Роль генетических факторов в формировании дыхательных нарушений у новорожденных

• Автор: Хамидуллина, Лилия Ильдаровна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 138 с. : 20 ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Эпидемиология и факторы риска развития дыхательных нарушений у новорожденных (РДС и врожденная пневмония)
1.2 Роль сурфактантной системы в формировании дыхательных нарушений у новорожденных

1.3 Генетические факторы формирования дыхательных нарушений

у новорожденных

1.3.1 Белки сурфактанта 8Р-В и БР-О

1.4 Окислительный стресс и дыхательная система новорожденных

1.4.1 Гены ферментов микросомалъной монооксигеназной системы

1.4.2 Гены ферментов антиоксидантой защиты
1.5 Клинико-диагностические и прогностические аспекты развития РДС
ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Объект исследования
2.2 Молекулярно-генетические методы исследования
2.2.1 Выделение ДНК и условия проведении полгтеразной цепной 48 реакции синтеза ДНК, рестрикционного анализа
2.3 Методы статистического анализа
ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Сравнительная характеристика группы новорожденных с дыхательными нарушениями и группы здоровых новорожденных
3.2. Клиническая характеристика новорожденных в зависимости от нозологических форм дыхательных нарушений
3.3 Анализ полиморфных вариантов генов белков сурфактанта с дыхательными нарушениями у новорожденных

3.3.1 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного VNTR- локуса интрона 4 гена SFTPB в группах больных с ДН и 75 контрольной группе
3.3.2 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов ThrllMet и Alal60Thr гена SFTPD в группах больных с ДР1 и 79 контрольной группе
3.4 Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов ферментов микросомальной монооксигеназной системы и антиоксидантной защиты с заболеваниями органов дыхания у новорожденных
3.4.1 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов A2455G и T3S01C гена CYP1A1 в группах больных с ДН и контрольной группе
3.4.2 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов С-163А и T-2467delT гена CYP1A2 в группах больных с ДН и контрольной группе
3.4.3 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов С-262Т и С1167Тгена CAT в группах больных сДН и контрольной группе
3.4.4 Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов Не 105 Val и Alai 14Val гена GSTP1 в группах больных сДНи контрольной группе
3.4.5 Анализ делеционного полиморфного локуса гена GSTM1 в группах больных с ДН и контрольной группе
ГЛАВА 4 РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА ОЦЕНКИ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ НОВОРОЖДЕННЫХ К РАЗЛИЧНЫМ ФОРМАМ ДЫХАТЕЛЬНЫХ НАРУШЕНИЙ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АФК - активные формы кислорода
БЛД - бронхолегочная дисплазия
ВЖК - внутрижелудочкоые кровоизлияния
ВПн - врожденная пневмония
ДН - дыхательные нарушения
ИВЛ - искусственная вентиляция легких
мРНК - митохондриальная рибонуклеиновая кислота
ПДРФ - полиморфизм длины рестрикционных фрагментов
п.н. - пар нуклео тидов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РДС - респираторный дистресс-синдром
CAT - ген каталазы
СРАР - continuous positive airway pressure (постоянное положительное
давление в дыхательных путях)
CYP1A1 - ген цитохрома Р45 О 1А1
CYP1A2 - ген цитохрома Р450 1А2
GSTM1 - ген глутатион-Б-трансферазы класса мю
GSTP1 - ген глутатион-Б-трансферазы класса пи
GSTs - глутатион-Б-трансферазы
OR - odd ratio (отношение шансов)
SFTPB - ген белка сурфактанта В
SFTPD - ген белка сурфактанта D
SPB - белок сурфактанта В
SPD - белок сурфактанта D
SNP - single nucleotide polymorphism (однонуклеотидный полиморфизм)
VNTR - variable number tandem repeats (варьирующее число тандемных
повторов)

Ген глутатион-Б-трансферазы класса мю [GSTM] располагается на коротком плече хромосомы 1 на участке 1р13 и представлен пятью генными локусами GSTM1, GSTM2, GSTM3, GSTM4 и GSTM5 [115]. Ген GSTM1 экспрессируется в высокой степени в легких, в печени. В случае делеции участка гена GSTM1 различают 3 аллельные формы: нефункциональный нулевой аллель (делеция 10000 пар нуклеотидов) и 2 аллеля GSTM1*A и GSTM1*B, которые отличаются парой нуклеотидов в 7 экзоне [9]. Доказано, что нулевой аллель гена GSTM1 возник в результате неравного кроссинговера [115]. Установлено значительное превышение частоты гомозигот по делеции гена GSTMI при хроническом бронхите, профессиональном бронхите, туберкулезе, ретровирусной и герпетической инфекции, а также раке легкого [8, 9, 83, 98, 100, 211]. Турецкие учёные Calikoglu М. et al. (2006) показали 12-кратное увеличение риска развития хронической обструктивной болезни лёгких у носителей комбинации GSTM1 ноль, GSTT1 ноль и GSTP1 Val/Val [210]. Однако в исследованиях Корытиной Г.Ф. с соавт. (2009) не было получено достоверных различий между группой больных хронической обструктивной болезнью легких и здоровыми индивидами [1].
Глутатион-в-трансфераза класса пи (GSTP) участвует в детоксикации полициклических ароматических углеводородов, пестицидов и в процессах канцерогенеза [28, 108]. Подсемейство генов GSTP состоит из одного представителя - гена GSTP1, локализованного на 11 хромосоме (llql3), который преимущественно экспрессируется в легких, сердце и плаценте [182]. В респираторном тракте геи GSTP1 предпочтительно экспрессируется в эпителиальных клетках, альвеолярных макрофагах и бронхиолах, составляя 83% от всего пула легочных глутатион-8-трансфераз [112].
Впервые полиморфизм гена GSTP1 был описан в 1990 г. [137]. Транзиция аденина (А) на гуанин (G) в 313 положении в 5 экзоне гена (A313G) приводит к замене изолейцина (Ile) на валин (Val) в 105 положении белка (Ilel05Val). Эта замена затрагивает последовательность ДНК,