Генетические факторы при сердечно-сосудистых заболеваниях: идентификация генов кандидатов и фармакогенетика терапии бетаксололом

• Автор: Бровкин, Алексей Николаевич
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 120 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
1. ВВЕДЕНИЕ
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1. Ишемическая болезнь сердца
2.1.1. Основные аспекты этиологии ишемической болезни сердца
2.1.1.1. Атеросклероз - основной этиологический фактор
ишемической болезни сердца
2.1.1.2. Липидный обмен
2.1.2. Патогенез ишемической болезни сердца
2.1.3. Генетические факторы риска ишемической болезни сердца
2.2. Характеристика полиморфных маркеров,
исследованных в работе
2.2.1. Типы полиморфизмов и методы их исследования
2.2.2. Использование полиморфных маркеров в исследовании
генетики мультифакториальных заболеваний
2.2.3. Характеристика полиморфных маркеров гена ШТССі?
2.2.4. Характеристика полиморфных маркеров гена РВРТ
2.2.5. Характеристика полиморфных маркеров гена СЕТР
2.2.6. Характеристика полиморфных маркеров гена ЬРЬ
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. Анализ ассоциации полиморфного маркера С(-1947)Л
гена НАЮСЯ с ишемической болезнью сердца
4.2. Анализ ассоциации полиморфног маркера Є(-198)А
гена ІПЖ77 с ишемической болезнью сердца
4.3. Анализ ассоциаций полиморфных маркеров гена СЕТР
с ишемической болезнью сердца
4.3.1. Анализ ассоциации полиморфного маркера ТсщШ
с ишемической болезнью сердца
4.3.2. Анализ ассоциации полиморфного маркера А(-629)С
с ишемической болезнью сердца
4.3.3. Анализ ассоциации полиморфного маркера І405У
с ишемической болезнью сердца
4.4. Анализ ассоциации полиморфного маркера Б447Х
гена ЬРЬ с ишемической болезнью сердца
5. ВЫВОДЫ
6. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ССЗ - сердечно-сосудистые заболевания
ЛПЛ - липопротеинлипаза
TNF - фактор некроза опухоли
SNP - однонуклеотидные полиморфизмы
STR - короткие тандемные повторы
I/D - полиморфизмы типа вставка/отсутствие вставки
PL — панкреатическая липаза
HL - печеночная липаза
EL - эндотелиальная липаза
NADH - никотинамидадениндинуклеотидфосфат
ДСН - додецилсульфат натрия
dATP - 2’-дезоксиаденозинтрифосфорная кислота
dCTP - 2’-дезоксицитидинтрифосфорная кислота
dGTP - 2’-дезоксигуанозинтрифосфорная кислота
dNTP - 2’-дезоксинуклеозидтрифосфорная кислота
dTTP - 2’-дезокситимидинтрифосфорная кислота
БСА - бычий сывороточный альбумин
ДТТ - дитиотрейтол
DMSO - диметилсульфоксид
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
TEMED - N, N, N’, N’ - тетраметилэтилендиамин
S.D. - стандартное отююнение
ИБС - ишемическая болезнь сердца
ИМ - инфаркт миокарда
ХС - холестерин
ТГ — триглицериды
ХМ - хиломикроны
ЛПОНП - липопротеиды очень низкой плотности
ЛППП - липопротеиды промежуточной плотности Л11НП - липопротеиды низкой плотности ЛПВП - липопротеиды высокой плотности ЛХАТ - лецитин-холестеринацилтрансфераза АХАТ - ацил-КоА-холестеринацилтрансфераза
не всегда являются нейтральными. Таким образом, генетические полиморфизмы и мутации суть явления одного порядка и грань между этими понятиями весьма условна (Cotton R. G. Н., Scriver C.R., 1998).
Полиморфные маркеры могут быть представлены как закрепленными в популяции однонуклеотидными полиморфизмами (SNP — single nucleotide polymorphism), простыми повторами небольших участков нуклеотидов (ди-, три- и тетрануклеотидные повторы, также называемые “микросателлитами”), так и другими модификациями участка генома, например, типа “инсер-ция/делеция” (insertion/deletion, I/D) размером от одного до нескольких десятков нуклеотидов (Баранов B.C., Хавинсон В.Х., 2001)
SNPs (single nucleotide polymorphisms), согласно принятому определению (Brookes A.J., 1999), - это однонуклеотидные позиции в геномной ДНК, для которых в некоторой популяции имеются различные варианты последовательностей (аллели), причём редкий аллель встречается с частотой не менее 1%. Число SNP на ген у человека колеблется от 0 до 29, причем в кодирующих последовательностях гена содержится в среднем по 4 SNP (Cargill М. et al., 1999). В настоящее время эти маркеры активно изучают в геноме человека (Wang D.G. et ah, 1998) для выявления их ассоциаций с различными комплексными заболеваниями (Lander E.S., 1996).
Однонуклеотидные полиморфные участки могут быть локализованы как в некодирующих (интроны, промоторные и регуляторные участки), так и в кодирующих областях генов. Наличие полиморфных участков в регуляторных и промоторных областях может влиять на экспрессию гена. Нуклеотидная замена в кодирующей части гена, в случае, если она приводит к замене аминокислоты в полипептидной цепи белка, может влиять на функциональную активность продукта.
Микросателлиты, обозначаемые так же STR (short tandem repeats) или SSR (simple sequence repeat) - это класс нуклеотидных повторов, включающих от двух до пяти звеньев с размером повторяющегося участка («мотива»)