Исследование молекулярной природы семейной гиперхолестеринемии среди жителей Петрозаводска и Санкт-Петербурга

• Автор: Комарова, Татьяна Юрьевна
• Шифр специальности: 03.01.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 108 с. : 30 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Семейная гиперхолестеринемия. Клиническая характеристика
заболевания
1.2 Классификация моногенных гиперхолестеринемий
1.2Л Рецептор ЛНП
1.2.2 Аполипопротеин В-100 (Аро В-100)
1.2.3 PCSK9
1.2.4 ARH
1.2.5 NPC1L1
1.3 Рецептор ЛНП и ген рецептора ЛНП
1.3.1 Клеточный цикл рецептора ЛНП
1.3.2 Структура гена рецептора ЛНП и кодируемого им белка
1.3.3 Регуляция транскрипции гена рецептора ЛНП
1.3.4 Мутации в гене рецептора ЛНП
1.4 Спектры мутаций в гене рецептора ЛНП в разных популяциях
1.5 Лечение пациентов с гиперхолестеринемией
1.5.1 Ингибиторы ГМГ-КоА редуктазы (статины)
1.5.2 Эзетимиб
1.5.3 Секвестранты желчных кислот
1.5.4 Новые направления в медикаментозной терапии
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Пациенты
2.2 Выделение ДНК из замороженной крови
2.3 Молекулярное клонирование
2.3.1 Лигирование
2.3.2 Трансформация E
2.3.3 Выделение плазмидной ДНК из клеток E

2.4 Амплификация и анализ ДНК
2.4.1 Полимеразная цепная реакция
2.4.2 Мультиплексная ПЦР
2.4.3 Метод искусственного создания сайта рестрикции с помощью ПЦР
2.4.4 Электрофорез продуктов амплификации ДНК в полиакриламидном
геле (ПААГ)
2.4.5 Электрофорез в ПААГ в денатурирующих условиях
2.4.6 Электрофорез ДНК в агарозном геле
2.4.7 Окрашивание образцов ДНК
2.4.8 Гетеродуплексный анализ
2.4.9 SSCP-анализ
2.4.10 ПДРФ-анализ
2.4.11 Очистка ДНК из агарозного геля
2.4.12 Анализ последовательностей ДНК
2.5 Статистическая обработка данных
3 РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1 Общая стратегия исследования
3.2 Обнаруженные мутации в гене рецептора ЛНП
3.2.1 Мутация с.58 G>А
3.2.2 Мутация с. 195-196insT
3.2.3 Мутация с. 192 dell0/ins8
3.2.4 Мутация с.618 Т>С
3.2.5 Мутация c.925-931del7
3.2.6 Мутация с. 1194 С>Т
3.2.7 Мутация с. 1340 C>G
3.2.8 Мутация с.1532 Т>С
3.2.9 Мутация c.l686del8/insT
3.2.10 Мутация с. 1936 С>А
3.2.11 Мутация с. 1920 ОТ

3.2.12 Мутация с.2191 сІеЮ
3,3 Обнаруженные полиморфизмы в гене рецептора ЛНП
3.3.1 Полиморфизм с. 1171 в>А
3.3.2 Полиморфизм с. 1413 в>А
3.3.3 Полиморфизм с. 1617 ОТ
3.3.4 Полиморфизм С.17730Т
3.3.5 Полиморфизм с.1959 ОТ
3.3.6 Полиморфизм с.2232 й>А
4 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

построена еще одна гистограмма, показывающая количество мутаций на одну пару нуклеотидов в экзонах гена, представленная на рисунке 1.9. Оказалось, что больше всего мутаций приходится на экзон 3, а меньше всего на экзоны 15 и 18, но в целом плотность мутаций в экзонах гена рецептора ЛНП можно считать равномерной.
Рисунок 1.8 — Число мутаций, приходящихся на разные экзоны гена рецептора ЛНП
Рисунок 1.9- Плотность мутаций в экзонах гена рецептора ЛНП, рассчитанная на одну пару нуклеотидов