс белки вовлекаются в эти процессы не только как структурные элементы рибосомы, и как эффекторы или модуляторы изменений клеточного цикла. Так, например, инактивация гена рибосомного белка 6 i приводит к образованию опухолей в некоторых тканях, что указывает на 6 как на генсупрессор опухолевого роста . С другой стороны, в опухолевых клетках повышен уровень некоторых рибосомных белков, например, крысы , и человека , а увеличение экспрессии генов 7 и 3 человека приводит к угнетению роста клеток и вступлению их в апоптоз.