Исследование молекулярно-генетических основ атопического дерматита

• Автор: Гималова, Галия Фуатовна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 175 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Этиология и патогенез атопического дерматита

1.2. Гены предрасположенности к атопическому дерматиту

1.2.1 Гены цитокинов

1.2.2 Гены, участвующие в формировании эпидермального

барьера

1.2.3 Г ены образ-распознающих рецепторов

1.3. Межгенные и ген-средовые взаимодействия

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Материалы исследования
2.2.Методы исследования
2.2.1. Выделение геномной ДНК
2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК
2.2.3. Рестрикционный анализ
2.2.4. Метод электрофореза
2.2.5. SSCP-анализ
2.2.6. Генотипирование полиморфных локусов с использованием системы OpenArray SNP Genotyping System
2.2.7. Статистическая обработка полученных результатов
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Анализ мутаций и полиморфных вариантов генов, участвующих в
формировании эпидермального барьера, у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.1.1. Анализ мутаций в гене филаггрина у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.1.2. Мета-анализ результатов исследования мутаций гена филаггрина
3.1.3. Анализ полиморфных вариантов гена SPINK5 у больных

атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.2.Исследование полиморфных локусов генов образ-распознающих рецепторов и генов CllorßO и LRRC32 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.2.1. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов образ-распознающих рецепторов и генов CllorßO и LRRC32 с развитием атопического дерматита
3.2.2. Анализ ассоциации гаплотипов полиморфных локусов генов образ-распознающих рецепторов, локализованных в области 4р14, с атопическим дерматитом
3.2.3. Мета-анализ результатов исследования полиморфных вариантов генов образ-распознающих рецепторов и генов CllorßO ULRRC
3.3.Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов цитокинов с атопическим дерматитом в Республике Башкортостан
3.3.1. Анализ полиморфного локуса rs2243250 гена 1L4 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.3.2. Анализ полиморфного локуса rsl800872 гена IL10 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.3.3. Анализ полиморфного локуса rs20541 гена 1L13 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.3.4. Анализ полиморфного локуса rsl805010 гена IL4R у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.3.5. Анализ полиморфного локуса rs17809012 гена CCL11 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.3.6. Анализ полиморфного локуса rsl800629 гена TNFA у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе
3.4.Анализ полиморфных локусов, выявленных при полногеномных исследованиях, у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе

3.5.Исследование роли межгенных взаимодействий в формировании
предрасположенности к атопическому дерматиту
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

(Novak et al., 2007), в связи с чем его роль в развитии заболевания остается неясной и требует дальнейшего изучения.
Ген толл-подобного рецептора 4 (TLR4) локализован в области 9q32-q33 и кодирует белок из 841 аминокислоты. Лигандами TLR4 являются бактериальные липополисахариды (LPS). Предполагается, что воздействие их в детстве обладает защитным эффектом в отношении развития аллергии. Взаимодействуя с липополисахаридами, TLR4 запускает каскад воспалительных реакций ТЬ2-пути. В ряде работ выявлена ассоциация полиморфных локусов данного гена с развитием аллергических заболеваний. В частности, в исследовании детей, больных БА, из Швеции выявлен протективный эффект ОНП rs4986790 (p.Asp299Gly) гена TLR4 на развитие астмы (Fageras Böttcher et al., 2004).
Ген толл-подобного рецептора б (TLR6) локализован на хромосоме 4р13, представлен одним экзоном и кодирует белок длиной в 796 аминокислот, на 69% гомологичный TLR1. Взаимодействие TLR6 с лигандамим (диациллипопептиды микоплазмы) приводит к активации факторов транскрипции NF-кВ и JNK. Экспрессия TLR6 показана в тучных клетках, которые играют важную роль в развитии аллергического воспаления. Активация тучных клеток посредством TLR4 или гетеродимера TLR2/TLR6 оказывает дополнительный эффект на продукцию цитокинов (Duez et al., 2006). Kormann и др. обнаружили, что функционально значимые варианты TLR1 и TLR6 обладают протективным эффектом на развитие аллергической формы БА у больных немецкого происхождения (Kormann et al., 2008). Полиморфный вариант rs2381289 гена TLR6 ассоциирован с развитием астмы и AP (Qian et al., 2010). Исследования полиморфного локуса rs5743810 (p.Ser249Pro) гена TLR6 не выявили ассоциацию с развитием АД, но обнаружили слабую ассоциацию с развитием детской астмы (Hoffjan et al., 2005).
Ген толл-подобного рецептора 9 (TLR9) картирован на коротком плече 3 хромосомы в области 21.3. Данный ген состоит из 4-х экзонов и кодирует последовательность из 1032 аминокислот. TLR9 локализован в мембране эндосом. Данный рецептор распознает неметилированную бактериальную и вирусную