Синтез, структура полипептидов регулярного строения, содержащих лизин, орнитин, цитруллин, и их взаимодействие с ДНК

• Автор: Камилова, Рена Рустамовна
• Шифр специальности: 02.00.10
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Душанбе
• Количество страниц: 166 c. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

структурные особенности полипептидов и полипептидных цепей белковых молекул.С использованием КД,

ДОВ и ЭПР спектроскопии

полипептиды регулярного строения как модели белков и их взаимодействие с ДНК.

ГЛАВА II. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ .

1. Синтез 2,4,5 трихлорфениловых эфиров трипепти дов с последовательностью аминокислот А1а0гпX, где X глицин, аланин, глутаминовая кис

лота, лизин, орнитин

2. Синтез 2,4,5 трихлорфениловых эфиров трипеп тидов с последовательностью аминокислот X 1у . где X лизин, орнитин, цитруллин .

3. Полжконденсация 2,4,5 трихлорфениловых эфи

ров трипептидов
4. Изучение бактерицидных свойств полипептидов .
5. Структурные особенности полипептидов , модели рующие основные свойства концевых участков различных гистонов .
6. Изучение конформационной подвижности полипеп тидовуЬузу ,уОгцуп,А1а0гаА1ап и А1аОтуп методом спиновых
меток .
7. Исследование взаимодействия полипептидов Яу0гп1уп И А1а0гпА1аГх с ДНК
ГЛАВА III. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ III
1. Синтез метиловых эфиров ацилпептидов .
2. Синтез ацилпептидов
3. 2,4,5 Трихлофениловые эфиры ацилпептидов. 8
4. Галоидгидраты и трифторацетаты 2,4,5 три хлорфениловых эфиров пептидов.
5. Синтез регулярных полипептидов ме
тодом активированных эфиров .
6. Полипептиды .
7. Определение оптической частоты полипептида
А1а0гпА1ап .
8. Синтез спинмеченых полипептидов и исследование
их методом ЭПР.
ВЫВОДЫ Щ
ЛИТЕРАТУРА


Точки, представленные на диаграмме, соответствуют конформациям аминокислотных звеньев трех типов регулярных структур спирали рС , параллельной и антипараллельной р складчатой структуры Н и И и структур типа поли пролин II и ИЛИ полиглицин II Я , которые являются моделями коллагена. На рис. Н н о
I
Рис Л. Конформационная карта углов внутренного вращения и У . Участок полипептидной цепи. Рис. Спектры КД и ДОВ полилизина трх типов регулярных структур Х, и ВЛС. II вытянутой левосторонней спирали, соответствующей заряженной форме полилизина, 2 . По многочисленным данным полипролин II, полиглицин II, а также синтетические гетерополипептиды, которые согласно рентгенографическим данным обладают коллагеновой структурой, т. ВЛС конформацией полипептидных цепей, тлеют, как правило, положительный дихроизм в длиноволновой части спектра вблизи 50 нм и сильный отрицательный КД в области 7 нм рис. Их кривые ДОВ характеризуются сильным отрицательным вращением в области 0 нм. Другие регулярные структуры о спираль и структура характеризуются качественно противоположными спектрами КД длиноволновая часть спектра у них отрицательна, а коротковолновая положительна. Кривые ДОВ этих структур имеют сильное положительное вращение в области 0 нм. Таким образом, ДОВи ВДспектроскопия удобные методы для установления регулярных конформаций полипептидных цепей. Эти утверждения базируются как на экспериментальных результатах, так и на теоретических расчетах спектров ДОВ и КД спиралей, структур и спиралей полипролина. Однако, используя эти методы для изучения полипептидов и белков необходимо идентифицировать не только регулярные конформации, но и неупорядоченные участки цепи. Поэтому важно выяснить, каким образом неупорядоченная конформация полипептидной цепи проявляется в их спектрах КД и ДОВ. Исследования кооперативных конформационных переходов, индуцируемых изменением в заряженных гомополипептидах главным образом полилизине и полиглутаминовой кислоте положили начало интерпретации их спектров КД и ДОВ. В то время как существует много доказательств в пользу того, что спектры КД и ДОВ незаряженных полилизина и полиглутаминовой кислоты отражают о спиральную конформацию, нет независимых доказательств того, что спектры КД и ДОВ заряженной формы этих полипептидов отражают максимально неупорядоченную полипептидную цепь . Еще в г. Их возражения основывались на том, что заряженные полипептиды в отсутствии соли имеют относительно вытянутые структуры, что хорошо известно из вискозометрических исследований, и они не могут быть представлены неупорядоченным и случайным набором конформаций благодаря сильному расталкиванию зарядов. Как характер спектров КД этих полипептидов, так и их поведение при изменении условий среды показывают полную идентичность со спектрами КД и поведением полипролина II и коллагена, обладающих конформацией вытянутой левосторонней спирали I или x по терминологии Тиффани и Кримм , . Проведенные конформационные расчеты ,2б для установления структуры заряженных полипептидов показали выгодность конформации типа вытянутой левосторонней спирали. Однако, наличие даже небольшого количества дефектов приводит к тому, что гидродинамически полипептиды с конформацией ВЛС ведут себя как клубкообразные, хотя большая часть полипептидных звеньев имеет конформацию ВЛС. СаС , и некоторые глобулярные белки при различных условиях , . Спектры КД таких систем отличаются от таковых для заряженных полипептидов они характеризуются одной широкой и слабой отрицательной полосой КД в районе 0 нм. В обзоре справедливо отмечается, что традиционное разложение спектров КД на три компонента вклад оС спирали, структуры и остаточный вклад, приписываемый неупорядоченным структурам, не является вполне адекватным и нуждается в доработке и уточнении. ЗЗЗб . Из конформационных расчетов, учитывающих невалентные и электростатические взаимодействия, ясно, что минимумы энергии приходятся на области трех регулярных структур о спирали, складчатой структуры и вытянутой левосторонней спирали . С химотрипсина, карбоксипептидазы А, рибонуклеази 5 и инсулина. Шло показано, что распределение звеньев по конформациям имеет три пика, соответствующие о спирали, структуре и конформации ВЛС 6 спирали, по терминологии авторов З .