Физико-химические характеристики аналогов оливомицина A и их комплексов с ДНК

• Автор: Дурандин, Никита Александрович
• Шифр специальности: 02.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 102 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ

1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1Л Типы комплексообразования различных лигандов с ДНК

1.1.1 Особенности структуры двойной спирали, определяющие основные закономерности взаимодействия лигандов с ДНК

1.1.1.1 Соединения, интеркалирующие между парами оснований ДНК

1.1.1.2 Соединения с локализацией при связывании в узкой бороздке ДНК

1.1.1.3 Соединения с локализацией при связывании в широкой бороздке ДНК

1.1.1.4 Соединения, ковалентно связывающиеся с ДНК

1.1.2 Жидкокристаллические дисперсии на основе двухцепочечной ДНК в водно-полимерных растворах и характеристика их взаимодействия с лигандами

1.1.2.1. Типы жидкокристаллических фаз

1.1.2.2. Круговой дихроизм дисперсий нуклеиновых кислот и их комплексов с лигандами
1.2 Антибиотики ряда ауреоловой кислоты. Структура и свойства
1.2.1 Типы комплексов антибиотиков ряда ауреоловой кислоты с ДНК
1.2.2 Спектроскопия кругового дихроизма соединений ряда ауреоловой кислоты и их комплексов с ДНК
1.2.3 Зависимость между структурой и антибиотической активностью соединений ряда ауреоловой кислоты
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Материалы и реактивы
2.2 Методики
2.2.1 Спектрофотометрический метод
2.2.2 Спектрофлуориметрический метод
2.2.3 Спектроскопия кругового дихроизма
2.2.4 Метод остановленной струи
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Физико-химические свойства аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе А-олиозы и Е-оливомикозы и их комплексов с ДНК

3.1.1 Исследование комплексообразования аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе А-олиозы и Е-оливомикозы с ДНК методом спектрофотометрии
3.1.2 Исследование взаимодействия аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе А-олиозы и Е-оливомикозы с ДНК методом кругового дихроизма
3.1.3 Исследование комплексообразования аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе А-олиозы и Е-оливомикозы с ДНК методом спектрофлуориметрии
3.1.3.1 Определение констант комплексообразования аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе
А-олиозы и Е-оливомикозы с ДНК
3.1.3.2. Определение квантовых выходов флуоресценции аналогов оливомицина А с различными ацильными заместителями в составе А-олиозы и Е-оливомикозы и их комплексов с ДНК
3.2 Физико-химические свойства производных оливомицина А с карбоксильным и 1Ч,1Ч-диметиламиноэтиламидным заместителями в боковой цепи агликона и их комплексов с ДНК
3.2.1 Спектрофлуориметрическое исследование комплексообразования производных оливомицина А с карбоксильным и -14,Р1-диметиламиноэтиламидным заместителями в боковой цепи агликона с ДНК
3.2.1.1 Определение констант комплексообразования производных оливомицина А с карбоксильным и М,14-диметиламиноэтиламидным заместителями в боковой цепи агликона с ДНК
3.2.1.2 Определение квантовых выходов флуоресценции комплексов аналогов оливомицина А с карбоксильным и НМ-диметиламипоэтиламидным заместителями в боковой цепи агликона с ДНК
3.3 Спектрально-кинетические характеристики комплексов оливомицина А с олигонуклеотидом 8р1ЛЧГАТ и его аналогами 8р1ЛЧРАТ-т1 и 8р1ЛЧРАТ-ш
3.3.1 Исследование комплексообразования оливомицина А с олигонуклеотидом БрНИЕЛТ и его аналогами 8р1/ИРАТ-т1 и 8р1/ИРАТ-т2 методом спектрофотометрии
3.3.2 Исследование комплексообразования оливомицина А с олигонуклеотидами 8р1ЛЧРАТ и его аналогами 8р1ЛЧРАТ-т1 и 8р1/МРАТ-т2 методом кругового дихроизма
3.3.3 Исследование комплексообразования оливомицина А с олигонуклеотидом 8р1/ЫРАТ и его аналогами 8р1/ЫРАТ-т1 и
8р1/ИРАТ-т2 методом спектрофлуориметрии
3.3.3.1 Определение констант комплексообразования оливомицина А с олигонуклеотидом 8р1/Тч[РАТ и его аналогами 8р1/МРАТ-т1 и

8р1/№АТ-т
3.3.4 Исследование комплексообразования оливомицина А с олигонуклеотидом БрІЛЧРАТ и его аналогами 8р1/ЫРАТ-т1 и 8р1/№АТ-т2 методом остановленной струи с флуоресцентной детекцией
3.4 Физико-химические характеристики комплексообразования
оливомицина А с жидкокристаллической дисперсией на основе

3.4.1 Исследование изменения структуры холестерической жидкокристаллической дисперсии на основе ДНК под действием оливомицина А методом кругового дихроизма
4. ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ.

1.2.3 Зависимость между структурой и антибиотической активностью соединений ряда ауреоловой кислоты.
Переход от оливомицина А к оливомицинам В, С и Б, заключающийся в изменении характера ацилирования и длины одной из углеводородных цепей, сопровождается постепенным уменьшением антибактериальной активности [76]. Сходная тенденция, хотя и менее выраженная, наблюдается и в ряду абурамицинов, которые содержат те же сахара, но отличаются наличием С-метильной группы в ароматическом ядре [77]. Поскольку абурамицины в среднем несколько активнее соответствующих оливомицинов, то дополнительная С-метильная группа несомненно оказывает определенное влияние на биологические свойства этих антибиотиков. В то же время такое значительное изменение структуры, как окислительная деградация боковой цепи хромомицина А3 с утратой трех из пяти углеродных атомов приводит к образованию хромомициновой кислоты, все еще сохраняющей высокую биологическую активность.
В основе биологического действия антибиотиков группы ауреоловой кислоты лежит подавление матричного синтеза РНК. Антибиотики группы ауреоловой кислоты подавляют синтез РНК, образуя прочные комплексы с матричной ДНК. Одной из вероятных причин подавления матричной активности ДНК веществами, образующими с ней комплексы, является увеличение прочности вторичной структуры ДНК, которое препятствует локальному плавлению молекулы ДНК, необходимому при матричном синтезе на двухцепочечной ДНК. Такое представление основано на том, что вещества, оказывающие воздействие на биосинтез нуклеиновых кислот, подобно актиномицину, значительно повышают температуру плавления (ТШ1) ДНК. В присутствии ионов магния антибиотически активные представители группы ауреоловой кислоты повышают Тпл ДНК, тогда как малоактивные и неактивные вещества практически не оказывают такого действия [78].