Биологическое разнообразие вариантов вируса гриппа A у диких птиц Центральной Азии

• Автор: Марченко, Василий Юрьевич
• Шифр специальности: 06.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 155 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
КЛАВ А 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Вирус гриппа А
1.1.1. Строение вириона и структура генома вируса гриппа А
1.1.2. Цикл репродукции вируса гриппа А
1.1.3. Fенетическая изменчивость вируса гриппа А
1.2. Экология вируса гриппа А
1.2.1. Круг восприимчивых к вирусу гриппа хозяев
1.2.2. Роль птиц в распространении вируса гриппа
1.2.2.1. Вирус гриппа у сельскохозяйственных птиц
1.2.2.2. Вирус гриппа у синантропных видов
1.2.2.3. Дикие птицы как природный резервуар вируса гриппа
1.3. Роль Центральной Азии в экологии вируса гриппа А
1.3.1. Физико-географические характеристики
Центральной Азии
1.3.2. Характеристика современной орнитофауны
1.3.3. Центрально-Азиатский пролетный путь
1.4. Заключение по обзору литературы
ЕЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
ЕЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Эпизоотологический мониторинг вируса гриппа А
среди диких птиц Центральной Азии
3.1.1. Характеристика исследованной выборки диких птиц
3.1.2. Вирусологическое исследование
материала от диких птиц
3.2. Некоторые биологические свойства выделенных в работе
изолятов вируса гриппа
3.2.1. Культивирование в системе
развивающихся куриных эмбрионов

3.2.2. Изучение патогенности
изолятов вируса гриппа для кур
3.3. Изучение биологических свойств штамма
A/Herring gull/Mongolia/454/08 (H13N8)
3.3.1. Получение поликлональной сыворотки на штамм Вируса гриппа A/Herring gull/Mongolia/454/08 (HI 3N8)
3.3.2. Приготовление антигенсодержащего диагностического препарата на основе штамма
вируса гриппаА/Herring gull/Mongolia/454/08/ (H13N8)
3.4. Характеризация вируса гриппа H5N1 -субтипа, выделенного
во время эпизоотии среди диких птиц в России в 201 Ог
3.4.1. Изучение патогенности штаммов
вируса гриппа H5N1 -субтипа для кур
3.4.2. Изучение патогенности штаммов
вируса гриппа H5N1-субтипа для мышей
3.4.3. Молекулярно-генетический и филогенетический
анализ штаммов вируса гриппа H5N1-субтипа
3.5. Выявление причины массовой гибели птиц на оз. Тагарское
3.6. Создание коллекции штаммов вируса гриппа А,
выделенных от диких птиц Центральной Азии
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВМЕ - (3-меркаптоэтанол В PL - р-пропиолактон НА - гемагглютинин
IVPI (Intra venous pathogenity index) - индекс патогенности при внутривенном введении
М - матричный белок NA - нейраминидаза NP - нуклеопротеин NS - неструктурный белок РА - полимеразный белок PB 1 - полимеразный белок 1 РВ2 - полимеразный белок
RDA (RNA Dilution Buffer) - буфер для растворения РНК
RLA (RNA Lysis Buffer) - визирующий буфер
RWA (RNA Wash Solution) - промывочный буфер
TSR - template suppression reagent
А.ж. - аллантоисная жидкость
ВВГП - высокопатогенный вирус гриппа птиц
ВГА - вирус гриппа А
ВШ - вирус гриппа птиц
ГАЕ - гемагглютинирующая единица
гРНК - геномная РНК
ДЕ1К- дезоксирибонуклеиновая кислота
кРНК - Р1ТК, комплементарная геномной РНК
ЛД50 - доза, вызывающая 50% гибель
НВГП - низкопатогенный вирус гриппа птиц
ОТ - обратная транскрипция
ПНР - полимеразная цепная реакция
РГА - реакция гемагглютинации
РКЭ - развивающийся куриный эмбрион
РНК - рибонуклеиновая кислота
РНП - рибонуклеопротеин
РТГА - реакция торможения гемагглютинации
С АЖ - стабилизирующий раствор, содержащий 10% сахарозы и 15% желатина
УФ - ультрафиолетовое излучение
ФСБ - фосфатно-солевой буфер
ЦА - Центральная Азия
ЭИД50 - доза, инфицирующая 50% эмбрионов

Утиных. Шилохвость, широконоска, свиязь, чирок-свистунок, чирок-трескунок, красноголовый нырок и хохлатая чернеть, как основные представители семейства Утиные, также являются мигрирующими видами. Ареал их распространения покрывает значительную часть Евразии. И некоторые данные (J. Veen et al., 2005) по возвратам колец показывают, что виды, гнездящиеся на территории Центральной Азии, перемещаются на весьма значительные расстояния от мест гнездования в Центральной Азии к местам зимовок в Западную Европу, Африку, Средиземноморье и Индию.
Так, например, наиболее известный и распространённый вид серая утка, совершает миграции к основным местам зимовок в Иране, Индии, Пакистане и Южном Китае. Серая утка широко распространена в Центральной Азии. Данный вид предпочитает открытые болотистые местности, такие как озера прерий и степей, влажные равнины или болота, окаймленные густой растительностью.
Вышеперечисленные виды имеют очень важное эпизоотическое значение и встречаются во многих исследованиях как основные носители ВГА (R.G. Webster, 1992; Т. Horimoto, Y. Kawaoka, 2001; В. Olsen et al., 2006; W.M. Boyce et al., 2009). Показано, что утки являются носителями, преимущественно, субтипов ИЗ, Н4 и Н6 вируса гриппа, чуть реже, по сравнению с вышеуказанными, у них встречаются субтипы вируса HI, Н2, Н7, НЮ и Н11, выделение Н5, Н8, Н9, Н12 наблюдается лишь в исключительных случаях (В.А. Hanson et al., 2003).
Популяция утиных на территории ЦА представлена подсемейством Гусиные (гуси, лебеди). Представители данной таксономической группы менее многочисленны, а их распространение характеризуются локализованными скоплениями. Некоторые стаи Серого гуся, во время миграции достигали численности в 200 и более особей (В.И. Емельянов, 2004).