Изучение генотипов днк-маркеров GH, DGAT1 и TG5 в связи с линейной принадлежностью и уровнем молочной продуктивности коров черно-пестрой породы

• Автор: Харзинова, Вероника Руслановна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Дубровицы
• Количество страниц: 115 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

1. ВВЕДЕНИЕ

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1. Маркер - зависимая селекция ^ ^

2.1.1. Генетические маркеры (ДНК-маркеры)

2.1.1.1. ДНК-маркеры, основанные на анализе

рестрикционного полиморфизма

2.1.1.2. ДНК-маркеры, основанные на полимеразной

цепной реакции
2.1.1.3. ДНК-маркеры, основанные на полимеразной цепной
реакции с праймерами, имеющие множественную локализацию в геноме.
2.1.2. Гены-кандидаты
2.2. ДНК-маркеры признаков продуктивности
2.2.1. Ген гормона роста (Bovine growth hormone, GH)
2.2.2. Ген диацилглицерол О-ацилтрансферазы
l(Diacylglycerol O-Acyltransferase 1, DGAT1)
2.2.3. Ген тиреоглобулина (Thyroglobulin, TG5)
2.3. Обзор молекулярных методов, используемых в
геномном анализе.

2.3.1. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР,
Polymerase chain reaction, PCR) и ее модификации.
2.3.2. Ферментативные методы
2.3.3. Методы детекции на твердой фазе
2.3.4. Физические методы
2.4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Объекты и материалы исследований
3.2. Методы исследований
4. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
4.1. Анализ показателей молочной продуктивности 52 изучаемой выборки коров черно-пестрой породы ФГУП «Кленово-Чегодаево»
4.2. Распределение частот встречаемости генотипов и 62 аллелей Д11К - маркеров 011, ООА'П и ТС5 у коров черно-пестрой породы
4.3. Генетическая структура коров различных 64 генеалогических линий по ДНК - маркерам ОН, ООАТ1 и Т
4.3.1. Аллельные профили коров различных 64 генеалогических линий по изучаемым ДНК-маркерам
4.3.2. Анализ уровня гетерозиготности популяции по 67 изучаемым ДНК - маркерам

4.3.3. Характеристика генетических связей между линиями
коров по изучаемым ДНК - маркерам
4.4. Изучение влияния генотипов коров по ДНК -
маркерам на показатели молочной продуктивности
4.4.1. Молочная продуктивность коров с различными
генотипами по ОН
4.4.2. Молочная продуктивность коров с различными
генотипами по ООАТ
4.4.3. Молочная продуктивность коров с различными
генотипами по Т
4.4.4. Влияние мультилокусных генотипов по ОН, ООАТ1 и
Т05 на показатели молочной продуктивности коров различных генеалогических линий
5. ОБСУЖДЕНИЕ
6. ВЫВОДЫ
7. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
8. СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

Прямая терминация ПЦР
ПЦР проводится по стандартной схеме, но один из
дезоксинуклеозидтрифосфатов (dNTP) берётся в лимитирующей
концентрации (Chen and Hebert, 1998). Это приводит к тому, что после нескольких циклов синтез ДНК обрывается в позициях, соответствующих
лимитирующему нуклеотиду. В результате, с каждого праймера
синтезируется набор фрагментов разной длины. Метод прост в исполнении и более нагляден, но для детекции SNP не очень удобен, так как требует подбора условий ПЦР для каждого локуса.
Аллель - специфическая ПЦР
Аллельные варианты различаются за счёт того, что 3' концевой нуклеотид одного из праймеров гибридизуется непосредственно с позицией SNP (Kwok et al., 1990.). Ещё один способ повышения специфичности -проведение в той же пробирке конкурирующей ПЦР реакции (Zhu et al., 1996; Sasvari-Szekely et al., 2000).
Существующие подходы к детекции аллельных вариантов можно условно разделить на несколько групп {Табл. 4).
Таблица
Различные подходы к идентификации генетических изменений
Ферментативные подходы полиморфизм длин рестрикционных фрагментов (RFLP)
расщепление Clevase I (CFLP)
анализы, основанные на лигазной реакции (LDR, LCR, Padlock)
полиморфизм длин аплифицированных фрагментов (AFLP) расщепление резольвазой (EMD)
случайная амплификация полиморфной ДНК (RAPD, AP-PCR)
аллель-специфический ПЦР (AS-PCR)
Химические методы химическое расщепление гетеродуплексов
химическое лигирование