Эколого-функциональная характеристика гидролитических бактерий термальных и щелочных водных систем Забайкалья

• Автор: Раднагуруева, Арюна Арсалановна
• Шифр специальности: 03.02.08, 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Улан-Удэ
• Количество страниц: 153 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Щелочные водные системы Забайкалья
1Л. 1 Физико-химическая характеристика термальных и щелочных водных систем Забайкалья
1Л .2 Структура и функционирование микробных сообществ экстремальных экосистем
1.2 Адаптация микроорганизмов к экстремальным условиям
1.3 Общая характеристика и классификация гидролитических ферментов
1.3 Л Протеолитические ферменты
1.3.2 Целлюлозолититческие ферменты
1.4 Использование гидролитических бактерий и их ферментов в биотехнологии
1.5 Заключение к литературному обзору 46 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Объекты исследования
2.2. Методы исследования
2.2.1. Физико - химические методы
2.2.2. Методы учета численности и выделения чистых культур гидролитических микроорганизмов
2.2.3. Изучение экофизиологических свойств гидролитических бактерий
2.2.4. Методы молекулярно - генетического анализа
2.2.5. Методы определения внеклеточной протеолитической активности
2.2.6. Методы математического анализа Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ
3.1. Физико-химическая характеристика исследуемых водных систем Забайкалья
3.2. Химический состава донных осадков и микробных матов водных систем
3.3. Численность гидролитических бактерий термальных и щелочных водных систем Забайкалья
3.4. Эколого- биохимическая характеристика донных осадков и микробных матов термальных источников Забайкалья
3.4.1. Внеклеточная протеолитическая активность в нативных пробах
3.4.2. Целлюлазная активность в нативных пробах
3.5. Характеристика филогенетического разнообразия микробного сообщества термальных источников Забайкалья
3.6. Характеристика гидролитических бактерий, выделенных из термальных источников Забайкалья
3.6.1. Морфологическая характеристика гидролитических бактерий
3.6.2. Генотипические свойства и филогенетическое положение куль-тур-продуцентов пептидаз
3.6.3. Экофизиологическая характеристика гидролитических бактерий
3.7. Внеклеточная протеолитическая активность гидролитических бактерий водных систем Забайкалья
3.7.1. Изучение влияния состава среды на внеклеточную протеолити-ческую активность
3.7.2. Изучение субстратной специфичности гидролитических бактерий
3.7.3. Очистка фермента из Paenibacillus dendritiformis штамм Gor-10s
3.7.4. Изучение физико-химических свойств ферментов
3.8. Новая факультативно-анаэробная органотрофная культура Se-1-Ю

АпохуЪасШш ьр. поу
3.8.1. Морфологическая характеристика
3.8.2. Экофизиологическая характеристика
3.8.3. Филогенетическое положение штамма Бе-ЫО
3.8.4. Внеклеточная протеолитическая активность штамма 8е
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОД
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ

собна гидролизовать все пептидные связи белковой молекулы. Будет ли данный фермент действовать или нет, это зависит от природы химических групп, расположенных поблизости от рассматриваемой пептидной связи.
В основу классификации протеолитических ферментов положены следующие критерии:
• строение активного центра и механизм катализа;
• положение пептидной связи в молекуле белкового субстрата, на которую действует данный фермент;
• аминокислотная последовательность и эволюционные связи;
• значение pH, при котором активность фермента максимальна [Barett, 1994; Rao et al., 1998].
В зависимости от механизма действия и строения активного центра выделяют шесть классов протеолитических ферментов: А - аспартильные, S -сериновые, С - цистеиновые, G - глутаминовые, Т - треониновые, М - ме-таллопептидазы и U - пептидазы с неизвестным каталитическим механизмом. Семейства протеолитических ферментов, имеющих общее происхождение, объединяют в кланы.
Аспартильные пептидазы (КФ 3.4.23] - группа протеолитических ферментов, в формировании активного центра которых участвуют два остатка аспарагиновой кислоты (Asp32 и Asp215). Все известные к настоящему времени аспартильные пептидазы относят к эндопептидазам. Большинство изученных ферментов класса аспартильных пептидаз принадлежат к семейству А1 (пепсина), характерному только для эукариотических организмов [Barett, 1995; Rao et al., 1998]; семейство A4 составляют только ферменты, секрети-руемые грибами. Аспартильные пептидазы семейства А1 полностью ингибируются пепстатином, в то время как пептидазы семейства A4 устойчивы к действию этого ингибитора [Monod et al., 2002]. Оптимум действия большинства карбоксильных пептидаз лежит в пределах pH 1,5-5,0. Эти ферменты накапливаются при pH 4,0-4,5 и быстро инактивируются при нейтральных значениях pH [Togni et al., 1991; Rao et al., 1998; Schoen et al., 2002]