Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО
Кулакова, Нина Викторовна
03.00.23, 03.00.06
Кандидатская
2003
Владивосток
120 с. : ил.
Стоимость:
499 руб.
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
ГЛАВА 1. Структурно-функциональная организация
флавивирусов
1.1. Современная классификация флавивирусов
1.2. Структура генома и функции белков флавивирусов
ГЛАВА 2. Молекулярно-генетических методы в изучении свойств
флавивирусов
2.1. Молекулярные детерминанты вирулентности
флавивирусов
2.2. Молекулярно-генетическое типирование
флавивирусов
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
ЕЛАВАЗ. Материалы и методы
3.1. Материалы
3.2. Методы
ГЛАВА 4. Характеристика штаммов вируса клещевого энцефалита
на основе анализа нуклеотидной последовательности фрагмента гена Е
4.1. Изучение штаммов вируса, вызвавших инаппарантную
форму клещевого энцефалита
4.2. Изучение штаммов вируса, вызвавших манифестные
формы клещевого энцефалита
4.3. Сравнительный анализ штаммов, вызвавших
инаппарантное и манифестные проявления клещевого энцефалита
ГЛАВА 5. Характеристика штаммов вируса клещевого энцефалита
на основе анализа нуклеотидной последовательности фрагмента гена N
ГЛАВА 6. Разработка способа экспресс-генотипирования штаммов
вируса клещевого энцефалита
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
а.о. - аминокислотный остаток
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ДТТ - дитиотрейтол
ед. акт. - единица активности
ЖЛ - желтая лихорадка
ЗН - западный Нил
кДНК - ДНК, комплементарная РНК
КЭ - клещевой энцефалит
МГНК - молекулярная гибридизация нуклеиновых кислот
н.о. - нуклеотидное основание
НТР - нетранслируемый регион
ОТ - обратная транскрипция
ПААГ - полиакриламидный гель
ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РНК - рибонуклеиновая кислота
СПЭВ - культура клеток почки эмбриона свиньи
ЦНС - центральная нервная система
ЭДМ - энцефалит долины Мюррей
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
ЭПР - эндоплазматический ретикулум
ЯЭ - японский энцефалит
АТЬР - анализ полиморфизма длин амплифицированных
фрагментов АТР - аденозин 5' - трифосфат
СТЬР - полиморфизм расщепления ДНК структуро-
специфичными эндонуклеазами
ddNTP
Neud. Osh. 5-10 P
RSS-PCR
ТЕМЕД
цетилтриметиламмоний бромистый дидезоксинуклеозид 5' - трифосфат диэтилпирокарбоыат дезоксинуклеозид 5' - трифосфат анализ электрофоретической подвижности гетеродуплексов
шотландский энцефаломиелит овец
штамм вируса КЭ Neudoerfl
штамм вируса КЭ Oshima
штаммы вируса КЭ вариантов Primorye
амплификация фрагментов с сайтов, специфичных
эндонуклеазам
конформационный полиморфизм одноцепочечных ДНК трис-боратный буфер
стандартный буферный раствор (трис-ЭДТА)
(N, N, N1, N’) - тетраметилендиамин штамм вируса КЭ Vasilchenko
применен для типирования вируса Денге. Анализ 73 штаммов вируса Денге-2 и 54 штаммов вируса Денге-3, различающихся по времени и географическим точкам изоляции, позволил разделить вирусы Денге-2 и Денге-3 на 7 и 3 группы, соответственно. Такое распределение хорошо согласовывалось с предварительно проведенной филогенетической классификацией. Предложенный метод значительно упрощает типирование вирусов Денге и позволяет проводить более детальные эпидемиологические исследования в эндемичных для этого вируса странах. Также показано, что использование RSS-PCR не уступает по чувствительности определению первичной последовательности гена Е (Harris, 1999). Метод RSS-PCR оказался весьма удобным для исследования субтипов вируса Денге и был применен для эпидемиологического анализа вспышек заболевания Денге в Гватемале в 1996 -1998 гг., в Никарагуа и Сальвадоре в 1998 г. (Balmaseda, 1999; Harris, 1999). Незначительная модификация метода - nested RSS-PCR был применен для дифференциации генотипа lb вируса гепатита С от всех других генотипов (Krekulova, 2001).
Анализ полиморфизма конформации одноцепочечных ДНК (SSCP - singlestrand conformation polymorfism) широко используется в типировании вирусов. Для детекции замен используют полученные в ПЦР фрагменты ДНК. Метод основан на конформационных изменениях однонитевой ДНК, когда в тестируемой нуклеотидной последовательности наблюдаются точечные мутации. Эти точечные мутации способны изменять конформацию в однонитевых ДНК, которую можно анализировать в электрофорезе по различной подвижности конформационно-отличающихся однонитевых ДНК. Полученные в результате проведения электрофореза наборы полос сравнивают с образцом, принадлежащим к определенному типу, и таким образом относят исследуемый вариант к тому или иному суб- или генотипу. Этим способом были тилированы вирусы Сан Луи, Денге-2, гепатит С и др. (Farfan, 1997; Lareu, 1997; Chandler, 2001). В частности, для вируса Сан Луи показано, что определение генетических вариантов вируса может быть проведено на основе
Название работы | Автор | Дата защиты |
---|---|---|
Биосенсоры для детекции сульфоароматических и фенольных соединений на основе бактерий родов Comamonas и Pseudomonas - деструкторов n-толуолсульфоната и фенола | Макаренко, Александр Александрович | 2007 |
Технология синтеза и очистки рекомбинантных антигенов вируса репродуктивного и респираторного синдрома свиней и цирковируса свиней второго типа и их применение в иммуноферментном анализе | Богданова, Валентина Саттаровна | 2007 |
Изучение механизма ферментативного карбоксилирования 5-аминоимидазолриботида | Трибунских, Илья Александрович | 2005 |