Методы выявления и изучение молекулярно-генетических свойств изолятов вирусов оспы птиц

• Автор: Елаткин, Николай Павлович
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Владимир
• Количество страниц: 133 с. : ил.

СПИОК СОКРАЩЕНИЙ
ВЗВ (IMV) - внутриклеточный зрелый вирус (the intracellular mature virus) ВКО - внутренний контрольный образец
BOB (IEV) - внутриклеточный оболочечный вирус (intracellular enveloped virus)
ВОГ - вирусов голубей ВОК - вирус оспы кур
ВОК (FWPV) - вирус оспы кур (fowl pox virus)
ВОКР (CNPV) - вирус оспы канареек (canary pox virus)
ВОП - вирус оспы птиц
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
дПЦР - дуплекс ПЦР
ИФА - иммуноферментный анализ
кДНК - ДНК-копия с РНК матрицы
мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота
МЭБ (OIE) - международное эпизоотическое бюро
н.п. - нуклеотидные пары
HB (IV) - неинфекционный сферический незрелый вирис (non-infectious spherical immature virus)
ОП - оспа птиц
OPC (ORF) - открытые рамки считывания (open reading frame) пко - положительный контрольный образец ПЦР — полимеразная цепная реакция
ПЦР-РВ - полимеразная цепная реакция в режиме реального времени
РЭВ - вирус ретикулоэндотелиоза птиц
тцд - титр цитопатического действия
ФБР - фосфатно-буферный раствор
ФЭК - фибробласты эмбирионов кур
ХАО - хорионаллантоисная оболочка
цпэ - цитопатогенный эффект
ЭИД - эмбриональное инфекционное действие
EEV - внеклеточный оболочечный вирус (extracellular enveloped virus) FBT - клетки трахеи эмбрионов быка
IMV - внутриклеточный зрелый вирус (intracellular mature virus)
IPTG - Изопропил-P-D-1-тиогалактопиранозид
LTR (ДКП) - long terminal raped (длинные концевые повторы)
SPF - specific pathogen free (свободные от патогенов эмбрионы кур) USDA - министерство сельского хозяйства США VERO - клетки африканской зелёной обезьяны X-Gal - бромо-хлоро-индоил-бета-О-галактогшранозид

ОГЛАВЛЕНИЕ
1. ВВЕДЕНИЕ
2 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1 Общая характеристика
2.2. Морфология
2.3. Классификация
2.4. Геном ВОП
2.5. Морфогенез
2.6. Взаимодействие вируса с организмом-хозяином
2.7. Культивирование ВОП
2.8. ' Патогенез и распространение заболевания
2.9. Заболевание
2.10. Антигенная и генетическая вариабельность и филогения ВОП
2.11. Диагностика инфекции, вызываемой ВОП
2.12. Профилактика и лечение
2.13. Вирус оспы птиц и вирус ретикулоэндотелиоза (РЭВ)
2.14. Вирусы оспы птиц в качестве вакцинных векторов
2.15. Заключение по обзору литературы
3. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1. Материалы
3.2. Методы
3.2.1. Выделение ДНК

Особенность подхода к таксономии ВОП на основании вида хозяина состоит в том, что род или вид птиц у которого вирус вызывает сильное заболевание, и, по этой причине от которого наиболее легко может быть выделен, не обязательно является природным резервуаром вируса, что зачастую подтверждается анализом последовательностей генов этих вирусов [31]. В этом контексте можно отметить отчёт [19] описывающий близко связанные последовательности гена Р4Ь от широкой группы различных птиц, представленных в центре дикой природы в Вирджинии, США в 2003-2004. Вирусы формировали тесную генетическую подгруппу, по сути формируя новый субклад. При этом круг видов-хозяев включает такие кардинально различные виды птиц, как серо-голубая комароловка, пересмешник (Mimus polyglottes), мексиканская чечевица (Carpodacus mexicanus) и большая голубая цапля (Ardea herodias).
Недавняя работа, основанная на анализе трёх генов, включая Р4Ь, показывает, что вирус оспы пингвинов, выделенный из поражений вокруг глаз африканского пингвина (Spheniscus demersus), был наиболее тесно связан с вирусами оспы индеек, страусов и голубей [48].
Эти данные указывают на необходимость изучения не только ВОП выделяемых от домашних птиц, но и на выявление и изучение вирусов от диких и синантропных птиц.
2.11. Диагностика инфекции, вызываемой ВОП Клиническая диагностика
Клинические признаки у инфицированных птиц представлены различными поражениями кожи, варьирующими от папул до наростов. Большие поражения при обеих и кожной и дифтерической форме наблюдаемые у птиц и при последующем вскрытии, обычно достаточны для подозрения на инфекцию ВОП [144]. Но этих признаков иногда недостаточно для окончательной постановки диагноза болезни, вызываемой как ВОП, так и другими агентами, такими как вирус папилломы, клещи лап (scaly leg mites) [5] и микотоксины, которые могут вызывать схожие поражения кожи [144].