Роль хламидий в спонтанной инфекционной патологии обезьян

• Автор: Слободенюк, Владимир Владимирович
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 134 с. : ил.

Оглавление

Список сокращений

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Место хламидийной инфекции в инфекционной патологии животных и че-

ловека. Эпидемиологическая значимость хламидиоза животных как источника и резервуара возбудителя для человека

1.1.1. Роль хламидий в этиологии воспалительных заболеваний человека..

1.1.2. Хламидиозы, животных как возможный источник и резервуар возбудителя хламидийной инфекции человека

1.1.3: Восприимчивость животных к хламидиозу человека

1.2. Методы лабораторной диагностики хламидиоза человека и животных

1.2.1. Общепринятые методы диагностики хламидийной инфекции
1.2.2. Достоинства и недостатки методов диагностики хламидиозов, их ограничения в применении
1.2.3. Подходы к, совершенствованию* методов диагностики; хламидийной инфекции:
1.3. Филогенетическая характеристика хламидий
Глава 2. Материалы и методы исследований
2.1. Материалы исследования
2.1.1. Характеристика обследованных обезьян
2.1.2. Образцы клинического материала
2.1.3. Используемые культуры клеток, среды и реактивы
2.1.4. Штаммьгмикроорганизмов
2.2. Лабораторные методы исследования
2.2.1. Верификация хламидий у обезьян
2.2.1.1. Цитологический метод

2.2.1.2. Серологический метод
2.2.1.3. Культуральный метод
2.2.1.4. Молекулярно-генетические методы
2.2.2. Программное обеспечение в молекулярно-генетическом исследовании хламидий
2.2.3. Секвенирование штаммов хламидий
2.3. Статистическая обработка полученных данных
Глава 3. Результаты собственных исследований
3.1. Установление естественного инфицирования хламидиями обезьян с применением общепринятого в клинической практике комплекса лабораторных методов обследования
3.2. Совершенствование методов верификации хламидий у обезьян
3.2.1. Молекулярно-генетический анализ
3.2.1.1. Комплексная одновременная детекция и идентификация Chlamydophila pneumoniae и Chlamydia trachomatis
3.2.1.2. Повышение диагностической значимости культурального метода
3.2.1.3. Генотипирование хламидий Chlamydia trachomatis
3.2.1.4. Выявление чувствительности к антибиотикам
3.3.Установление филогенетической топографии штаммов хламидий, выделенных от обезьян в семействе Chlamydiaceae
Глава 4. Обсуждение полученных результатов
Выводы
Практические рекомендации
Список литературы

Список сокращений
Ат - антитело.
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота.
ИФА - иммуноферментный анализ.
ЛПС - липополисахарид.
ЛЦР - лигазная цепная реакция.
НИФ - реакция непрямой иммунофлуоресценции.
ПДРФ - полиморфизм длины рестрикционных фрагментов.
ПР - промежуточное тельце.
ПЦР - полимеразная цепная реакция.
РИФ - реакция прямой иммунофлуоресценции.
РНГА - реакция непрямой гемагглютинации.
РНК - рибонуклеиновая кислота. рРНК - рибосомальная РНК.
РСК - реакция связывания комплемента.
РТ - ретикулярное тельце.
УГТ - урогенитальный тракт.
УГХ - урогенитальный хламидиоз.
ЭТ - элементарное тельце.
Ig - иммуноглобулин.
МОМР - (major outer membrane protein) - основной белок наружной мембраны. ORF - (open reading frame) - открытая рамка считывания.

ной> реакции и антропоноза Ch. trachomatis с помощью олигонуклеотидов, ориентированных на эпитопы участка гена отрА [22, 47, 133].
Использование гена отрА для диагностики хламидиозов подвергается критике в виду существования в его нуклеотидной последовательности четырех вариабельных сегментов« (VS 1-4), содержащих подвидо - и геноспецифические антигенные детерминанты.МОМР Ch. trachomatis [123, 142, 169].*
Специфичность, каждого генотипа Ch. trachomatis по вариабельным сегментам требует осторожности при конструировании олигонуклеотидов, так как возможен вариант отсутствия комплементарное с нуклеотидной'последовательностью: Также необходимо учитывать способность хламидий пребывать в процессе цикла развития в стадии атипичных (абберантных) телец, не имеющих МОМР. Отмечено, что образующиеся абберантные формы, хламидий сходны с образующимися при.Ь-трансформации другими бактериями. Они могут образовываться при взаимодействии хламидий с лизосомальными ферментами клетки хозяина, либо в присутствии антибиотиков (пенициллин, ампициллин и др.) [6; 9, 104]. Кроме того, хламидии обладают свойством генетической рекомбинации гена отрА между геновариантами [131]. В результате чего диагностика хламидий по гену отрА может быть крайне не эффективной.
Существует работа, посвященная усовершенствованию диагностики хла-мидийных инфекций в хронической или персистентной форме путем определе-ния: специфических агентов. В данной работе описывается методика определения, хламидийных инфекций в хронической форме путем определения экспрессии генов на уровне белка с помощью ПЦР, что, по мнению авторов, дает понять, в какой фазе цикла развития находится возбудитель [177]. Однако, предложенный метод в клинической диагностике не может найти применения-из-за того, что олигонуклеотиды ориентированы только к определенному эпитопу, экспрессия которого осуществляется в характерную ему фазу цикла развития хламидий, что уменьшает процент детекции возбудителя.