Молекулярно-эпидемиологические особенности распространения ВИЧ-инфекции в Новосибирской области в 2008 - 2012 гг.

• Автор: Богачев, Владислав Викторович
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Кольцово
• Количество страниц: 128 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Общие сведения о ВИЧ-инфекции

1.2. Классификация ВИЧ

1.3. История открытия ВИЧ

1.4. Структура вириона ВИЧ

1.5. Цикл репликации ВИЧ

1.6. Структура генома ВИЧ

1.7. Современная филогенетическая классификация ВИЧ

1.8. Циркулирующая рекомбинантная форма 02_АС ВИЧ-1
1.9. Антиретровирусная терапия
1.10. Развитие устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам
1.11. Эпидемиология ВИЧ
1.12. Стадии эпидемии ВИЧ-инфекции
1.13. Географическая распространенность ВИЧ
1.14. Пути передачи ВИЧ
1.15. Факторы риска
1.16. Развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в РФ
Заключение по обзору литературы
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ Актуальность проблемы
ВИЧ-инфекция - это хроническая и неизлечимая болезнь, этиологическим агентом которой является вирус иммунодефицита человека. На сегодняшний день вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) представляет серьезную проблему для многих стран мира, в том числе и для Российской Федерации. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), в мире насчитывается порядка 35 млн ВИЧ-инфицированных лиц [1]. В РФ, согласно данным официальной статистики, их число приближается к 0,8 млн и с 2007 г. увеличивается примерно на 70 тысяч случаев в год. Следует отметить, что официально регистрируемые случаи ВИЧ-инфекции не в полной мере отражают реальную картину заболеваемости, что в основном связано со сложностями ранней диагностики заболевания и недостаточным объемом тестирования групп риска населения, среди которых преимущественно циркулирует ВИЧ.
Заболеваемость ВИЧ-инфекцией на большей части территории России, прежде всего, связана с распространением вируса в среде потребителей инъекционных наркотиков. Продолжительное время вирус циркулировал преимущественно лишь в этой группе риска. Однако в связи с тем что потребление наркотических препаратов практикуется среди молодого, сексуально активного населения, ВИЧ постепенно проник и в другие слои общества; с каждым годом все большее количество случаев заражения ВИЧ-инфекцией связано с незащищенными половыми контактами.
Уникальная степень генетической изменчивости ВИЧ способствует постоянному усложнению вирусной популяции, разнообразие которой в значительной степени варьируется в зависимости от географического положения территорий. По последним данным, с 1983 г. выявлено девять основных субтипов ВИЧ и более 60 циркулирующих рекомбинантных форм (СИР) [2]. Наибольшее разнообразие генетических вариантов вируса наблюдается в странах Африки южнее Сахары [1], на других территориях могут циркулировать один и более эпидемиологически значимых генетических вариантов ВИЧ. Лидирующее положение по распростра-

нению в России и странах бывшего СССР занимает субтип А ВИЧ-1 [3]. В РФ обнаруживаются и иные генетические варианты ВИЧ-1, в основном это варианты субтипа В - они выявляются повсеместно (4-8 %); СЛРОЗ АВ - в европейской части России [3,4]; Б1 - в г. Санкт-Петербург [3]; в - в Южном федеральном округе [5]; С11Р02_АС - в Сибирском и Дальневосточном федеральном округе [6, 7]; также с низкой частотой на отдельных территориях регистрируются субтип С и СКР01_АЕ [6]. Подобное разнообразие генетических вариантов ВИЧ в пределах одной страны характерно для популяции данного вируса.
Изучение специфики распространения и представленности ВИЧ в пределах конкретных территорий необходимо для принятия адекватных мер по диагностированию, терапии и противодействию дальнейшему увеличению числа ВИЧ-инфицированных лиц. На сегодняшний день в России таких исследований проводится недостаточно. Мониторинг молекулярно-эпидемиологической ситуации по ВИЧ-инфекции проводится лишь в некоторых субъектах федерации.
На фоне прогрессирования распространения ВИЧ, постоянно увеличивающегося числа ВИЧ-инфицированных лиц, принимающих препараты антиретровирусной терапии (АРВТ), схемы которой с течением времени требуют корректировки с учетом возникающих мутаций устойчивости вируса, актуальность проведения подобных исследований на всей территории РФ не вызывает сомнений.
Цели и задачи исследования
Целью данной работы было исследование молекулярноэпидемиологических особенностей распространения ВИЧ-инфекции в Новосибирской области в период 2008-2012 гг. и анализ циркулирующих генетических вариантов вируса на территориях Кемеровской области и Забайкальского края.
Для достижения указанных целей были поставлены следующие задачи:
1. Создать банк образцов плазмы крови, полученной от инфицированных ВИЧ-1 пациентов.
2. Осуществить анализ эпидемиологических данных для собранных клинических образцов.

клетки-мишени можно выделить четыре важных этапа [128]. Теоретически можно нарушить процесс интеграции провирусной ДНК на любом этапе с помощью разных ингибиторов интегразы.
На данный момент зарегистрирован и разрешен к применению один препарат данного класса - ралтегравир, который является ингибитором связывания провирусной ДНК и ДНК зараженной клетки.
1.10 Развитие устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам
Лекарственная устойчивость - это способность ВИЧ реплицироваться, несмотря на присутствие препаратов антиретровирусной терапии.
Появление вариантов ВИЧ, обладающих лекарственной устойчивостью, обусловлено большой частотой ошибок репликации, совершаемых обратной тран-скриптазой ВИЧ [129], и высокой скоростью воспроизводства: у ВИЧ-инфицированного, не получающего АРВТ, ежедневно образуется до 10 млн новых вирусных частиц [130]. Это приводит к высокой частоте появления мутаций и постоянному образованию новых штаммов вируса даже в отсутствие лечения [129]. На фоне приема антиретровирусных препаратов происходит селективный отбор резистентных штаммов ВИЧ [129].
Нуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (НИОТ)
Существует два основных биохимических механизма формирования резистентности к НИОТ [131].
Стерическое ингибирование обеспечивается мутациями, которые изменяют структуру активного центра обратной транскриптазы таким образом, что она начинает отличать НИОТ от природных нуклеозидов, в результате вероятность встраивания НИОТ в провирусную ДНК резко снижается. Стерическое ингибирование наблюдается при мутациях М184У, 0151М, Ь74У и К65Я [131, 132].
Фосфоролиз НИОТ с участием АТФ или пирофосфата приводит к отсоединению уже встроенного НИОТ от растущей провирусной цепи ДНК. Этот механизм обеспечивается мутациями М41Ь, 06714, К7(Ж, Ь210У, Т215У и К219С] [133]. Фосфоролиз приводит к появлению перекрестной резистентности к НИОТ, при этом наблюдается следующая закономерность в уровнях резистентности к