+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Конформационные переходы в белках и полипептидах

  • Автор:

    Якубович, Александр Валентинович

  • Шифр специальности:

    01.04.02

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2010

  • Место защиты:

    Санкт-Петербург

  • Количество страниц:

    164 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    499 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы

Оглавление
Введение
1 Теоретические Методы
1.1 Уравнение Шредингера
1.2 Приближение Борна-Оппенгеймера
1.3 Ограничения на волновую функцию
1.4 Теория Харти-Фока
1.5 Теория Функционала Плотности
1.6 Потенциал молекулярной механики
1.7 Молекулярная динамика
2 Степени свободы в полипептидах и белках
2.1 Введение
2.2 Конформационные свойства полипептидов аланина
2.2.1 Определение крутильных степеней свободы полипептида . .
2.2.2 Оптимизированные геометрии полипептидов аланина
2.2.3 Зависимость энергии полипептида от двугранного угла со . .
2.2.4 Поверхность потенциальной энергии трипептида аланина . .

2.2.5 Поверхность потенциальной энергии гексапептида аланина в конформации листа
2.2.6 Поверхность потенциальной энергии гексапептпда аланина в конформации спирали
2.2.7 Сравнение результатов расчета с экспериментальными данными
2.3 Конформационные переходы в три- и гексапептидах глицина
2.3.1 Оптимизированные геометрии полипептидов глицина
2.3.2 Поверхность потенциальной энергии трипептида глицина
2.3.3 Поверхность потенциальной энергии гексапептида глицина в конформации листа
2.3.4 Поверхность по тенциальной энергии гексапептида глицина в конформации спирали
2.3.5 Сравнение результатов расчета с экспериментальными данными
3 Статистическая модель
3.1 Гамильтониан полипептидной цепи
3.2 Статистическая сумма
3.3 Термодинамические характеристики полипептида
4 Фазовые переходы в полипептидах
4.1 Точность потенциала молекулярной механики
4.2 Поверхность потенциальной энергии полипептидов аланина
4.3 Фазовый переход <т-сгшральЦ->статистический клубок в полипептидах аланина

4.3.1 Внутренняя энергия полипептида
4.3.2 Теплоемкость полипептидов аланина
4.3.3 Расчет параметров Цимма- Брагга
4.3.4 Спиральность полипептидов аланина
4.3.5 Корреляции разных аминокислот в полипептиде
5 Сворачивание полипептидов и белков в водной среде
5.1 Введение
5.2 Теоретические методы
5.2.1 Сгатсумма белка
5.2.2 Статистическая сумма белка в водной среде
5.3 Результаты и дискуссия
5.3.1 Теплоемкость стафилококковой нуклеазы
5.3.2 Теплоемкость метмиоглобина
Заключение
Публикации автора по теме диссертации
Список литературы

£ [Ре1(г)Е£сь{ре1{г))]
5рел{г)
(1.67)
г8(г)

Функционалы ТФП как правило разделяют Обменно-корреляционную энергию на две части, называемые обменной и корреляционной частями:
Обе части являются функционалами электронной плотности, которые тоже подразделяют на два типа: функционалы, зависящие только от электронной плотности р, локальные, и функционалы, зависящие от плотности и градиента плотности Ур, с градиентными поправками
В литературе можно найти множество различных обменно-корреляционных функционалов. Ниже рассмотрим только те, которые использовались для рассче-тов в данной работе.
Локальный обменный функционал фактически определяется следующим выражением:
Это выражение определяет обменную энергию однородного электронного газа. Однако, его не достаточно для аккуратного описания молекул.
Обменно-корреляционный функционал с градиентными поправками, предложенный Беке [50], основанный на ПЛП обменном функционале имеет следующий вид:
Ехс[р — Ех{р) + Ес(р)
(1.68)
(1.69)
Г п*/3т
Е^а = Е^оа - 7 / / сРг, (1.70)
х * 'У 1 + 6 у '
где х=р_4/,3|Ур| и 7 = 0.0042 параметры, подобранные так, чтобы описывать известную энергию обменного взаимодействия атомов благородных газов.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Время генерации: 0.434, запросов: 967