Программный комплекс для прогнозирования свойств сложных органических соединений на основе анализа неоднозначных зависимостей "структура-свойство"

• Автор: Боридко, Владимир Станиславович
• Шифр специальности: 05.13.16
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 106 с. : ил.

1.1 Традиционные методы исследования зависимостей структурасвойство

1.2 ИССЛЕДОВАНИЯ ЗАВИСИМОСТЕЙ СТРУКТУРАСВОЙСТВО ДЛЯ КОНФОРМАЦИОННО ГИБКИХ СОЕДИНЕНИЙ.

1.3 Математические методы построения моделей зависимости структура свойство

1.4 Прогнозирование свойств сложных органических соединений на основе исследования

НЕОДНОЗНАЧНЫХ ЗАВИСИМОСТЕЙ СТРУКТУРА СВОЙСТВО

КРАТКИЕ ВЫВОДЫ.

ГЛАВА 2. АЛГОРИТМЫ ФОРМИРОВАНИЯ ГИПОТЕЗ О НЕОДНОЗНАЧНЫХ ЗАВИСИМОСТЯХ СТРУКТУРА СВОЙСТВО

2.1 АЛГОРИТМЫ ВЫБОРА ЗНАЧИМЫХ ИНДЕКСОВ.

2.2 ПОСТРОЕНИЕ ГИПОТЕЗ ОБ ИНТЕРВАЛАХ ЗНАЧЕНИЙ АКТИВНОСТИ НОВОГО ВЕЩЕСТВА.

2.3 МЕТОДИКА ПРОГНОЗИРОВАНИЯ СВОЙСТВ СЛОЖНЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ НА ОСНОВЕ УСТАНОВЛЕНИЯ НЕОДНОЗНАЧНЫХ ЗАВИСИМОСТЕЙ СТРУКТУРАСВОЙСТВО.

КРАТКИЕ ВЫВОДЫ.

ГЛАВА 3. ПРОГРАММНЫЙ КОМПЛЕКС ДЛЯ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ СВОЙСТВ СЛОЖНЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ НА ОСНОВЕ УСТАНОВЛЕНИЯ НЕОДНОЗНАЧНЫХ ЗАВИСИМОСТЕЙ СТРУКТУРАСВОЙСТВО
3.1 Назначение и архитектура комплекса. Выбор среды реализации.
3.2 Фиксация двумерной структуры молекул отобранных соединений. Генерация трехмерных структур исследуемых молекул.
3.3 Оптимизация трехмерных структур молекул отобранных соединений по энергетическим критериям. Расчет индексов.
3.4 ВЫБОР ЭНЕРГЕТИЧЕСКИ приемлемых конформеров. подготовка данных для формирования ГИПОТЕЗ
3.5 Выбор значимых индексов
3.6 ПОСТРОЕНИЕ Г ИПОТЕЗ О ЗАВИСИМОСТИ СТРУКТУРА СВОЙСТВО. ТЕСТИРОВАНИЕ ГИПОТЕЗ МЕТОДОМ СКОЛЬЗЯЩЕГО КОГГГРОЛЯ
КРАТКИЕ ВЫВОДЫ.
ГЛАВА 4. ПРИМЕНЕНИЕ ПРОГРАММНОГО КОМПЛЕКСА ДЛЯ ПРОГНОЗИРОВАНИЕ ИНТЕРВАЛОВ ЗНАЧЕНИЙ СВОЙСТВ СЛОЖНЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ
4.1 ПРОГ НОЗИРОВАНИЕ АНТИВИЧ АКТИВНОСТИ НЕНУКЛЕОЗИДНЫХ ИНГИБИТОРОВ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПТАЗЫ
4.2 ПРОГНОЗИРОВАНИЕ ХРОМАТОГРАФИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ПРОИЗВОДНЫХ ПОРФИРИНА
4.3 ПРОГНОЗИРОВАНИЕ СТЕПЕНИ АДСОРБЦИИ И МАКСИМУМА ПОГЛОЩЕНИЯ ТИАМОНОМЕТИНЦИАНИНОВ КРАТКИЕ ВЫВОДЫ.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ЛИТЕРАТУРА


Эти индексы в целом иногда называют индексами реакционной способности, так как в соответствии с представлениями теории граничных молекулярных взаимодействий способность молекул реактантов образовывать переходное состояние зависит от параметров граничных орбиталей НСМО и ВЗМО, а также от атомных суперделокализуемостей и поляризуемостей . Эти индексы также рассчитываются программами оптимизации. Важно отметить, что метод молекулярной механики в чистом виде не позволяет рассчитывать эти индексы. Лишь специальные модификации метода молекулярной механики могут приближенно рассчитывать заряды атомов и энергии граничных орбиталей . Индексы реакционной способности напрямую коррелируют с такими свойствами, как, например, различные виды биологической активности острой токсичностью, способностью образовывать комплексы с переносом заряда, мутагенной активностью и многими другими . В качестве индексов могут применяться и так называемые индикаторные переменные, которые принимают значение 1 или 0 в зависимости от того, присутствует ли в структуре молекулы тот или иной фрагмент . Такие дескрипторы получаются путем разбиения молекулы на фрагменты, каждому фрагменту присваивается номер и если в молекуле есть такой фрагмент, то соответствующая индикаторная переменная приравнивается единице, иначе нулю. На основании таких индексов можно прогнозировать разнообразные физикохимические свойства молекул, в основном связанные с наличием или отсутствием тех или иных функциональных групп и их сочетаний. После расчета индексов молекула может быть описана как вектор данных А, 1, Ь,. А активность, й индекс.