Диагностическая значимость уровней экспрессии мРНК сурвивина, металлопротеиназы-7 и циклооксигеназы-2 при раке желудка

• Автор: Высоцкая, Ольга Владимировна
• Шифр специальности: 03.01.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 146 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Распространённость рака желудка

1.2. Причины возникновения рака желудка

1.3. Классификация рака желудка

1.4. Диагностика рака желудка

1.5. Сурвивин, СОХ-2 и ММР-7 как маркеры онкогенеза

1.5.1.1. Структура и функции сурвивина

1.5.1.2. Роль сурвивина в апоптозе

1.5.1.3. Роль сурвивина в процессе деления клеток
1.5.1.4. Регуляция экспрессии гена сурвивина
1.5.1.5. Сурвивин и ангиогенез
1.5.1.6. Экспрессия сурвивина в нормальных тканях
1.5.1.7. Экспрессия сплайсинговых вариантов сурвивина
1.5.1.8. Сурвивин - перспективный маркер опухолевого развития
1.5.2.1. Циклооксигеназа СОХ-
1.5.2.2. СОХ-2 и рак желудка
1.5.3 Металлопротеиназа ММР-
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материалы
2.1.1. Реактивы
2.1.2. Приборы и компьютерные программы
2.1.3. Клеточные линии
2.1.4. Клинический материал
2.1.4.1. Опухолевые образцы надпочечников
2.1.4.2. Образцы опухоли и слизистой оболочки желудка
2.2. Методы исследования
2.2.1. Выделение РНК
2.2.2. ОТ-ПЦР
2.2.3. Статистическая обработка результатов
2.2.4. ЛОС-анализ диагностической ценности онкомаркеров
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Оптимизация условий проведения ОТ-ПЦР с праймерами для анализа' мРНК вариантов альтернативного сплайсинга сурвивина
3.1.1. Проведение оптимизации на клеточной линии
3.1.2. Анализ экспрессии мРНК сурвивина и его сплайсинговых вариантов в меланомах
3.1.3. Экспрессия мРНК гена сурвивина в опухолях надпочечников
3.2. Исследование экспрессии мРНК генов сурвивина, СОХ-2, ММР-7 и (3-актина у пациентов с РЖ
3.2.1. Экспрессия конститутивных генов САТИН и {3-актина в ткани желудка
3.2.2.1. Исследование экспрессии мРНК гена сурвивина в опухолях желудка
3.2.2.2. Анализ экспрессии мРНК сплайсинговых вариантов сурвивина-дМ,
-2В и -ДЕхЗ
3.2.2.3. Экспрессия сурвивина в окружающей опухоль слизистой желудка..
3.2.3.1. Исследование экспрессии мРНК гена ММР-7 в опухолях желудка
3.2.3.2. Экспрессия ММР-7 в окружающей-опухоль слизистой желудка
3.2.4.1. Исследование экспрессии мРНК гена СОХ-2 в опухолях желудка..
З.2.4.2. Экспрессия СОХ-2 в окружающей опухоль слизистой желудка
3.2.5. Диагностическая значимость анализа экспрессии мРНК сурвивина,
ММР-7 и СОХ-2 для детекции РЖ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Приложение

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
а.о. — аминокислотный остаток АК - аденокарцинома ЖКТ - желудочно-кишечный тракт
ОТ-ПЦР - совмещенные реакции обратной транскрипции и ПЦР
п.н. - пар нуклеотидов
ПИР — полимеразная цепная реакция
РЖ - рак желудка
РЭА — раковый эмбриональный антиген
ЭДТА - динатриевая соль этилендиаминтетрауксусной кислоты АР-1 (-2) — activated protein-1 (-2) - активаторный белок 1(-2)
Apaf - apoptotic protease activating factor - фактор, активирующий апоптозную протеазу
АРС - adenomatosis polyposis coli - онкоген аденоматозного полипоза кишечника
Вах - Bcl2-associated X protein - проапоптотический белок X, ассоциированный с Вс
Вс1-2 — В-cell chronic lymphocytic leukemia (CLL)/lymphoma 2 - белок 2 B-клеточной лимфомы
BRCA-1 - breast cancer 1 - опухолевый супрессор рака молочной железы С/ЕВР - CCAAT/enhancer binding protein — белок, взаимодействующий с ССААТ/энхансером
CagA - cytotoxin associated gene A - цитотоксин-ассоциированный ген A cAMP - 3'-5'-cyclic adenosine monophosphate - циклический аденозинмонофосфат
CDC2 - cell division cycle 2 - циклин-зависимая активирующая киназа 2 CDE — the cell cycle-dependent element - зависимые от клеточного цикла элементы
CDH - gene cadherin - ген кадгерина
CDK - cyclin-dependent kinase — циклин-зависимая киназа
клеточного цикла, поскольку ответственны за восприятие митогенных сигналов. Регуляция транскрипции гена сурвивина происходит путем активной репрессии, которая требует нативного СЭЕ/СНЯ-регуляторного участка. Дерепрессия этого промоторного элемента является достаточным условием для максимальной индукции экспрессии гена во время вхождения в клеточный цикл [72].
Экспрессия сурвивина в опухолях человека коррелировала с неметилированными Срв-островками в его коровом промоторе. Однако Срв-островки выборочно метилированы в нормальных тканях [145].
Рис. 5. Схема регуляции гена сурвивина.
Дикий тип р53 (vt-p53) в комплексе с белками, участвующими в деацетилировании и метилировании, связывается с промотором гена сурвивина и репрессирует его транскрипцию (рис. 5) [18]. Для
осуществления своей репрессорной функции р53 взаимодействует с корепрессорным фактором (8т-3) и гистоновой деацетилазой (НОАС). Этот комплекс садится на промотор гена сурвивина, вызывая его деацетилирование и репрессию транскрипции [55]. Кроме того, было