Культивируемые аэробные бактерии из района промышленных разработок Верхнекамского месторождения солей

• Автор: Корсакова, Екатерина Сергеевна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Пермь
• Количество страниц: 151 с. : ил.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Промышленные разработки Верхнекамского месторождения солей
1.2 Экстремофильные микроорганизмы, способные существовать в условиях высокой минерализации среды
1.2.1 Общая характеристика бактерий семейства На1отопас1асеае
1.2.2 Галофильные и галотолерантные бактерии из ризосферы
растений
1.3 Биодеградация моно(поли)ароматических углеводородов
1.3.1 Разложение нафталина бактериями
1.3.2 Разложение сртофталевой кислоты бактериями
1.3.3 Разложение бензойной кислоты бактериями
1.3.4 Галотолерантные и галофильные бактерии-деструкторы стойких
органических загрязнителей
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1 Образцы исследования
2.2 Среды и условия культивирования бактерий
2.3 Методы выделения бактерий
2.4 Определение ростовых характеристик
2.4.1 Рост бактерий на ароматических углеводородах
2.4.2 Рост бактерий при изменении осмолярности среды или
концентрации субстрата
2.5 Разложение ароматических углеводородов бактериями
2.6 Морфологическая и физиолого-биохимическая идентификация
бактерий
2.7 Молекулярно-генетические методы
2.7.1 Подготовка проб ДНК для ПЦР
2.7.2 Амплификация гена 16Б рРНК
2.7.3 Амплификация функциональных генов
2.7.4 Электрофорез амплифицированных фрагментов ДНК
2.7.5 Определение нуклеотидных последовательностей и
филогенетический анализ
2.7.6 ДНК-типирование
2.7.7 Рестрикционный анализ амплифицированных рибосомальных ДНК
2.7.8 Плазмидная ДНК
2.7.9 Денатурирующий градиентный гель электрофорез
2.8 Статистическая обработка результатов
Глава 3. БАКТЕРИИ ИЗ ЗАЛЕЖЕЙ СОЛЕЙ (ВЕРХНЕКАМСКОЕ МЕСТОРОЖДЕНИЕ)
3.1 Бактерии, выделенные из образцов сильвинита и каменной соли (рудник СКПРУ-1, ОАО «Уралкалий», г. Соликамск)
3.2 Микроорганизмы в образце каменной соли, выявленные методом
денатурирующего градиентного гель-электрофореза (ДГГЭ)
Глава 4. БАКТЕРИИ, ВЫДЕЛЕННЫЕ ИЗ ГАЛИТОВЫХ ОТХОДОВ, ГРУНТА, ПОЧВЫ И РАССОЛОСБОРНИКОВ РАЙОНА
СОЛЕРАЗРАБОТОК
4.1 Бактерии, выделенные из галитовых отходов района солеразработок (ОАО «Уралкалий», г. Соликамск)
4.2 Бактерии из образцов грунта, отобранных вблизи солеотвалов Соликамского рудоуправления (ОАО «Уралкалий», г. Соликамск)
4.3 Бактерии, выделенные из образцов воды, соляных отложений со дна рассолосборника (СКПРУ-2, ОАО «Уралкалий», г. Соликамск)
4.4 Бактерии, выделенные из ризосферы растений, произрастающих вблизи солеотвалов (ОАО «Уралкалий», г. Соликамск)

Глава 5. ГАЛОФИЛЬНЫЕ И Г АЛОТОЛЕРАНТНЫЕ БАКТЕРИИ, ВЫДЕЛЕННЫЕ ИЗ ОТХОДОВ (ТЕХНОГЕННО-МИНЕРАЛЬНЫХ ОБРАЗОВАНИЙ) КАЛИЙНОГО ПРОИЗВОДСТВА
ОАО «УРАЛКАЛИЙ»
5.1 Культивируемые галотолерантные бактерии из ТМО шламохранилища БКПРУ-2 ОАО «Уралкалий»
5.2 Культивируемые галофильные бактерии из ТМО шламохранилища БКПРУ-2 ОАО «Уралкалий»
5.3 Культивируемые бактерии-деструкторы из ТМО шламохранилища БКПРУ-1 ОАО «Уралкалий»
5.4 Галотолерантный штамм Ккос1ососсих vratislaviensis КТ112-7 -деструктор моно(поли)ароматических углеводородов
5.4.1 Идентификация и геномные исследования
5.4.2 Деградационная активность
5.4.3 Деструкция ароматических углеводородов при разной солености среды
5.4.4 Функциональные гены деструкции ароматических соединений
5.4.5 Метаболические пути деструкции орто-ФК и БК у штамма
Я. wratisla.vien.sis КТ112
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
Окончание. Таблица 3 Образцы, отобранные в районе солеразработок
Образец Проба Место отбора Концентрация ионов 1Ча+, мг-экв/100 г Концентрация ионов Йа+, мг/кг Порядковый номер
Г алитовые отходы Соляная корка Солеотвал СКПРУ-2 (г. Соликамск) 1437 330510
Солеотвал СКПРУ-2 (г. Соликамск) (граница почвы и солеотвала) 471 108330
Солеотвал СКПРУ-1 (г. Соликамск) 1813 416990
Солеотвал БКРУ-1 (г. Березники) н.о. н.о
Рассоло- сборник Вода У солеотвала СКПРУ-2 (г. Соликамск) 181 41630
Донные отложения У солеотвала СКПРУ-2 (г. Соликамск) 995 228850
Грунт Грунт (1 -2 м от солеотвала) У солеотвала СКПРУ-2 (г. Соликамск) 1326 304980
Техногенно-минеральные образования (ТМО) ТМ01 Рудник БКПРУ-1 (г. Березники). Образец «Шлам 1» н.о. н.о
Рудник БКПРУ-1 (г. Березники). Образец «Шлам 2» н.о. н.о
ТМОП Рудник БКПРУ-2 (г. Березники). Образец 220/2. Шламохранилище. Шурф № 1. Глубина 0,5м. 170 39100
Рудник БКПРУ-2 (г. Березники). Образец 219/1. Шламохранилище. Шурф № 1. Глубина 0,3м. н.о. н.о
Рудник БКПРУ-2 (г. Березники). Образец 221/3. Шламохранилище. Шурф № 2. Глубина 0,2 м. 22 5060
Рудник БКПРУ-2 (г. Березники). Образец 222/4. Шламохранилище. Шурф № 3, Глубина 0,2 м. 137 31510
Рудник БКПРУ-2 (г. Березники). Образец 222/5. Шламохранилище. Шурф № 3. Глубина 0,4 м. 150 34500
Примечание, «н.о.» - не определяли.
Почва (контрольный вариант), отобранная на расстоянии 1600 м от солеотвала СКПРУ-1 содержала Иа+ в концентрации 0,02 мг-экв/100 г (4,6 мг/кг).