Циркуляция вируса гепатита E кроликов на территориях с разной степенью эндемичности по гепатиту E

• Автор: Мохаммед Ахмед Мохаммед Еладли
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2015
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 122 с. : ил.

Список сокращений:
5’-НТО - 5’ нетранслируемая область
Анти-ВГЕ - антитела к вирусу гепатита Е
Анти-ВГЕ IgG - антитела к вирусу гепатита Е класса IgG
Анти-ВГЕ IgM - антитела к вирусу гепатита Е класса IgM
АлАТ (AJIT) - аланинаминотрансфераза
ВГА - вирус гепатита А
ВГЕ - вирус гепатита Е
ГЕ - гепатит Е
ИФА - иммуноферментный анализ НТ - нуклеотидтрифосфат НТО - нетранслируемая область ОРС - открытая рамка считывания ОТ - реакция обратной транскрипции
ОТ-ПЦР - обратная транскрипция-полимеразная цепная реакция ПЦР - полимеразная цепная реакция РНК - рибонуклеиновая кислота
РНК ВГЕ - рибонуклеиновая кислота вируса гепатита Е
АДФ - Аденозиндифосфат
ВПЧ - вирусоподобные частицы
ВОЗ - Всемирная организация здравоохранения
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
РФ - Российская Федерация
CDC - Центр по контролю и профилактике заболеваний в США (Center for Disease Control and Prevention)
РБ - Республик Беларусь
ОГЛАВЛЕНИЕ
Список сокращений
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Вирус гепатита Е
1.1.1. Общая характеристика ВГЕ
1.1.2. Структура вириона ВГЕ
1.1.3. Организация генома и вирусные белки ВГЕ
1.1.4. Репликация ВГЕ
1.1.5. Классификация ВГЕ и генотипы, ВГЕ животных
1.2. Эпидемиология ВГЕ
1.2.1. Эпидемиология ГЕ в гиперэндемичных регионах
1.2.2. Эпидемиология ГЕ в эндемичных регионах
1.2.3. Сравнительная эпидемиология ГЕ в Египте и в России
1.3. Диагностика гепатита Е
1.4. Профилактика гепатита Е
1.5 ВГЕ кроликов
1.5.1 Географическое распространение ВГЕ у кроликов
1.5.2 Генетические исследования ВГЕ кроликов
1.5.3 Возможные пути передачи гепатита Е от кроликов к человеку
1.5.4 Кролики в качестве объекта исследования ВГЕ
Собственные исследования
Глава 2. Материалы и методы исследований
2.1. Материалы исследований
2.2 Методы исследований

2.2.1 Определение анти-ВГЕ
2.2.2 Сбор образцов фекалий
2.2.3 Выделение РНК
2.2.4 Амплификация фрагментов ДНК в ПЦР
2.2.5 Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.2.6 Анализ нуклеотидных последовательностей
2.2.7 Статистические методы
Результаты
Глава 3. Выявление анти-ВГЕ среди кроликов
Глава 4. Определение РНК ВГЕ в образцах фекалий кроликов
Глава 5. Определение РНК ВГЕ в образцах фекалий свиней
Глава 6. Анализ нуклеотидных последовательностей ВГЕ
Обсуждение полученных результатов
Выводы
Практические рекомендации
Список литературы

[182]. Впоследствии вспышки этой болезни нередко происходили на Индийском субконтиненте, Китае, Юго-Восточной и Центральной Азии [184], на Ближнем Востоке, в Африке (Сомали, Уганда) [48], ГЕ страдало от нескольких сотен до нескольких тысяч человек. В Северной Америке (Мексика) были отмечены две небольших вспышки в течение 1986-1987 гг, затем о случаях заболевания больше не сообщалось. В последующих исследованиях методом серологической диагностики было доказано, что ГЕ является эндемичным заболеванием в тропических и субтропических странах, с периодически возникающими эпидемиями в Индии [147; 142], Юго-Восточной Азии [154], Африке [75], и Мексике [176].
В Китае, несмотря на описанные случаи пищевых вспышек ГЕ, большинство эпидемий ГЕ вызвано загрязненной водой [41]. Такие эпидемии обычно сопровождаются обильными атмосферными осадками и могут включать в себя многие тысячи случаев заболевания [158]. Также сообщается, что спорадические случаи заболевания ГЕ намного чаще происходят в гиперэндемичных регионах, чем в эндемичных [32]. Как и ожидалось, в ходе исследований в гиперэндемичных регионах выявлена высокая степень выявления анамнестических антител к ВГЕ - от 15 до 60% [22; 173]. Во время вспышек заболевания, общий уровень заболеваемости составляет от 1 до 15%, причём он намного выше среди людей 15-40 лет (3-30%), чем у детей (0,2-10%) [161]. Пик заболеваемости в спорадических случаях гепатита Е в эндемичных регионах также характерен в большей степени для 15-35-летних [85].
Эпидемии гепатита Е периодически происходят во всех развивающихся странах мира, и в основном вызваны генотипом 1 ВГЕ (в Азии) и генотипом 2 ВГЕ (в Африке [75] и Мексике [176]). Большинство спорадических случаев обусловлены генотипами ВГЕ 1 и 4, хотя недавно