Молекулярная эволюция и сероэпидемиология энтеровируса 71-го типа на территории Российской Федерации

• Автор: Ахмадишина, Людмила Васильевна
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 84 с. : 9 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Общая характеристика энтеровирусов

1.1.1. Классификация энтеровирусов

1.1.2. Структура и физико-химические свойства вириона энтеровирусов

1.1.3. Структура и реализация генома энтеровирусов и энтеровируса 71 типа

1.1.4. Жизненный цикл энтеровирусов

1.2. Клинические особенности энтеровирусной инфекции

1.3. Клинические особенности ЭВ71 инфекции

1.4. Сероэпидемиология и молекулярная эпидемиология ЭВ71 в мире
1.5. Современные методы детекции и идентификации ЭВ
1.6. Предпосылки для данного исследования
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Использованные штаммы ЭВ71 для реакции нейтрализации
2.2. Использованные клеточные линии для реакции нейтрализации
2.3. Сыворотки людей для реакции нейтрализации
2.4. Референс-сыворотки для реакции нейтрализации
2.5. Условия проведения реакции нейтрализации и определение титра нейтрализующих антител к ЭВ71
2.6. Источники информации о среднем доходе, о численности представителей различных этнических групп и о плотности населения в регионе
2.7. Определение статистической значимости разницы уровней серопозитивности
2.8. Штаммы ЭВ71, выделенные в России и странах СНГ и взятые для исследования филогенетических взаимоотношений
2.9. Определение нуклеотидной последовательности части фрагмента генома энтеровирусов, кодирующего белок УР1
2.10. Определение нуклеотидной последовательности полного фрагмента генома ЭВ71, кодирующего белок УР1
2.11. Электрофорез ПЦР продуктов

2.12. Определение нуклеотидной последовательности
2.13. Анализ полученных нуклеотидных последовательностей
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
1. Результаты молекулярно-биологического исследования штаммов ЭВ71, изолированных на территории Российской Федерации и стран СНГ
2. Изучение состояния популяционного иммунитета к ЭВ71 у здорового населения Российской Федерации
2.1.1. Выбор генотипа ЭВ71 для выполнения серологических исследований
2.1.2. Изучение уровня антител к ЭВ71 (субгенотип С2 штамм 13689) у здоровых детей от 1 до 5 лет на территории Российской Федерации (в шести регионах РФ)
3. Изучение сероэпидемиологии ЭВ71 у детей в г. Хабаровск и Комсомольск-на-Амуре
4. Вспышка энтеровируса 71 типа в Ростове-на-Дону
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Список сокращений
CAV - коксаки А вирус CBV - коксаки Б вирус Е-эховирус
IRES - internal ribosomal entry site, внутренний сайт посадки рибосомы
PV - вирус полиомиелита
RD - линия клеток рабдомиосаркомы человека
ак - аминокислота
АТР - Азиатско-Тихоокеанский регион
ГА-герпангина
нт — нуклеотид
НТО - нетранслируемая область
ОВП - синдром острого вялого паралича
ОТ - реакция обратной транскрипции
ПНР - полимеразная цепная реакция
PH - реакция нейтрализации инфекционности
РНК - рибонуклеиновая кислота
кДНК — комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислота ЭВ71 - энтеровирус 71 типа ЭВИ - энтеровирусная инфекция ЯПЗ - ящуроподобное заболевание

было идентифицировано 28 образцов, 6 из которых были ЭВ71. Один изолят, выделенный в 2000 году, принадлежал к субгенотипу С1, и 5 обнаруженных в 2004 и 2005 гг. были идентифицированы как представители С4 [19].
Великобритания. С 1998 по 2006 год в Англии было собрано 32 изолята от пациентов с кожными и/или неврологическими симптомами, характерными для ЭВ71. Среди изученных 32 образцов после выделения и филогенетического анализа были выявлены представители субгенотипов С1 и С2 [61], циркуляция которых характерна на территории Европы.
Очень любопытное исследование было проведено в Шотландии среди доноров крови. В течение 22 месяцев от 95 доноров были исследованы образцы крови на предмет наличия ЭВ. И 73 образца донорской крови оказались ЭВ положительными, причем ЭВ71 оказался одним из наиболее часто выявляемых вирусов [100].
Нидерланды. Несколько вирусов, датированных 1960-ми гг., были идентифицированы в ретроспективном исследовании в Нидерландах. Так как на момент исследования такой субгенотип не был известен, то вновь полученные штаммы были отнесены к субгенотипу ВО.
В 2007 году на территории Нидерландов было зарегистрировано 58 случаев ЭВ71 инфекции впервые после 21-летнего периода низкой заболеваемости. Всем пациентам потребовалась госпитализация. Это событие стало причиной начала активных исследований эпидемиологии ЭВ71 в Нидерландах.
В 2011 году было проведено масштабное исследование, охватившее 47 летний период циркуляции ЭВ71 на территории Нидерландов с 1963 по 2010 год. Были собраны разные образцы, содержащие ЭВ71, из всех лабораторий, осуществляющих контроль за ЭВ в Голландии. Было установлено, что с 1963 по 1986 год на территории Голландии циркулировали субгенотипы ВО, В1 и В2. В 1984 году был вспышка ЭВ71, вызванная субгенотипом В2, затем происходила смена доминирующего