+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Функциональная значимость сумоилирования метил-ДНК-связывающего белка Каизо

  • Автор:

    Жигалова, Надежда Алексеевна

  • Шифр специальности:

    03.01.03

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2010

  • Место защиты:

    Москва

  • Количество страниц:

    106 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    499 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы

ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
дАТФ - дезоксиаденинфосфат
дНТФ-дезоксинуклеотидтрифосфат
ИБ - Иммуноблоттинг
ИП - иммуиопреципитация
ИПТГ - изопропил-Р-0-1-тиогалактопиранозид
ИХ - иммунопреципитация хроматина
КСС - Каизо связывающий сайт
ПААГ - полиакриламидный гель
Г1ПЦ - нолипептидная цепь
ПТМ — посттрансляционные модификации
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РНК - рибонуклеиновая кислота
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
а.о. - аминокислотные остатки
л - литр
мг - миллиграмм
мин. - минуты
мкл - микролитр
мл - миллилитр
мМ - миллимоль
пн - пар нуклеотидов
тин - тысяч пар нуклеотидов
об/мин - обороты в минуту

BTB/POZ - семейство белков содержащих на N-конце ВТВ домен и на С-конце домен «цинковые пальцы» (Brie a brae, Tramtrack, Broad complex/Pox virus and Zinc finger)
ChIP - иммунопреципитация хроматина (Chromatin immunoprécipitation)
ChIP-seq - иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием (Chromatin immunoprécipitation followed by sequencing)
CpG - цитозин (С) и гуанин (G) динуклеотид, где р - остаток фосфорной кислоты DAPI - ДАПИ - диамидино-2-фенилиндол (4',6-diamidino-2-phenylindole)
DMEM - среда модифицированная Дульбеко (Dulbccco’s Modified Eagle’s Medium)
DMD - дифференциально метилированный домен (Differentially Methylated Domain) DMR - дифференциально метилированный район (Differentially Methylated Region) DNMT - ДНК метилтрансфераза (DNA methyltransfcrase)
GFP - зеленый флуоресцирующий белок (Green Fluorecent Protein)
MBD домен - метил-ДНК-связывающий домен (methyl-DNA binding)
MBD2 - метил-ДНК-связывающий белок MBD2 (methyl-DNA binding)
MeCP2 - метил CpG связанный белок 2 (Methyl ÇpG binding Protein 2)
NCoR - ядерный ко-репрессорный белковый комплекс (Nuclear Receptor Co-Repressor) NEM- ингибитор протсаз, N-этилмалеимид (N-ethylmaleimide)
PBS - фосфатно-солевой буфер (Phosphate Buffered Saline)
SDS - додецил сульфат натрия (Sodium Dodecyl Sulfate)
TRD - репрессионный домен (Transcriptional Repressor Domain)

ОГЛАВЛЕНИЕ
ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ
ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ РАБОТЫ
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Метилирование генома эукариот
1.1.1. Геномный нмпрннтинг. Х-инактивацнн
1.1.2. Динамика изменения метилирования во время эмбриогенеза
1.1.3 ДНК-метилтрансферазы
1.1.4 Роль метилирования ДНК в регуляции экспрессии генов
1.2. Метил-ДНК-связывающие белки
1.3. Характеристика белков BTB/BOZ-семепства
1.3.1. Особенности BTB/POZ домена
1.3.2. Особенности домена «цинковые пальцы»
1.4. Метил-ДНК-связывающий BTB/POZ транскрипционный фактор Каизо
1.5. Посттрансляционные модификации
1.5.1. Связь между метилированием ДНК и ПТМ гистонов
1.5.2. Влияние ПТМ на функциональную активность транскрипционных
факторов
1.5.3. Сумоилирование, как уникальная ПТМ в регуляции активности транскрипционных факторов
1.6. ChIP-seq анализ, как новый метод для нолногеномного картирования сайтов связывания транскрипционных факторов с ДНК
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Штаммы бактерий
2.2. Клеточные культуры и транзиентнаи трансфекция
2.3. Получение компетентных клеток
2.4. Выделение тотальной ДНК из тканей и клеток
2.5. Выделение тотальной РНК нз клеток
2.6. Обратная транскрипция
2.7. Полимеразная ценная реакция
2.8. Клонирование ПЦР продукта
2.9. Плазмиды и конструкции
ферментов, известно 500 протеин киназ (фосфорилирование), 150 фосфотаз, 500 прогеаз, более 100 убиквитин-лигаз (убиквитинирование), небольшое количество гистоновых ацетилаз (ацетилирование) и деацетилаз (деацетилирование) (101; 102).
1.5.1. Связь между метилированием ДНК и ПТМ гистонов.
Гистоны представляют собой прекрасный пример различных ПТМ, например, постгрансляционные модификации 1Ч-концевой части гистонов включают в себя: метилирование, ацетилирование, фосфорилирование, убиквитинирование, и влияют на состояние хроматина, на доступность к ДНК транскрипционных факторов. В результате модификации гистонов в зависимости от положения и вида модификации может происходить либо активация, либо подавление транскрипции за счет связывания определенных белков с той или иной модификацией гистона. Так, например, гистон НЗ может быть ацетилирован по следующим положениям лизина: К9, К14, К18 и К23; гистон Н4 - по остаткам К5, К8, К12, К16. Ацетилирование положительно заряженных остатков лизина приводит к нарушению взаимодействия гистонов с ДНК и, как следствие, к образованию менее компактной структуры хроматина, что приводит к доступности ДНК для транскрипционной машины. Хотя с другой стороны ацетилирование И-концевых лизинов в гистонах Н2А (К7) и Н2В (К11, К16) в регуляторных районах определённых генов ассоциировано с подавлением транскрипции. Метилирование гистонов возникает как в остатках лизина, так и аргинина. Так, для гистона Н4 показано метилирование по 20 лизину и третьему аргинину; для гистона НЗ наиболее хорошо охарактеризованы модификации по лизинам К4, К9, К27, К36, К79 и аргининам. Каждый из лизинов может быть моно-, ди- и триметилирован. Метилирование лизинов может быть связано как с активацией, так и с подавлением транскрипции, в зависимости от сайта и вида метилирования (103). Метилирование остатков лизина в положениях К9 и К27 (создаёт возможность для связывания ассоциированных с хроматином белков, например, белка

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Время генерации: 0.150, запросов: 967