Оценка генетического разнообразия лошадей Саяно-Алтайского региона с использованием ядерных и митохондриальных ДНК маркеров

• Автор: Воронкова, Валерия Николаевна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 166 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
Список использованных сокращений
ВВЕДЕНИЕ
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Использование генетических маркеров для изучения генетического
разнообразия пород лошадей
El.l. Биохимические маркеры
1.1.2. Метод амплификации ДНК при помощи полимеразной цепной реакции
1.1.3. Микросателлиты
1.1.4. Полиморфные маркеры, основанные на тестировании
однонуклеотидных замен (SNPs)
1.1.5. Мультилокусные ДНК-маркеры
1.1.5.1. RAPD маркеры
1.1.5.2. Полиморфизм длин продуктов амплификации (AFLP-маркеры)
1.1.5.3. lSSR-фингерпринтинг
1.1.6. Анализ нуклеотидных последовательностей мтДНК
1.2. Лошади и их генетическое разнообразие
1.2.1. Происхождение и одомашнивание лошади
1.2.3. Современное коневодство Российской Федерации
1.2.4. Генетическое разнообразие лошадей
1.2.5. Аборигенные породы лошадей Саяно-Алтайского региона
1.2.5.1. Монгольские лошади
1.2.5.2. Бурятские лошади
1.2.5.З. Тувинские лошади
1.2.5.4. Забайкальские лошади
1.2.5.5. Алтайские лошади
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Объекты исследования
2.2. Реагенты
2.3. Оборудование
2.4. Выделение ДНК
2.5. Определение концентрации выделенной ДНК
2.6. Проведение ПЦР
2.7. Приготовление 2%-ного агарозного геля
2.8. Электрофоретическое разделение продуктов ПЦР
2.9. Определение размера и количества фрагментов в ISSR-ампликонах
2.10. Секвенирование гипервариабельного района мтДНК
2.11. Определение нуклеотидной замены (g.66493737C>T) в гене миостатина методом TaqMan Real-Time PCR
2.12. Статистическая обработка

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Сравнение информативности различных 18813. маркеров
для оценки генетического разнообразия лошадей
3.1.1. Характеристика спектров 18811 фрагментов, полученных
с праймерами к динуклеотидным повторам
3.1.2. Характеристика спектров 18811 фрагментов, полученных
с праймерами к тринуклеотидным повторам
3.2. Оценка генетического разнообразия лошадей с использованием
Я-маркеров
3.3. Анализ нуклеотидных последовательностей Б-петли мтДНК лошадей
3.4. Изучение частоты встречаемости однонуклеотидной замены
.66493737С>Т) в первом интроне гена миостатина (МБТЫ)
Заключение
4. ВЫВОДЫ
Список использованной литературы
Приложение

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
КРС - крупный рогатый скот
ЧКВ - чистокровная верховая порода лошадей
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
мтДНК - митохондриальная ДНК
п.н. - пар нуклеотидов
т.п.н. - тысяч пар нуклеотидов
ПДРФ - RFLP - restriction fragment length polymorphism - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
ПНР - Polymerase Chain Reaction - полимеразная цепная реакция RAPD PCR (или AP-PCR - Arbitrarily Primed PCR) - random amplified polymorphic DNA, polymerase chain reaction - полимеразная цепная реакция со случайными праймерами
DAF - DNA Amplified Fingerprinting - фингерпринтинг на основе амплификации ДНК
УП ПНР - ПЦР с универсальными праймерами
AFLP - amplified fragment length polymorphism - полиморфизм длин амплифицированных фрагментов
ISSR - inter-simple sequence repeat - межмикросателлитный полиморфизм STR (или STMS - Sequence Tagged Microsattelite Site, SSR - simple sequence repeat) - short tandem repeat - короткие тандемные повторы, микросателлиты IRAP - inter-retransposon amplified polymorphism - межтранспозонный полиморфизм
ISAG - the International Society for Animal Genetics - Международное Общество Генетики Животных
PIC - polymorphism information content - полиморфное информационное содержание
AMO VA - analysis of molecular variance - анализ молекулярного разнообразия

(Тульская губерния), Щелковский (до нашего времени не сохранился) (Камбегов и др., 2002).
Придворные конные заводы не обеспечивали лошадьми русскую армию, конские наборы продолжались. Поэтому была начата организация государственных военно-ремонтных заводов. В середине XVIII века в России началась быстрое развитие частного коневодства. Этому способствовал указ об отмене принудительных конских наборов. Однако конезаводчики предпочитали верховым чистокровным породам, более крупных и недостаточно работоспособных.
Оценивая итоги русского коневодства второй половины XVIII века, необходимо признать, что, несмотря на бурный рост численности конных заводов, задача улучшения коневодства в стране осталась невыполненной (Витт, 1992).
В создании первых отечественных заводских пород нужно отметить деятельность Орлова - Чесменского. Сначала свою работу по созданию орловской породы он вел в Подмосковье, но позже завод был переведен в Воронежскую губернию (1776 г.). Причиной этому послужил более суровый климат Подмосковья. В Хреновском заводе орловские рысаки были выведены с использованием, в качестве племенного ядра, арабского жеребца и датских кобыл. Продолжателем Орлова был Шишкин. К 1850 году во всех российских губерниях возникло множество частных рысистых заводов (в том числе Локотской конный завод), их число приближалось к ста. В результате столь бурное развитие коневодства обеспечило дальнейшее процветание рысистой породы.
1834 год - год основания Центрального Московского ипподрома. В 1838 году бега проходили уже в 24 городах. Постепенно совершенствовались и условия испытаний.
Рысаков разводили не специально для спорта, а как высококлассных экипажных лошадей, поэтому и испытывали их в русской дуговой упряжи, зимой в санках, а летом в беговых дрожках. Устраивали и состязания троек.