Роль молекулярно-генетических маркеров в определении тактики хирургического лечения больных раком желудка

• Автор: Быков, Игорь Игоревич
• Шифр специальности: 14.01.17
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 151 с. : 9 ил.

Список сокращений bFCF - основной фактор роста фибробластов.
CDH1 - ген, кодирующий Е-кадхерин, прямой посредник взаимодействий межклеточной адгезии.
Ch к- семейство киназ, активируемых повреждением ДНК.
PTGS2 - ген, кодирующий циоклооксигеназу-2.
DAP К - ген, кодирующий белковую киназу, обеспечивающую апоптоз.
EGF - эпидермальный фактор рос та.
EGFR - рецептор эпидермального фактора роста.
Fas - поверхностный рецептор смерти клетки.
HER-2 (с-егЬВ2) - рецептор семейства EGFR (рецептора эпидермального фактора роста), подсемейства тирозинкипазных рецепторов. hTERT - ген, кодирующий теломеразу.
LOH - потеря гетерозиготнос'іи (ПГ).
MLH1 - ген-супрессор, кодирует фактор, участвующий в репарации неспаренных оснований нуклеотидов.
ММР7 -матриксная металлопротеиназа 7, матрилизии.
ММР9 -матриксная металлопротеиназа 9, желатиназа В.
N33 - ген-супрессор, с высоким уровнем метилирования в эпителиальных опухолях.
ТР53 - ген, кодирующий транскрипционный фактор р53.
PD-ECGF - тромбоцитарный эндотелиальный фактор роста.
PTGS2 - ген, кодирующий циклооксигепазу 2.
PINXT - теломер-повіоряющийся связывающий фактор связывающего протеина.
POTt - белок, связывающий концы теломер.
RASSF1A - ген-супрессор, кодирует фактор, контролирующий клеточный цикл.
Sur (survivin, сурвивин) - эндогенный белок, относящийся к семейству белков-ингибиторов апоптоза.
BIRC5 - ген, кодирующий сурвивип
TIMP - тканевой ингибитор металлопротеиназы.
VEGF - сосудистый эндотелиальный фактор роста.
АРС - ген наследственного полипоза толстой кишки.
ВОЗ - всемирная организация здравоохранения.
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота.
E2F - семейство транскрипционных факторов.
K-ras - один из семейства белков ras, которые регулируют различные аспекты клеточной пролиферации, дифференцировки и морфологии, являются протоопкогепами.
ПЦР - полимеразная цепная реакция.
РНК - рибонуклеиновая кислота.
РЭА-раковый эмбриональный антиген.
СА-19-9 гликолипид, обнаруживаемый в фетальном эпителии поджелудочной железы, желудка, печени, тонкой, толстой кишки и лёгких. СА-72-4 - муциноподобный опухоль ассоциированный антиген
метастазирующих опухолевых клеток.
ЖКБ -желчнокаменная болезнь.
ЖКТ - желудочно кишечный тракт.
Hpall - рестрикционная эндонуклеаза.
TRAP - telomeric repeal amplification protocol.
МЧ-ПЦР - метил-чувствительиая полимеразная цепная реакция.
PV+- положительная предиктивная оценка.
PV"- отрицательная предиктивная оценка.
ОППР - отношение правдоподобия положительного результата.
ОПОР - отношение правдоподобия отрицательного результата, ошдт - отношение шансов диагностического теста.
ИМген - индекс метилирования генов.
ИМобр - индекс метилирования образцов.
АТ - активность теломеразы.

приводит к транзиции и последующему изменению строения и функции белка.
В то же время сочетано с гипометилированием генома происходит аномальное метилирование Срв-островков в промоторных районах генов, участвующих в регуляции клеточного цикла, что приводит к их полной инактивации. К ним также относятся гены, участвующие в апоптозе, ангиогенезе, дифференцировке, репарации ДНК, метастазировании, передаче сигнала, детоксикации, лекарственной резистентное 1 и и др. Таким образом, при отсутствии каких-либо сфуктурных изменений нуклеотидной последовательности гена, он полностью теряет свою активность.
Исследования эпигенетической регуляции экспрессии генов в последнее время приобрели большое значение, причем, как научное, так и практическое. Метилирование может выступать в качестве и как первого, и как второго удара, приводящего к последующей инактивации гена по теории Кнадсена. Для некоторых генов было показано, что именно метилирование как одного, так и обоих аллелей является причиной развития опухоли.
В связи с этим определение метилирования генов, одной из функций которых может быть регуляция клеточного цикла в образцах различных опухолей, является необходимым компонентом характеристики гена, а также обязательным условием ДНК-диагностики при определенном заболевании. Исследования эпигенетических механизмов регуляции экспрессии генов уже позволили в,ряде случаев установить причины инактивации определенных генов в опухолях. Аномальное метилировапие/деметилировапие может служить диагностическим и прогностическим маркером, а также позволяет дифференцировать определенные типы опухолей. Характеристика профиля метилирования генов в различных тканях и типах опухолей вносит существенный вклад в понимание процессов дифференцировки тканей и канцерогенеза. Методические подходы, описанные выше, позволяют проводить такой экспресс-анализ и в операционном материале опухоли, и в