+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Разработка системы функциональных молекулярно-генетических маркеров на основе инсерций ALU-ретроэлементов

  • Автор:

    Комков, Александр Юрьевич

  • Шифр специальности:

    03.01.06

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2012

  • Место защиты:

    Москва

  • Количество страниц:

    126 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    499 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы

Оглавление
Список сокращений
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Молекулярные и клеточные особенности онкологических заболеваний
1.1.1. Клеточные особенности канцерогенеза
1.1.1.1. Моноклональная эволюция
1.1.1.2. Поликлональная эволюция
1.1.1.3. «Самораспространение» («самозасеивание»)
1.1.1.4. «Мутаторный фенотип»
1.1.1.5. Раковые стволовые клетки
1.1.2. Реконструкция истории прогрессии опухоли
1.1.3. Системные нарушения
1.1.3.1. Нестабильность генома
1.1.3.2. Митогенное стимулирование
1.1.3.3. Уклонение от апоптоза
1.1.3.4. Репликативное бессмертие
1.1.3.5. Неоангиогенез
1.1.3.6. Метастазированис как неслучайный процесс
1.1.3.7. Уклонение от разрушения иммунной системой
1.1.3.8. Опухолъ-стимулирующее воспаление
1.1.3.9. Репрограммирование схемы метаболизма
1.1.4. Ключевые гены канцерогенеза (онкогены и онкосупрессоры)
1.1.5. МикроРНК
1.1.6. Соматические мутации в онкогенах и онкосупрессорах
1.1.6.1. Единичные замены нуклеотидов
1.1.6.2. Хромосомные аномалии
1.1.6.3. Copy number variations (CNV)
1.1.7. Эпигенетические модификации
1.1.8. Заключение. Спектр альтернативных сценариев канцерогенеза
1.2.4/и-ретроэлементы как потенциальные онкомаркеры
1.2.1. Структура Alu-ретроэлементов
1.2.2. Распространение Alu в геноме

1.2.3. Ретропозиционно активные Alu-элементы
1.2.4. Системы защиты генома от распространения Alu
1.2.5. Функциональная значимость Alu элементов
1.2.5.1. Alu-опосредованные делеции
1.2.5.2. Влияние на транскрипцию генов
1.2.6. Заключение. Инсерции Alu как потенциальные онкомаркеры
ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
2.1 Разработка алгоритма идентификации ретропозиционно активных Л fe-элементов
2.1 Л. Признаки «мастер-генов»
2.1.2. Появление структурно новых инссрций Alu
2.1.3. Алгоритм для идентификации инсерций «мастер-генов»
2.1.4. Анализ транскрипции «мастер-генов»
2.2. Разработка функциональных молекулярно-генетических маркеров
2.2.1. Особенности подхода к функциональному анализу
2.2.2. Разработка системы молекулярно-генетических маркеров
2.2.3. Определение аллельного состояния генов
2.2.4. Аллель-специфический анализ транскрипции
2.2.5. Сравнительный анализ количеств первичных и зрелых транскриптов
2.3. Анализ эффекта «смены матрицы» при обратной транскрипции in vifro
2.3.1. Участие инсерций Alu-элементов в процесс «смены матрицы»
2.3.2. Смена матрицы при синтезе кДНК первичных транскриптов
2.3.3. Стабильность Alu-Alu вторичных структур РНК и «смена матрицы»
2.3.4. Разработка тест-системы для мониторинга эффекта «смены матрицы»
2.3.4.1. Дизайн РНК-матрицы для тестирования обратных транскриптаз
2.3.4.2. Анализ эффекта «смены матрицы» in vitro
2.3.4.3. Анализ эффективности процесса «смены матрицы» in vitro
2.3.5. Заключение
ГЛАВА 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1. Материалы
3.1.1. Оборудование
3.1.2. Расходные материалы
3.1.3. Реактивы
3.1.4. Ферменты
3.1.5. Буферные и другие растворы

3.1.6. Клеточные материалы
3.1.7. Последовательности олигонуклеотидных праймеров
3.1.8. Программное обеспечение и web-ресурсы
3.2. Методы
3.2.1. Фракционирование крови
3.2.2. Выделение геномной ДНК и тотальной фракции РНК
3.2.3. Выделение ядер клеток
3.2.4. Выделение ядерной РНК
3.2.5. Синтез кДНК
3.2.6. ПЦР амплификация геномной ДНК
3.2.7. ОТ-ПЦР амплификация
3.2.8. Поиск диморфных инсерций Alu и дизайн праймеров
3.2.9. Статистический анализ
3.2.10. Подготовка ДНК-матрицы для транскрипции in vitro
3.2.11. Транскрипция in vitro
3.2.12. Расчет вторичных структур РНК
Выводы
Публикации по теме диссертации
Список литературы

онкосупрессорных генов, вследствие чего происходит подавление их транскрипции (Baylin, 2002). То есть метилирование ДНК является одним из способов инактивации онкосупрессоров, а опухоль-специфичные профили метилирования могут использоваться в диагностике онкологических заболеваний.
Уровни экспрессии онкозначимых генов могут также меняться за счет нарушений в системах контроля модификации гистонов. Так, в ряде опухолевых геномов были идентифицированы соматические мутации, влияющие на функционирование и экспрессию генов, которые кодируют ферменты модификации гистонов (Dalgliesh, 2010; van Haaften, 2009).
1.1.8. Заключение. Спектр альтернативных сценариев канцерогенеза.
Среди массива соматических мутаций в опухолевом геноме менее 1 % приходится на функционально значимые - влияющие на структуру или экспрессию генов. Часть таких мутаций активирует онкогены и инактивирует онкосупрессоры, приводя к нарушениям в ключевых системах регуляции функционирования нормальной клетки. Онкозначимые геномные нарушения постепенно накапливаются, предоставляя трансформированной клетке селективные преимущества по отношению к окружающим здоровым клеткам. В результате такого многостадийного процесса формируется зрелая опухоль, клеточная структура которой может быть как гомогенной, так и гетерогенной, в зависимости от модели, согласно которой протекал канцерогенез. Несмотря на то, что за формирование опухолевого фенотипа отвественно достаточно ограниченное число изменений в регуляторных системах клетки, число возможных сценариев развития рака может быть достаточно большим. Это должно быть связано с последовательностью появления нарушений в регуляторных системах клетки, со способом разрушения регуляторных путей (существованием нескольких ключевых генов) и множеством возможных онкозначимых мутаций, обладающих сходным канцерогенным значением. Таким образом, несмотря на существование общих принципов канцерогенеза, сценарий приобретения клетками малигнизированного фенотипа в каждом случае уникален. Индивидуальная история малигнизации клеток находит отражение в клеточной структуре опухоли и массиве накопленных соматических мутаций. «Драйверные» мутации являются маркерами онкогенов и онкосупрессоров, а «пессенджерные» могут быть использованы в качестве маркеров для анализа клональной структуры опухоли и идентификации доминирующих или наиболее агрессивных опухолевых клонов. Мутации, активирующие онкогены, и некоторые из «пессенджерных» мутаций, маркирующих доминирующие клоны, могут рассматриваться как селективные онкомаркеры и потенциальные мишени для генной терапии.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Время генерации: 0.112, запросов: 967