Промежуточные состояния в сворачивании белков и их функциональная роль

• Автор: Бычкова, Валентина Егоровна
• Шифр специальности: 03.00.02
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 1997
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 209 с. : ил.

Памяти Моей первой учительницы Эмилии Вениаминовны ФРИСМАН посвящается
СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ
1.1. Проблема сворачивания белков
1.2. Кинетические и равновесные промежуточные состояния
1.3. Физиологическая роль промежуточных состояний ..5 .1. РАСПЛАВЛЕННАЯ ГЛОБУЛА in vitro
11.1.1. Открытие нового промежуточного состояния
11.1.2. Компактность
а) моделирование компактности
б) сравнение размеров глобулярных белков и развернутых цепей
II. 1.3. Наличие ядра и оболочки
II. 1.4. Вторичная структура
11.1.5. Фазовые переходыи их физические причины ...34 а) фазовые переходы N MG и MG U
в) переходы в сополимерах заряженной и незаряженной аминокислот
г) "доменный" характер плавления в белках и гомополимерах
11.1.6. Расплавленная глобула - не исключение,
а правило
.2. РАСПЛАВЛЕННАЯ ГЛОБУЛА in vivo
11.2.1. Гипотеза о функциональной роли расплавленной глобулы и ее экспериментальное подтверждение
11.2.2. Денатурирующее действие мембран или почему белки могут быть в состоянии расплавленной глобулы в клетке?
II. 2.3. Расплавленная глобула и транспорт неполярных лигандов или моделирование функции белка вблизи мембран
II.3. ПЕРСПЕКТИВЫ
II. 3.1. Расплавленная глобула и белок-белковые
взаиимодействия
11.3.2. Расплавленная глобула и некоторые генетические заболевания
III. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
IV. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
IV. 1. Материалы
IV 2. Методы определения размеров молекул
IV.2.1. Характеристическая вязкость
IV.2.2. Квазиупругое светорассеяние
IV.2.3. Макроскопическая диффузия
IV.2.4. Рассеяние рентгеновских лучей
под малыми углами
IV.2.5. Поляризация флуоресценции
1997) . Принимая во внимание существование ядра в состоянии расплавленной глобулы (как это следует из данных по рентгеновскому рассеянию под большими углами), можно считать, что молекула белка в этом состоянии действительно набухает неоднородно и имеет более плотно упакованное ядро и более рыхлую внешнюю оболочку, достаточно лабильную, чтобы включить в себя более 250 молекул воды, находящихся в равновесии с окружающий водной средой.
11.1.4. ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
Спектры кругового дихроизма (КД) в области поглощения пептидных связей (дальней УФ области) дают информацию о наличии вторичной структуры в белках. При этом наличие двух минимумов (207нм и 220нм в спектре КД) свидетельствует о наличии а-спиральной структуры, а присутствие одного широкого минимума (212-220 нм) характеризует Р~ структуру; неупорядоченная структура характеризуется появлением минимума на 198нм.
На рис.8 представлены спектры КД двух гомологичных белков а-лактальбуминов коровы и человека в нативном состоянии и состоянии расплавленной глобулы (pH 2,0). Интенсивности спектров КД в этих состояниях различаются. Чтобы выяснить, связано ли это различие с разным содержанием вторичной структуры, было сделано разложение спектров КД. Для а-лактальбумина коровы было получено содержание а-спиралей и Р-структуры 31% и 18% соответст-