Классификация и систематизация механизмов ферментативных реакций

• Автор: Галимова, Миляуша Харисовна
• Шифр специальности: 03.00.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 119 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И МЕТОДЫ обзор литературы.

1. История вопроса

2. Что такое реакции химические, биохимические Закон действующих масс.

Уравнения. Примеры

3. Молекулярность и стехиометрия реакции.

4. Порядок реакции.

5. Обратимые реакции.

6. Метод квазистационарных концентраций. Теорема Тихонова

7. Кинетика ферментативных реакций. Простая каталитическая реакция.

8. Вывод уравнения стационарной скорости.
9. Принцип метода КингаАльтмана.
. Метод графов.
. Правила упрощения храфов
. Классификация ферментативных реакций.
. Номенклатура и метод Клиланда.
. Альтернативные номенклатуры
ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬТАТЫ.
1. Вывод уравнений стационарной скорости в разных видах
2. Подход к анализу кинетических кривых
3. Односубстратные реакции.
4. Двухсубстратные и трехсубстратные реакции.
ЛИТЕРАТУРА


Поскольку обычно невозможно измерить все индивидуальные константы скорости, были предприняты многочисленные попытки представить уравнение скорости в форме, содержащей параметры, которые имели бы более определенный физический смысл , . Простейшим из подходов для понимания и использования стал метод Клиланда . Подробно метод и его номенклатура описаны в диссертационной работы. Для отдельных механизмов ферментативных реакций уравнения скорости реакции давно известны и хорошо разработаны . Особенно для ферментативных реакций с одним субстратом и одним продуктом. Однако уравнения скорости для реакций с двумя или большим числом субстратов и продуктов гораздо сложнее. Исследователи обычно записывали уравнения скорости только для начальных скоростей. А когда записывались уравнения скорости для полных обратимых механизмов, то они оставлялись в терминах индивидуальных констант скорости и не выражались в терминах кинетических констант, которые могут определяться экспериментаторами. Данная работа единственная в своем роде. В ней впервые вместе рассмотрены различные наиболее часто встречающихся в природе механизмы полностью обратимых одноцентровых ферментативных реакций, для каждого из которых выведены уравнения стационарных скоростей, как в терминах индивидуальных констант, гак и в терминах кинетических констант. Что такое реакции химические, биохимические Закон действующих масс. Уравнения. Кинетика наука о скоростях реагирования различных веществ. Под термином различные вещества могут пониматься как молекулы и атомы в химических реакциях, так и особи, например, в экологических проблемах сосуществования видов. Химическая кинетика раздел физической химии, содержанием которого являются скорости химических реакций. и т. Из основных задач химической кинетики можно выделить прямую расчет скоростей реакций и определение зависимости концентраций реагирующих веществ от времени кинетических кривых, и обратную определение механизмов реакций по кинетическим кривым. Во многих случаях скорость реакции резко изменяется в присутствии специальных веществ катализаторов. Катализаторы участвуют в реакции, но не расходуются в ней. Катализаторы биологических процессов, протекающих в живых организмах, представляют собой белковые молекулы, которые называют ферментами от латинского ГегтепШт закваска, или энзимами. Однако встречи, как правило, случайны, и предсказать их невозможно. В силу этого рассматривают процессы, состоящие из многих встреч. Тогда можно говорить о вероятности встречи и о среднем числе реагирующих веществ в реакции, т. Зависимость скорости реакции от концентрации описывается основным постулатом химической кинетики законом действующих масс. Первый пример. Рассмотрим реакцию взаимодействия двух различных веществ А и В, в результате которого образуется одно сложное вещество Р. А В 2. А и В концентрации исходных веществ реакции, Р концентрация конечного вещества реакции, время. Из приведенной записи видно, что у определяется либо по убыли поэтому со знаком концентрации исходных веществ с1АЖ, либо по возрастанию концентрации конечных веществ реакции ЛРШ за определенный период времени. А и В прореагируют. Обозначим эту вероятность через р. КАВр, где К коэффициент пропорциональности. Обозначил Кр. АВ. Ею называют кинетическим законом действующих масс КЗДМ. Коэффициент к является некоторой постоянной и называется константой скорости реакции. Исходные вещества А и В называют субстратами реакции конечное вещество Р9 полученное в результате реакции, продуктом реакции. Второй пример. Л ВР д. В с ЛВ. А вот если реакция 2. А 1В 1Р . ЛР. Л с Р . Важную информацию о кинетике дают понятия молекулярности, порядка и стехиометрии реакции. Большинство химических реакций состоит из нескольких стадий, называемых элементарными. Под элементарной стадией или реакцией обычно понимают единичный акт образования или разрыва химической связи, который происходит через образование переходного комплекса. Число молекул, участвующих в элементарной реакции, называют молекулярностью реакции. Элементарные реакции бывают трех типов. А Р.