Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В

• Автор: Чуланов, Владимир Петрович
• Шифр специальности: 14.02.02
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 276 с. : 104 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Гепатит А: общая характеристика и генетическая классификация вируса, клинико-эпидемиологические особенности инфекции

1.1.1. Строение вириона и организация генома вируса гепатита А

1.1.2. Современные особенности эпидемиологии гепатита А

1.1.3. Генетическая гетерогенность популяции вируса гепатита А

1.1.4. Определение генетических характеристик вируса гепатита А

в эпидемиологических исследованиях

1.1.5. Клиническое значение генетического разнообразия вируса гепатита А
1.2. Современные представления о гепатите В: строение и генетическое разнообразие вируса, распространенность и клиническое значение его генетических вариантов
1.2.1. Строение и свойства вируса гепатита В
1.2.2. Эпидемиология острой и хронических форм гепатита В
1.2.3. Генетическое разнообразие вируса гепатита В и его эпидемиологическое значение
1.2.4. Клиническое значение генетических вариантов вируса гепатита В
1.3. Методические подходы к изучению генетической гетерогенности вирусов гепатита АиВ
Глава 2. Материалы и методы исследования

2.1. Характеристика групп больных и образцов биологического материала, включенных в исследование
2.2. Общеклинические методы исследования
2.3. Иммунохимические методы исследования
2.4. Молекулярно-биологические методы исследования
2.4.1. Выделение вирусных РНК и ДНК
2.4.2. Обратная транскрипция и ПЦР-амплификация
2.4.3. Электрофоретический анализ
2.4.4. Субтипирование изолятов вируса гепатита А
2.4.5. Генотипирование и субгенотипирование изолятов вируса гепатита В
2.4.6. Секвенирование фрагментов геномов вирусов гепатита А и В
2.5. Определение серотипов вируса гепатита В
2.6. Филогенетический анализ генетических последовательностей вирусов гепатита АиВ
2.7. Инструментальные методы исследования
2.8. Статистический анализ данных, полученных в ходе исследования
Глава 3. Современные особенности эпидемического процесса вирусных гепатитов А и В и система эпидемиологического надзора за данными инфекциями в РФ
3.1. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита А в РФ
3.2. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита В в РФ
3.3. Система эпидемиологического надзора за гепатитами А и В в РФ

Глава 4. Распространенность генотипов и субтипов вируса
гепатита А на территории РФ и ряда стран СНГ
4.1. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории РФ
4.2. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории Украины, Таджикистана и Кыргызстана
4.3. Закономерности географической кластеризации штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
4.3.1. Оптимизация методического подхода к идентификации штаммов вируса гепатита А
4.3.2. Филогенетический анализ штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ
4.3.3. Особенности географической кластеризации штаммов
вируса гепатита А, относящихся к субтипам 1А и ША
4.4. Оценка степени генетической гетерогенности штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
Глава 5. Молекулярно-генетические особенности вспышек
гепатита А на территории РФ
5.1. Вспышка гепатита А в Тверской области в 2005 г
5.2. Вспышка гепатита А в г. Нижнем Новгороде в 2005 г
5.3. Вспышки гепатита А в г. Северодвинске (август-сентябрь 2006 г.)
и г. Коряжме (октябрь 2006 г.) Архангельской области
5.4. Вспышки гепатита А в г. Осинники, г. Калтане, г. Междуреченске
и г. Новокузнецке Кемеровской области (август-декабрь 2006 г.)
5.5. Вспышки гепатита А в г. Углегорске (август-ноябрь 2006 г.), г. Южно-Сахалинске и г. Аниве (сентябрь 2007 г.)
Сахалинской области

(рисунок 1.3). Другая цепь (минус-цепь) более короткая и вариабельна по длине [13, 148, 269,356,357].
В геноме ВГВ идентифицировано два энхансера (гена-усилителя). Энхансер-1 является тканеспецифичным и эффективно функционирует только в гепатоците. В структуре энхансера-1 обнаружен элемент, регулируемый ретиноевой кислотой, что, возможно, свидетельствует об участии ретиноевой кислоты в специфической для гепатоцита регуляции экспрессии генов ВГВ. Энхансер-1 стимулирует транскрипционную активность промотора 8-гена [354, 356,357].
Рисунок 1.3. Структура генома ВГВ.
Внутренняя кольцевая структура -частично двухцепочечная кольцевая ДНК. Показаны положения прямых повторов (ЭШ, ОЯ2) и энханцеров (ЕШ1, ЕЫН2). Различными цветами обозначены открытые рамки считывания: 1 - поверхностный антиген (НВзА§); 2 - терминальный белок (ТР), полимераза, обратная транскриптаза (КТ), РНКаза Н; 3 - НВсАе, НВеАе; 4 -белок X [269, 356].
Идентифицировано четыре типа мРНК-транскриптов. Самый длинный из них (3500 нуклеиновых оснований) является матрицей как для репликации генома, так и для синтеза пре-Соге/Соге-белка и полимеразы. Транскрипт длиной 2400 нуклеиновых оснований кодирует пре-81, пре-Б2 белки и HBsAg, тогда как транскрипт длиной 2100 нуклеиновых оснований кодирует только пре-82-белок и