Молекулярно-генетические предикторы репродуктивных потерь

• Автор: Машкина, Елена Владимировна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Белгород
• Количество страниц: 204 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

Перечень использованных сокращений и терминов

Общая характеристика работы

Глава 1 Обзор литературы

1.1 Анализ генетических факторов, ассоциированных с нарушением развития и инвазии трофобласта

1.2 Цитокины как факторы межклеточной сигнализации в эмбриогенезе

1.3 Процессы тромбообразования и репродуктивные потери

1.4 Генетический контроль метаболизма фолатов и репродуктивные потери

1.5 Система контроля клеточного цикла и репарации ДНК

Г лава 2 Материал и методы исследования

2.1 Материал исследования

2.2 Методы исследования
2.2.1 Методы выделения нуклеиновых кислот из биологического материала
2.2.1.1 Выделение ДНК из биологического материала
2.2.1.2 Выделение РНК из тканей с последующим проведением реакции обратной транскрипции
2.2.2 Анализ инфицированное децидуальной и хорионической тканей инфекциями, передающимися половым путем
2.2.3 Анализ полиморфных вариантов генов методом алпель-специфичной ПЦР
2.2.4 Анализ полиморфных вариантов методом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов
2.2.5 Анализ уровня метилированя ДНК методом однонуклеотидной элонгации праймера и методом бисульфитного пиросеквенирования

2.2.6 Определение уровня экспрессии генов в децидуальной и хорионической тканях
2.3 Биоинформационный поиск микро-РНК вокруг генов, вовлеченных в процессы нарушения формирования и развития трофобласта
2.4 Методы статистического анализа
2.5 Контроль качества проводимых молекулярно-генетических исследований
Г лава 3 Анализ частот полиморфных вариантов генов цитокинов в клетках материнского и зародышевого происхождения при невынашивании беременности
3.1 Анализ частот полиморфных вариантов генов цитокинов в клетках материнского происхождения
3.2 Анализ частот полиморфных вариантов генов цитокинов в клетках зародышевого происхождения
Г лава 4 Анализ частот полиморфных вариантов генов фолатного цикла и факторов свертывающей системы крови в тканях материнского и зародышевого происхождения при невынашивании беременности
Г лава 5 Анализ уровня метилирования геномной ДНК в тканях материнского и зародышевого происхождения
Г лава 6 Анализ частот полиморфных вариантов генов системы контроля клеточного цикла и репарации ДНК в клетках материнского и зародышевого происхождения
Г лава 7 Анализ межгенных взаимодействий генов-кандидатов, ассоциированных с репродуктивными потерями
Глава 8 Анализ уровня экспрессии индуцируемого гипоксией фактора Н1Г-1а в клетках материнского и зародышевого происхождения
Г лава 9 Анализ уровня экспрессии генов цитокинов в клетках материнского и зародышевого происхождения
Глава 10 Анализ уровня экспрессии генов системы контроля клеточ-

ного цикла и репарации ДНК
Глава 11 Поиск мотивов, гомологичных микро-РНК, как таргетных мишеней
Главам 12 Модель взаимодействия молекулярно-генетических предикторов при невынашивании беременности
Заключение
Выводы
Практические рекомендации
Список использованных источников
Приложение

ся высокий прокоагуляционный потенциал свертывающей системы крови. Роль генетических факторов в развитии предрасположенности к тромбооб-разованию показана в ряде исследований (Макацария А.Д., 2004; ЧулковВ.С. и др., 2010; Долгушина В.Ф., Вереина Н.К., 2011).
Наиболее изученными генетическими факторами, ассоциированными с повышенным риском развития тромбозов, являются полиморфные варианты следующих генов: факторов свертывания F2, F5 и F7, ингибитора активатора плазминогена (SERPINE1), (3-цепи фибриногена (FGB), фолатного цикла (метил ентетрагидрофолат-редуктазы (MTHFR), метионин-синтазы редуктазы (MTRR), метионин-синтазы (MTR)). Наличие в одном генотипе нескольких аллельных вариантов, предрасполагающих к гиперкоагуляции, повышает риск возможного развития тромбозов (Капустин С.П. и др., 2003; Шевела А. и др., 2007).
Ингибитор активатора плазминогена-1 (PAI-1, SERPINE1) - один из основных компонентов антикоагуляционной системы крови (Attia J. et al.,
2007). При повышении его концентрации снижается активность противо-свертывающей системы, что увеличивает риск развития тромбозов.
В промоторном участке гена SERPINE1 выявлен полиморфный сайт, который может содержать четыре или пять оснований гуанина. Наличие 4G обуславливает повышение уровня экспрессии гена, что ассоциировано с высоким риском тромбообразования, развитием преэклампсии, спонтанным прерыванием беременности на ранних сроках (Ivanov P. et al., 2010; Jessie А. et al., 2013). По некоторым данным литературы среди женщин с невынашиванием беременности гомозиготы по аллели 4G гена SERPINE1 составляют до 82-85% (Ciacci С. et al., 2009).
Фибриноген является гликопротеином с молекулярной массой 340 кДа,
состоящим из трех полипептидных цепей, соединяющихся дисульфидными
мостиками. Эти три полипептида кодируются тремя генами, кластер которых
размером около 70 т.п.н. находится на длинном плече хромосомы 4. Ген FGB
кодирует Р-цепь фибриногена. Выявлен ряд полиморфных вариантов генов