Молекулярно-генетическая характеристика пандемического вируса гриппа А подтипа H1N1, циркулировавшего на территории Российской Федерации на протяжении сезонов 2009-2011гг.

• Автор: Журавлева, Марина Михайловна
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 115 с. : 36 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА СТРОЕНИЯ ВИРУСНОЙ ЧАСТИЦЫ
I 1 1 Классификация
I 1 2 Строение вирусной частицы
I 1 3 Структура генома вируса гриппа А
II 4 Репликация вируса гриппа
I 1 5 Белки вируса гриппа и их функциональные особенности
1.1.5.1 РНК-полимеразный комплекс.
1.1.5.2 РВ1.
1.1.5.3 РВ2.
1.1.5.4 РА.
1.1.5.5 Гемагглютинин.
1.1.5. б Нуклеопротеин.
1.1.5.7 Нейраминидаза.
1.1.5.8 Матриксный (М1) и трансмембранный белок (М2).
1.1.5.9 Неструктурные белки: N51 и N52.
1.2 ХАРАКТЕРИСТИКА ПАНДЕМИЧЕСКОГО ГРИППА А ПОДТИПА Н1М
I 2 1 Происхождение пандемического вируса гриппа А(Н1Ы1)рбт2009
122 Эпидемиологические особенности вируса гриппа А подтипа Н1 N1
123 Клиническая картина пандемического гриппа А(Н1 М1)рбт2009
1.3 ПРОТИВОВИРУСНЫЕ ЛЕКАРСТВЕННЫЕ СРЕДСТВА
I 31 Арбидол
I 3 2 Амантадин и римантадин
! 3 3 Занамивир и озельтамивир
I 3 4 Чувствительность пандемического вируса гриппа А(Н11Ч1)рс1т2009 к противовирусным
лекарственным препаратам
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
11.1 Сбор клинического материала для исследования
11.2 Выделение РНК
11.3 Реакция обратной транскрипции
~ 2 ~
11.4 Олигонуклеотиды, использованные в экспериментах
11.5 Проведение полимеразной цепной реакции
11.6 Клонирование фрагментов концевых областей генома
II 6 1 Получение рекомбинантных плазмид
II 6 2 Приготовление компетентных клеток
116 3 Трансформация клеток плазмидной ДНК
II 6 4 Селекция плазмид, несущих последовательности фрагментов гена гемагглютинина
II 6 5 Выделение плазмидной ДНК
11.7 Электрофорез ДНК
11.8 Приготовление ДНК для секвенирования
11.9 Секвенирование ДНК
11.10 Построение алайнментов и филогенетический анализ
11.11 Анализируемые штаммы из базы данных GenBank
III. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
111.1 ИССЛЕДОВАНИЕ УЧАСТКОВ ГЕНОВ
III 1 1 Молекулярно-генетический анализ участка гена НА
III 1 2 Анализ последовательностей участка гена НА и выявление дополнительных мутаций 81 III 1 3 Молекулярно-генетический анализ участка гена NA
III 1 4 Анализ последовательностей участка гена NA на предмет выявления потенциальных маркеров устойчивости к противовирусным лекарственным препаратам
III 1 5 Молекулярно-генетический анализ участка гена М
III 1 6 Анализ последовательностей участка гена М на предмет выявления потенциальных маркеров устойчивости к противовирусным лекарственным препаратам
111.2 СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛНЫХ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ПАНДЕМИЧЕСКОГО ВИРУСА ГРИППА A(H1N1)pdm2
III 2 1 Анализ полной нуклеотидной последовательности генома вируса пандемического гриппа A(H1N1)pdm2009
III 2 2 Филогенетические взаимоотношения исследуемых вирусов
IV. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
V. ВЫВОДЫ
VI. БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК
VII. ПРИЛОЖЕНИЕ
~ 4 ~
North American avian
Segments
1 PB2 (Avian)
2 PB1 (Human)
3 PA (Avian)
4 HA (Swine; Classic)
5 NP (Swine; Classic)
6 NA (Swine; Eurasian)
7 M (Swine; Eurasian)
8 NS (Swine; Classic)
Схема 3. Схематическое изображение генов пандемического вируса гриппа А(Н 1N1 )рбш2009.
Пять генов нового вируса близки к генам вируса гриппа свиней, циркулирующего на территории Европы и Азии (гены М и ЫА ), а также Северной Америки (НА, ИР, N8). Два гена (РВ2 и РА) практически идентичны генам вируса гриппа североамериканских птиц. И лишь один ген был близок по составу к вирусу гриппа человека(РВ1) [52;68].
Десятилетия вирус гриппа А(НШ1), поражавший североамериканских свиней, который также называют классическим свиным гриппом, мутировал относительно медленно [98]. Но в 1997 году появился новый реассортант вируса гриппа НЗИ2, который содержал 3 гена (НА, ЫА и РВ1) от вируса гриппа человека НЗЫ2 и 5 генов (РВ2, N8, №, М и РА) от классического вируса гриппа НШ1, поражавшего свиней Северной Америки. Спустя некоторое время, были зарегистрированы первые тройные реассортанты. В этих вирусах полимеразные гены РВ2 и РА классического гриппа свиней были заменены на гены вируса гриппа птиц (Рисунок 5) [147].
-35 ~