Изучение принципов пространственной организации гликопротеинов методом теоретического конформационного анализа

• Автор: Аванов, Александр Яковлевич
• Шифр специальности: 03.00.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1989
• Место защиты: Ереван
• Количество страниц: 260 с. : ил.

Оглавление
Страницы
Введение.

Глава I. Литературный обзор.

1.1. Структурные особенности гликопротеинов.

1.1.1. Грул тоспецифические гликопротеины

1.1.2. Антиризные гликопротеины.

1.1.3. Структурные условия цгликозилирования

1.2. Теоретический конформационный анализ

и методика расчта.

Глава II. Конформационный анализ гликопептидных фрагментов группоспецифических гликопротеинов
.1. Гликопептидные фрагменты с дисахаридными
звеньями Оа11 е1НАсС1 в боковых цепях.,.
.2. Гликогептапептид РгоТЬг3пК1гЗивп
ТПгЗипРгоЗегЗгпТгЗивп ИЗ группоспецифического гликопротеина со специфичностью А
Глава III. Пространственная модель группоспецифических
гликопротеинов
III. 1. оСпираль.
ш.2. Зигзаг.
1.3. Структура
1.4. Структурная шпилька.
Ш.5. АБаррел.
Глава IV. Конформационный анализ гликопептилных фрагментов группоспецифических гликопротеинов с
трисахаридныш боковыми цепями.
IV. 1. Трисахариды i 21 3,
3 i16Ii1,
i 4,1 3II1
IV.2. Гликопептицы
IV.3. Гликодипептиды 3ii.3
IV.4. Гликотрипептиды 33i3i3.
Глава v. Конформационный анализ антифризных
гликопротеинов.1
V.1. Возможные структурные модели антифризных гликопротеинов.
V.2. Физикохимическая модель функционирования антифризных гликопротеинов.
Глава VI. Конформационный анализ гликозилированного
остатка и сайта нгликозилирования
VI. 1. Гликопептид 3141
VI.2. Сайт iгликозилирования
Заключение
Литература


Эти группоспецифические гликопротеины ГСГП определяют групповую принадлежность организма и участвуют в явлениях иммунитета. Строго говоря группы крови определяются антигенными различиями между эритроцитами разных индивидуумов, выявляемыми с помощью специфических антител. Таблица 1. Система групп крови АВОН. По структурным особенностям ГСГП отличаются тем, что их полипептидная цепь нест большое число несколько сотен сложных олигосахаридных цепей, тогда как для других гликопротеинов свойственно наличие или большого числа простых олигосахаридов, или всего нескольких сложных цепей, как в нгликозилпротеинах. В ГСГП имеются и нгликозидные связи ,, ко их ничтожно мало, поэтому ГСГП относят к огликозилпротеинам. Точные данные о структуре, размерах и гетерогенности углеводных цепей ГСГП получены е работах Деревицкой, Арбатского и Кочеткова ,. Кочетков с сотр. ГСГП специфичности Н из слизистой желудка свиньи углеводные цепи гетерогенны, но построены по единому образцу. Они содержат от зх до и и более моносахаридных остатков. Дисахаридный фрагмент Са1ЗСга1МсоС1 на восстанавливающем конце инвариантен во всех ГСГП человека и представляет собой кор огликозидных углеводных цепей. Взависимости от числа остатков и типа разветвлений в дисахаридном коре, все олигосахаридные цепи ГСГП делятся на шесть серий табл. Каждая из этих серий включает от зх до 6и разных углеводных цепей, различающихся только числом и положением концевых остатков оъРис я Хца1сПАс . Распределение углеводных цепей в ГСГП неравномерно из приведнных в таблице 2 шести серий наиболее представлены первая до и вторая до . Таблица 2. Классификация оСЕЯзанных углеводных цепей, выделенных из группоспециФичеоких гликопротеинов специфичности Н ,. К, з 2 , X ИЛИ . Этим обстоятельством ГСГП также отличаются от других огликозилпротеинов, в которых детерминантами служат только остатки и Рис. Эти остатки располагаются на невоостанавливающем конце олигосахаридных цепей и являются иммунодетерминантными табл. З. В системе групп крови АВ0Н детерминанта со. Н имеет на невосстанаЕливающем конце остаток Рис при присоединении к невосстанавливающему концу остатков или Ндетерминанта превращается, соответственно, либо в А, либо Вдетерминанту. Детершнантные олигосахариды в ГСГП с А, В и Нспецифичностью могут быть двух типов табл. Зтот мостик может состоять из лактозаминных или изолактозаминных ЗЕеньев. С помощью теоретических расчтов были Еыделены пространственные структуры детерминактных олигосахаридов . Поскольку концевые остатки углеводных цепей экспонированы во Енешнюю Еодную среду, образование водородных связей не учитывалось. Оказалось, что для каждого детермикантного олигосахарида реальна только одна конформация. Такая структурная жсткость обусловлена невалентными взаимодействиями остатков, непосредственно не связанных между собой. Таблица 3. ГСГП системы АВОН и Ье. А СгаШАсоЛх Пептидная цепь ГСГП на 6о состоит из остатков i и , практически каждый из которых гликозилироЕан во, и ,. Углеводные компоненты присоединены к остаткам Зег и i через остатки дисахаридного кора ,,, причм сахарный остаток находится в оСаномзрной форме . Содержание остатков i, и Е некоторых Фрагментах достигает . Так, при обработке проназой гликопротеина из кисты человека с групповой специфичностью А были Еыделены Фракции со следующим содержанием этих остатков Iii . . . В полипептидной цепи ГСГП часто встречаются кластеры гликозилироваяных аминокислотных остатков. Это означает, что олигосахаридные цепи расположены близко друг от друга, что может приводить к образованию компактной структуры, в которой пептидная цепь практически полностью закрыта углеводной оболочкой. В качестве примера приведм гликопептид i, выделенный из ГСГП со специфичностью А , в котором все остатки оксиаминокислот гликозилированы. Данных о пространственной структуре ГСГП практически нет.