Циркуляция вируса гепатита Е среди свиней на территории Российской Федерации

• Автор: Солонин, Сергей Александрович
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 126 с. : 7 ил.

Список сокращений:
5’-НТО - 5’ нетранслируемая область
Анти-ВГЕ — антитела к вирусу гепатита Е
Анти-ВГЕ IgG - антитела к вирусу гепатита Е класса IgG
Анти-ВГЕ IgM - антитела к вирусу гепатита Е класса IgM
АсАТ (ACT) — аспартатаминотрансфераза
АлАТ (AJIT) - аланинаминотрансфераза
ВГА - вирус гепатита А
ВГЕ - вирус гепатита Е
ВК - внутренний контроль
ГЕ - гепатит Е
ГГТП - Гамма-глутамилтранспептидаза
ШИШ - инфекции, передающиеся половым путём
ИФА - иммуноферментный анализ
МЕ/л - Международные единицы измерения на литр
НТ - нуклиотидтрифосфат
НТО - нетранслируемая область
ОРС - открытая рамка считывания
ОТ - реакция обратной транскрипции
ОТ-ПЦР - обратная транскрипция-полимеразная цепная реакция
П.Н. - пара нуклеотидов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
ПЦР РВ - полимеразная цепная реакция в реальном времени РНК - рибонуклеиновая кислота
РНК ВГЕ - рибонуклеиновая кислота вируса гепатита Е
SPF - животные свободные от специфической патогенной микрофлоры
GBV-C - вирус гепатита G
NCBI - National Center for Biotechnology Information Neighbour - joining (NJ) - метод присоединения соседей Bootstrap value - оценка бутстреп-анализа

ОГЛАВЛЕНИЕ
Список сокращений
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1Л. Общая характеристика вируса гепатита Е
1Л. 1 Классификация
1Л .2 Физико-химические свойства и структура вирион
1Л.З Структура генома
1Л .4 Репликация вируса гепатита Е
1 Л.5.Генотипическое разнообразие ВГЕ
1Л .6. Патогенез и клинические проявления гепатита Е у людей
1.2. Гепатит Е в эндемичных регионах
1.3. Гепатит Е в неэндемичных регионах
1.3.1. Частота обнаружения анти-ВГЕ в неэндемичных регионах среди
различных групп населения
1.4. Лабораторные модели для изучения вируса гепатита Е

1.5. Вирус гепатита Е - зоонозная инфекция
1.5.1. Частота обнаружения анти-ВГЕ у свиней в эндемичных и неэндемичных регионах
1.5.2. Молекулярная эпидемиология ВГЕ свиней
1.5.3. Патогенез и клинические проявления гепатита Е у свиней
1.5.4. Пути передачи вируса у свиней
1.5.5. Гепатит Е у других животных
1.5.6. Частота обнаружения антител к ВГЕ у людей, имеющих профессиональный контакт с животными
1.5.7. Заражение людей гепатитом Е от животных
Заключение по обзору литературы
Глава 2. Собственные исследования
2.1. Материалы исследования

2.2. Методы исследования
2.2.1. Сбор образцов
2.2.2. Выделение РНК
2.2.3. Амплификация фрагментов ДНК в ПЦР
2.2.4. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.2.5. Анализ нуклеотидных последовательностей
2.2.6. Методы статического анализа результатов исследований
Глава 3. Результаты
3.1 Испытания системы для выявления РНК вируса гепатита Е методом обратной транскрипции-полимеразной цепной реакции
3.2 Определение возраста свиней, в котором наиболее часто выявляется ВГЕ-инфекция
3.3. Частота выявления ВГЕ-инфекции среди поголовья свиней в Российской Федерации
3.4. Генетическое разнообразие ВГЕ-инфекции среди поголовья свиней в
Российской Федерации
Глава 4. Обсуждение
Выводы
Рекомендации по использованию научных выводов
Библиографический список литературы

Таблица. 6. Генотипы ВГЕ свиней, выделенные в неэндемичных по гепатиту Е регионах мира
Регионы, неэндемичные по заболеваемости ВГЕ
Страна Г енотип Субтип Источник
Нидерланды 3 За, Зс, Зе, 3f [169]
Испания 3 3f [155]
Италия 3 Зе, 3f, Зс [128]
Великобритания 3 - [134]
Г ермания 3 Зе, Зі [14]
США 3 " [139] [106]
Канада 3 За [114]
Аргентина 3 - [143]
Новая Зеландия 3 - [81]
Тайвань 4 3 и 4 - [209] [208]
Таиланд 3 Зе [52] [180]
Япония 3 За, ЗЬ [151] [144] [171]
Корея 3 За [178]
Швеция 3 Зе, 3f [148]
Дания 3 3 и 4 3f [148] [40]
Италия 3 Зс [61]
Венгрия 3 - [167]
Чехия 3 - [196]
Изучение нуклеотидных последовательностей РНК ВГЕ свиней в 36 архивных образцах фекалий, полученных на территории Нидерландов в 2004-2006 гг., показало циркуляцию 4 субтипов в рамках 3 генотипа - За, Зс, Зе и 31' [169]. Большинство изолятов принадлежало к субтипу Зґ (43%). Сходство в