Анализ экспрессии генов при пролиферативных заболеваниях молочной железы.

• Автор: Троценко, Иван Дмитриевич
• Шифр специальности: 14.01.12
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 120 с. : 11 ил.

Оглавление
Список сокращений
Актуальность темы
1. Анализ факторов прогноза при раке молочной железы
1.1 "Классические" факторы прогноза
1.2 Молекулярно-биологическая классификация рака молочной железы
1.3 Изменение экспрессии генов при раке молочной железы
1.3.1 Изменение экспрессии некоторых генов адгезии и миграции при пролиферативных заболеваниях МЖ
1.3.2 Изменение экспрессии некоторых генов пролиферации и
дифференцировки при пролиферативных заболевания МЖ
1.3.3 Изменение экспрессии некоторых генов, участующих в реакциях метаболизма стероидных гормонов
1.3.4 Изменение эксперссии некоторых генов супрессоров/активаторов опухолевого роста и регуляторы клеточного цикла
1.3.5 Изменение экспрессии некоторых генов при активации ангиогенеза
1.4 Профили экспрессии генов как прогностический маркер РМЖ
1.4.1 Системы определения профиля экспрессии генов на основе ОТ-ПЦР
1.4.2 Системы определения профиля экспрессии генов на основе технологии микрочипов
1.5 Заключение
2. Материалы и методы
2.1 Клиническая характеристика исследуемых групп, описание используемых диагностических методов
2.2 Клинико-морфологическая характеристика исследуемых групп
2.3 Методика пробоподготовки и ОТ-ПЦР в настоящем исследовании
2.4 Краткая характеристика исследуемых генов
3. Результаты исследования
3.1 Анализ изменения экспрессии генов в зависимости от типа ткани
3.1.1 Сравнение морфологически неизмененной ткани (МНТ) и ткани рака молочной железы (РМЖ)
3.1.2 Анализ изменения экспрессии генов в ткани фиброаденомы молочной железы
3.1.3 Сравнение экспрессии генов в ткани фиброаденомы и рака молочной железы
3.1.4 Сравнение экспрессии генов в морфологически неизмененной ткани при фиброаденоме и морфологически неизмененной ткани при раке молочной железы
3.2. Анализ экспрессии генов в зависимости от морфологических характеристик ткани в образцах рака молочной железы
3.2.1 Анализ экспрессии генов в зависимости от размеров опухоли
3.2.2 Анализ экспрессии генов в зависимости от наличия метастатических лимфоузлов и отдаленных метастазов (категория N и М по классификации ТОМ)
3.2.3 Анализ экспрессии генов в ткани РМЖ в зависимости от степени злокачественности, морфологии опухоли, статуса рецепторов стероидных гормонов и эпидермального фактора роста НЕ112/пеи
3.3 Анализ экспрессии генов в морфологически неизмененной ткани в зависимости от экспрессии рецепторов стероидных гормонов и эпидермального фактора роста НЕ112/пеи в образцах рака молочной железы по данным иммуногистохимического исследования
3.4 Анализ экспрессии генов маркеров пролиферации и апоптоза в зависимости
от направления изменения экспрессии гена рецепторов прогестерона
4. Обсуждение
Выводы
Практические рекомендации
Список литературы

Список сокращений
ИГХ - иммуногистохимическое исследование мнт - морфологически неизмененная ткань мРНК - матричная РНК
ОТ-ПЦР - полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией РМЖ - инвазивный рак молочной железы РП - белок-рецептор прогестерона РЭ - белок-рецептор эстрогена ФА - фиброаденома
o.e. - относительные единицы экспрессии

Tl-2, N-0, ER+, ER-. В двух исследованиях была подтверждена
прогностическая точность данного профиля: 96% вероятность
безметастатической пяти- и 94% 10-летней выживаемости для группы благоприятного прогноза; 74% и 65% для группы неблагоприятного прогноза [76]. Второе исследование полностью подтвердило результаты первого [56].
Впервые сообщение о создании профиля экспрессии 70 прогностических генов было опубликовано Laura J. van Ч Veer в Nature в 2002 году [127]. MammaPrint®, разработанный на основе этого исследования, внедрен в коммерческое производство Agendia, на базе которой выполняется коммерческое тестирование. Тест основан на определении профиля экспрессии 70 генов, описанного van't Veer в 2002 году [193] и используется для определения прогноза рецидива РМЖ у больных < 61 года с первично выявленным инвазивным РМЖ ЕР+, ЕР-, N0. Следует отметить, что материальной основой данной платформы является технология создания микрочипов, отличающаяся от используемой в Oncotype DX ОТ-ГЩР. Хотя последняя признана более точной в отношении определения экспрессии генов, технология микрочипов дает информацию по экспрессии значительно болыпемго количества генов [143, 157, 194, 197]. В таблице 1.5 представлены основные характеристики платформы MammaPrint®.
Таблица 1.5. Основные характеристики MammaPrint®.
Основная информация о чипе Определяемые гены
Микрочип: MammaPrint®, Agendia Гены нормализации: -1
Образец опухоли: свежее замороженные срезы 70 генетических сигнатур включют следующие категории: 1. ены сигнальных каскадов, факторов роста, транскрипции: = 20 2. онтроль клеточного цикла, хроматин,
Техника производства чипа: 2 цветных микрочипа (Agilent Technologies)