Генетическая вариабельность локуса миотонинпротеинкиназы в якутской популяции

• Автор: Степанова, Светлана Кимовна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2015
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 157 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Оглавление Список сокращений ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1Л. Динамические мутации. Молекулярный механизм развития динамических мутаций

1.2. Мышечные дистрофии

1.2.1. Миотоническая дистрофия 1 типа

1.2.2. Миотоническая дистрофия 2 типа

1.2.3. Миотоническая дистрофия 3 типа

1.2.4. Популяционные исследования миотонической дистрофии

1.2.5. Молекулярно-генетические исследования гена мышечной протеинкиназы (DMPK)

1.2.6. Исследование полиморфизма гена мышечной протеинкиназы

1.2.7. CTG - повторы в гене мышечной протеинкиназы
1.3. Этногенез популяций Северной Евразии ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Клинико-генеалогическая характеристика больных и их родственников из обследованных семей
2.2. Характеристика исследованных популяционных выборок
2.3. Молекулярно-генетические методы исследования
2.3.1. Выделение ДНК из лейкоцитов крови
2.3.2. Анализ участка CTG-повторов в гене DMPK
2.3.3. Детекция полиморфных вариантов по шести SNP-маркерам.
2.3.4. Анализ CTG- повторов
2.3.5. Анализ микросателлитных маркеров в локусе DMPK
2.4. Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 7
ЗЛ. Популяционно-генетический анализ вариабельности БИР и СТС-
повторов в гене ОМРК в популяциях Северной Евразии.
3.1.1. Генетическая вариабельность однонуклеотидных полиморфных вариантов в гене ОМРК в шести популяциях Северной Евразии.
3.1.2. Анализ вариабельности СТС-повторов в гене ОМРК в шести популяциях Северной Евразии.
3.2. Характеристика генетической вариабельности локуса ОМРКу
больных миотонической дистрофией и в якутской популяции.
3.2.1. Анализ распределения частот БКР-аллелей и генотипов в локусе ОМРК в якутских выборках.
3.2.2. Структура 8ЫР-гаплотипов в гене ОМРК в якутских выборках
3.2.3. Структура БТЯ-гаплотипов в гене ОМРК в якутских выборках
3.3 Оценка возраста мутации в гене ОМРК и популяционногенетический механизм накопления МД в якутской популяции.
Заключение
Выводы
Список литературы
Приложения
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АР - аутосомно-рецессивный
АД - аутосомно-доминантный
АФ - аутосомно-рецессивная атаксия Фридрейха
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
МГК - медико-генстическая консультация
М3 - мультифакториальные заболевания
НИИ МГ — научно-исследовательский институт медицинской генетики
НБНС — наследственные болезни нервной системы
ПААГ — полиакриламидный гель
ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
ПЦР — полимеразная цепная реакция
РБ №1 - - Республиканская больница №1 - Национальный центр
НЦМ медицины
PC (Я) - Республика Саха (Якутия)
СО РАМН - Сибирское отделение Российской академии медицинских наук
СЦА 1 типа — спиноцеребеллярная атаксия l-ro типа
ТН - тип наследования
ШМТ 1 типа - невральной амиотрофии Шарко-Мари-Тус 1 типа
ХГ - хорея Гентингтона
ЭКГ - электрокардиограмма
ЭМГ - электромиография
ФГБУ - Федеральное государственное бюджетное учреждение
ЭЭГ - электроэнцефалограмма
ЯНЦ«КМП» - Якутский научный центр Комплексных медицинских проблем СО РАМН - Сибирское отделение Российской академии медицинских наук
3-М - аббревиатура фамилий 3 авторов (Марвелл, Малвакс и
МакКьюсик), впервые описавших синдром, получивший их имя AMOVA - analysis of molecular variance, анализ молекулярной дисперсии

височной деменции. Атрофия и выраженная слабость мышц плечевого пояса и экстензоров шеи приводит к развитию симптома «головы тряпичной куклы». Для МД 3 типа поражение сердечной мускулатуры и нарушения сердечного ритма не характерны (Шнайдер, 2007).
Основные сведения о трёх описанных типах миотонической дистрофии суммированы в табл. 4.
Таблица
Сравнительные характеристики трёх типов миотонической дистрофии
МД 1 МД 2 мдз
Хромосомный локус 19ц13.3 3Ч21.3 15ц21-я
Ген ОМРК ШЮ Регион между Э15Б970 и 0158
Наследование Аутосомно- доминантное Аутосомно- доминантное Аутосомно- доминантное
Мутация Экспансия СТС-повторов Экспансия ССТС-повгоров -
Число повторов в норме до 37 СТС до 27 ССТС -
Премутация 37-50 СТС 27-75 ССТС -
Мутация 50-4000 СТС 75- 11000 ССТС -
1.2.4. Популяционные исследования миотонической дистрофии
Изолированная популяция, если она не исчезает в ходе истории, образно говоря, развертывается в «самое себя», поддерживая динамическое равновесие с окружающей средой. Наличие этой генетической «памяти» в системе -важное условие ее стабильности и одновременно свидетельство сохранения исторически сложившейся внутренней структуры (Алтухов, Рычков, 1970). Считают, что при проведении работ по картированию различных заболеваний человека, предпочтение следует отдавать изолированным популяциям (веРбеИ