Принципы генетической идентификации популяций тихоокеанских лососей рода Oncorhynchus spp. в связи с задачами рационального промысла

• Автор: Варнавская, Наталья Васильевна
• Шифр специальности: 03.00.15, 03.00.10
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 329 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение
Глава 1. ОБЪЕКТ ИССЛЕДОВАНИЙ, МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1.1. Краткая характеристика биологии объекта исследований - лососей Опсогкупскив

1.1.1. Исследованные виды тихоокеанских лососей, их ареал, промысловое значение и особенности жизненного цикла
1.1.2. Внутривидовая дифференциация по скорости роста, возрасту, продолжительности пресноводного и морского периодов жизни
1.1.3. Экологические формы и генерации у тихоокеанских лососей
1.1.4. Структура нерестовых скоплений и хоминг у тихоокеанских лососей
1.2. Материалы
1.2.1. Посемейный анализ генетического контроля изозимов лососей
1.2.2. Материалы, характеризующие генное разнообразие нативных популяций тихоокеанских лососей
1.2.3. Материалы для идентификации смешанных уловов лососей в Тихом Океане и сопредельных морях
1.2.4. Реперные базы генетических данных, использованные для идентификации смешанных уловов в Тихом океане и сопредельных морях
1.2.5. Материал для оценки действия отбора с помощью показателей Ра
1.2.6. Анализ влияния отбора на рыб с разными генотипами по белковым генам ..
1.3. Методы
1.3.1. Методика сбора проб и оценки биостатистических параметров выборок
1.3.2. Методы отлова лососей в открытых районах Тихого океана и сопредельных морей
1.3.3. Биохимические методы выявления изменчивости белков и ферментов
1.3.4. Методы математической статистики
1.3.5. Методы исследования отбора с помощью показателей Ря
1.3.6. Экспериментальная оценка действия экстремальных температур в эмбриональный период на выживаемость потомств с разными генотипами по ферментным генам
1.3.7. Метод идентификации нативных стад в смешанных уловах (МЬЕ-метод)

Глава 2. СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА В ПОПУЛЯЦИЯХ ТИХООКЕАНСКИХ ЛОСОСЕЙ
2.1. Изозимы и изменчивость контролирующих их генов у тихоокеанских лососей
2.1.1. Картины электрофоретического разделения ферментных систем тихоокеанских лососей и их генетическая интерпретация
2.1.2. Доля полиморфных генов у разных видов тихоокеанских лососей
2.2. Межпопуляционная вариабельность генных частот и средняя гетерозиготность .
2.2.1. Характер вариабельности генных частот в популяциях
2.2.2. Средняя гетерозиготность в популяциях лососевых рыб
2.2.3. Зависимость уровня гетерозиготности от структуры и функций ферментов
2.3. Различия генных частот в регионах побережья Тихого океана
2.3.1. Клинальная изменчивость в популяциях тихоокеанских лососей
2.3.2. Генетическая гетерогенность внутри и между региональных групп популяций
Глава 3. ВНУТРИВИДОВАЯ ДИВЕРГЕНЦИЯ И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ МИГРАЦИЯ В ПОПУЛЯЦИЯХ ТИХООКЕАНСКИХ ЛОСОСЕЙ
3.1. Оценка генетических расстояний между популяциями
3.1.1. Генетическая дивергенция популяций горбуши
3.1.2. Генетическая дивергенция популяций кеты
3.1.3. Генетическая дивергенция популяций нерки
3.2. Генетическая миграция как мера популяционной структуры вида
3.2.1 Поток генов между популяционными комплексами
3.2.2. Иерархическая структура популяционной организации у тихоокеанских лососей
Глава 4. ВЫЯВЛЕНИЕ ДЕЙСТВИЯ ОТБОРА НА БИОХИМИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ
У ТИХОКЕАНСКШЛОСОСЕЙ
4.1. Оценки направления действия отбора методами Г-статистики
4.1.1. Определение эффективной численности элементарных популяций
4.1.2. Генетическая гетерогенность нерестовых скоплений тихоокеанских лососей
4.1.3. Возможные уровни миграции между элементарными популяциями у тихоокеанских лососей

4.1.4. Оценка направления и интенсивности отбора методом сравнения теоретических и эмпирических значений Fa
4.2. Изучение действия отбора методом анализа распределений частот аллелей и генотипов в природных популяциях
4.2.1. Распределения аллельных частот по 23 генам в 41 выборке из популяций Азии горбуши линии нечетных лет
4.2.2. Сравнение эмпирических рапределений гетерозиготных генотипов с теоретически ожидаемыми по формуле Харди-Вейнберга-Кастла
4.3. Экспериментальные исследования отбора методами посемейного генетического анализа
4.3.1. Выживаемость потомств горбуши в условиях оптимальных и экстремальных температур
4.3.2. Выживаемость потомств с разным уровнем гетерозиготности родителей
4.3.3. Выживаемость потомств с разными генотипами по ферментным генам
4.3.4. Оценки коэффициентов отбора и средней приспособленности генотипов по ферментным ло кусам
4.3.5. Зависимость скорости развития потомств от генотипов по ферментным локусам
Глава 5. ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ СМЕШАННЫХ УЛОВОВ ЛОСОСЕЙ В ТИХОМ ОКЕАНЕ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ МОРЯХ
5.1. Анализ симулированных смешанных выборок
5.1.1. Анализ разрешающей способности баз генетических данных
5.1.2. Выявление минимальных объемов смешанной выборки для получения достоверных оценок
5.2. Дифференциация смешанных уловов лососей в Тихом океане и в Охотском море
5.2.1. Выявление происхождения выборок горбуши из уловов 1994 в Охотском море
5.2.2. Выявление распределения и путей миграции молоди горбуши из различных районов воспроизводства на акватории Охотского моря
5.2.3. Дифференциация смешанных уловов горбуши линии нечетных лет в российской 200-мильной экономической зоне Тихого океана
зованы для построения дендрограмм и анализа изменчивости методом многомерного шкалирования.
Таблица 1,11. Локализация и объем выборок производителей кеты из популяций Азии,
использованных для идентификации морских уловов в 1997-98 г. по 40 генам (база №5)
Регион ІЛІі выборки| Популяция | Число рыб Год
Чукотка 1 Анадырь 160 1
Восточная Камчатка 2 Карага 40 1
3 Камчатка 160
4 Адриановка 40 1
5 оз. Нерпичье 80 1
6 Авача 50 1
Западная Камчатка 7 Утка 80 1
8 Кихчик 80 1
9 Коль 100 1
10 Пымта 160
11 Воровская 160 1991,
12 Хайрюзова 160 1990,
Северное побережье 13 Пенжина 240 1
Охотского моря 14 Туманы 80 1
15 Ола 80 1
16 Тауй 50 1
Бас. р. Амур 17 Амур 50 1
Приморье 24 Суйфун 25 1
18 Авакумовка 35 1
19 Нарва 50 1
20 Рязановка 50 1
Сахалин 21 Калининка 50 1
22 Найба 60 1
23 Ударница 100 1
Япония 25 Мазухоро 80 1
26 Токоро 100 1
27 Токушибетсу 47 1
28 Шари 100 1
29 Шибетсу 100 1
30 Нишибетсу 100 1
31 Читоз1 100 1
32 Читоз2 80 1
33 Тешио 97 1
34 Гакко 39 1
35 Миомоте 100 1
36 Окава 100 1
37 Цугаруиши 100 1
38 Юррапу 100 1
39 Токачи 180
40 Куширо 100 1
Итого 3663 1987-1