Молекулярная гетерогенность госпитальных штаммов ванкомицин-устойчивых Enterococcus faecium в гематологии

• Автор: Бриллиантова, Анна Николаевна
• Шифр специальности: 14.01.21, 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 112 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ.

Список использованных сокращений

Введение
Глава 1. Обзор лшерагуры «Молекулярные механизмы устойчивости к ванкомицину и вирулентность госпитальных штаммов энтерококков».

1.1 Общая характеристика ЕШегососсиь ьрр

1.2. Молекулярное строение энтерококков

1.3. Молекулярные механизмы устойчивости

энтерококков к ванкомицину

1.4. Факторы вирулентности энтерококков

1.5. Молекулярные методы исследования энтерококков. 29 Г лава 2. Материалы и методы исследования.

2.1. Материалы исследования

2.2. Методы исследования.
22.1. Выделение и идентификация энтерококков
22.2. Полимеразная цепная реакция
22.3. Пульстзлекірофорсз
22.4. Мультилокусное секвенирование
2.2.5. Статистическая обработка результатов. 49 Глава 3. Результаты молекулярного типирования штаммов
ванкомицин-устойчивых Е. /аесіит
Глава 4. Результаты исследования структуры транспозонов Тп1546, кодирующих резистентность Е. _/аесіит к ванкомицину

Глава 5. Результаты исследования генов вирулентности Е./аесіит.
5.1. Вирулентность ванком и дин-усгой чи вы х
штаммов Е. /аесіит
5.2 Характеристика вирулентности устойчивых и
чувствительных к ванкомицину Е. /аесіит
Глава 6. Результаты мультилокусного секвенирования эпидемических штаммов Е. /аесіит
Заключение
Выводы
Список литературы

Список использованных сокращений.
АТФ - аденозинтрифосфат Кб - тысяча оснований Мб - миллион оснований
МПК - минимальная подавляющая концентрация
NAG - N-ацетшшпокозамин
NAM - N-ацетилмурамовой кислота
п. о. - пар оснований
ПЦР - полимеразная цепная реакция
А - аденин
Agg - aggregation substance, субстанция агрегации
Acm - collagen-binding adhesin, коллаген-связывающий адгезии
С - цитозин
СС17 - clonal complex 17, клональный комплекс
Cyl - cytolysin, цитолизин
D, L-Ала - D, L- Аланин
D-Глу - D-Глутамин
D-Лак - D-Лактат
D-Cep - D-Серин
Esp - enterococcal surface protein, энтерококковый поверхностный протеин G - гуанин
GC-состав - доля нуклеотидов гуанина и цитозина
Gel - gelatinase, желатиназа
Hyl - hyaluronidase, гиалуронидаза
IR - inversed repeat, инвертированный нуклеотидный повтор IS - insertion element, инсерционный элемент L-Лиз - L-Лизин

I 3 Allelic Profile Results Microsoft Internet Lxplorer
Файл Правка Вид Избрагм» Сервис Оправка Г
в"--й-аай<р"- «р—ЦЦ»
Адрес tihtWMw**nMNN_*bpnfleresrte.a» v £3 Переход ' *
DATA ANALYSIS
DATABASES
B.burydorteri a B.cereus
B.psemJomallei
С лЯЛиш a C.iflabtaa
C.krusei
m C.uoptcalis m C. jejuni
ÙMfaontWÿNM
Exoii
a E.tiecatis Ebecium
H.mUtnnzae » H.pylori
m Leptospira spp ш M.catarrhal is а HmmfogMdh a Sijabctkte m
a S.ennrka а S-tphtomUb а S.рпеитопш ш pyoi/enes
S.su is
а V.vulnificus
SUBMISSIONS
NEWS
LINKS
Enterococcus faecium wieiic protties query results You sequence type is
Sir din ST Sere*** A»p A Oil Gdh PwK Oyd PslS
To use the tree drawing program, please enable Java on your browser
AtpA Ddl Gdh PurK Gyd PstS Mk Exact or nearest match *
1 ' 1 1 J 1
Profile Query Locus Ooeiy Batch Ouery
Reuse choose— v Please choose- * Please choose
Рисунок 8. Анализ данных 1LST и определение БТ Е. /аесшт в соответствии с нуклеотидными последовательностями исследуемых генов.
Таким образом, Интернет-портал 1LST позволяет классифицировать
обнаруженный сиквенс тип как известный или новый, а также вносить свои
результаты в общемировую базу. В этой базе хранятся в стандартизованной
форме индивидуальные сведения о каждом штамме, включающие сиквенс
типы, данные о типировании другими методами, а также
эпидемиологические данные (страна выделения, источник изолята).
Благодаря этому, 1LST подходит для изучения вирулентности и структуры
популяций различных видов бактерий, а также для международного контроля