Молекулярно-генетическая идентификация хламидий, выделенных от животных

• Автор: Бакиров, Ильяс Хасанович
• Шифр специальности: 16.00.03, 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Казань
• Количество страниц: 148 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Таксономическое положение хламидий.

1.2. Биологические свойства хламидий

1.2.1. Фенотипическая характеристика.

1.2.2. Геномика хламидий.

1.3. Бактериоскопические, вирусологические и иммунологические методы диагностики хламидиоза.

1.4. Молекулярногенетическая диагностика хламидиоза

1.4.1. ПЦРдиагностика хламидийных инфекций

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Штаммы хламидий, подопытные животные и клинический материал
2.2. Очистка и концентрирование хламидий, выделение ДНК.
2.3. Полимеразная цепная реакция
2.4. Анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов продуктов амплификации фрагментов ДНК хламидий.
2.5. Секвенирование участков генома хламидий и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей.
2.6. Выделение и идентификация нового штамма хламидий.
2.7. Изучение биологических свойств изолированного штамма хламидий
2.7.1. Патогенность
2.7.2. Токсичность.
2.7.3. Антигенность
2.7.4. Иммуногенность
2.8. Серологические реакции.
2.9. Статистическая обработка результатов исследований
3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Молекулярногенетические исследования штаммов хламидий.
3.1.1. Индикация хламидий в ПЦР по локусу отр1гена с праймерами 5вРЕ и ЗвРВ и их идентификация путем анализа ПДРФ.
3.1.2. Индикация хламидий в ПЦР по локусу ошр2гена с праймерами
СЫ и СЬ2 и их идентификация методом анализа ПДРФ
3.2. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей секвенированных штаммов
3.3. Выделение нового штамма хламидий от кошек.
3.4. Биологические свойства вновь выделенного штамма хламидий
3.4.1. Патогенность изолята хламидий для куриных эмбрионов, лабораторных животных и кошек.
3.4.2. Токсичность штамма хламидий изолированного от кошек
3.4.3. Антигенные свойства изолята хламидий.
3.4.4. Иммуногенные свойства изолята хламидий.
3.5. Молекулярногенетические исследования нового штамма хламидий
4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ.
5. ВЫВОДЫ
6. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


Основные положения диссертации доложены на Научнопрактической конференции Ветеринарная медицина домашних животных Казань, и гг. Ежегодных итоговых заседаниях проблемных советов ФГОУ ВПО Казанская академия ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана гг. Научнопрактической конференции молодых ученых ФГОУ ВПО Казанская академия ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана Казань, г. Публикация результатов исследований. Объем и структура диссертационной работы. Диссертация изложена на 3 страницах компьютерного текста текстовый редактор i , стиль i , размер шрифта пт, интервал полуторный и включает введение, обзор литературы, материалы и методы исследований, результаты собственных исследований 4 главы, обсуждение результатов исследования, выводы, практические предложения и указатель литературы всего 0 источников, в том числе 8 иностранных и ссылок на сайты I. Диссертация иллюстрирована таблицами и 9 рисунками. Прилагаются документы, подтверждающие научнопрактическую ценность работы. В году американский ученый 7 пересмотрел все имеющиеся названия возбудителей группы пситтакозалимфогранулемытрахомы ПЛТ и предложил выделить их в самостоятельный порядок и включить в единый род i. По мере изучения хламидий возникла необходимость определить их место в систематике. Возбудители данной группы инфекционных болезней имеют ряд свойств, характерных для вирусов облигатный внутриклеточный паразитизм способность проходить через фильтры, задерживающие бактерии образование внутриклеточных включений. Исходя из этого, первоначально хламидии считали крупными атипичными вирусами , ,5. Дальнейшие исследования показали сходство хламидий с бактериями содержат две нуклеиновые кислоты ДНК и РНК, способ размножения на определенном этапе происходит путем деления, чувствительны к сульфаниламидам и антибиотикам, имеют клеточную стенку, грамотрицательны и т. Международной ассоциации Микробиологических обществ отнесла хламидии к бактериям отряда i, семейства i, рода i. Внутри рода хламидии были разделены на два вида i. i. Первый вид объединял патогенные для человека возбудители трахомы и болезней половых органов, второй возбудителей, вызывающих орнитоз и пситтакоз у человека, а также различные болезни у домашних, сельскохозяйственных и диких животных 8. В г. i. i. i. i. В г. v . . с соавт. Согласно их классификации Порядок i включает четыре семейства i, ii, i и i. Семейства i подразделяется на два рода i и i 7,5,0, 1,2,8. i. i. i. . . . . . . В соответствии с измененной классификацией типовым представителем рода i попрежнему является i. Два новых вида i. i. i, проявляют большее генетическое гомологии по последовательности и рРНК генов и фенотипическое сходства с i. i 7, 5, 7, 1. Род i составляют уже известные виды . . . . . . . i прежнее название i является исключительно возбудителем заболеваний животных. Несколько штаммов . i i прежнее название i i рассматривается в основном как респираторный возбудитель. Этот вид имеет три биовара , название которого произошло от слияния двух первых букв в обозначении штаммов, выделенных у людей, 3 и 7, 9, коала и конский, названия которых связаны с источником выделения штаммов. Согласно описанию . . 8, 9, 0, 1, вид i ii включал 4 группы возбудителей, которые существенно отличались как генетически, так и фенотипически, вызывая различные заболевания у человека и животных. В новой классификации . i названа по основному симптому, вызываемому этим возбудителем. Этот вид распространен среди жвачных животных и в основном колонизирует плаценту. Спорадические аборты, которые были вызваны .