Усовершенствование методов выделения, идентификации и индикации бактерий Pseudomonas putida

• Автор: Викторов, Денис Александрович
• Шифр специальности: 03.02.03, 03.01.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Саратов
• Количество страниц: 155 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Развитие классификации бактерий рода .

1.2. Характеристика семейства .

1.2.1. Род

1.2.2. Характеристика отдельных видов и групп бактерий рода .

1.2.3. Морфологические, культуральные и физиологобиохимические признаки псевдомонад

1.3. Биологические свойства бактерии i.

1.3.1. Клеточная структура и метаболизм i

1.3.2. Значение бактерии i и е применение в биотехнологии.

1.4. Псевдомонозы карповых рыб

1.5. Микробиологические методы идентификации бактерий рода .
1.5.1. Ход микробиологического исследования.
1.5.2. Питательные среды, применяемые длявыделения и идентификации псевдомонад.
1.6. Фагодиагностика бактерий.
1.6.1. Биологические свойства и особенности бактериофагов i
1.6.2. Взаимодействие бактериофагов с клетками хозяина
1.6.3. Реакция нарастания титра фага РНФ
2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
2.1. Объект, материалы и методы.
2.2. Результаты собственных исследований и их обсуждение
2.2.1. Тинкториальные свойства клеток i
2.2.2. Рост референсштаммов i на стандартных средах
2.2.3. Основные биохимические свойства референсштаммов i
2.2.4. Антибиотикочувствительность референсштаммов i.
2.2.5. Исследование отношения референсштаммов i
к температуре культивирования.
2.2.6. Конструирование среды накопления АУГСХА.
2.2.7. Конструирование плотной селективной среды УГСХА
2.2.8. Подбор тестов бактериологической дифференциации
2.2.8.1. Разработка теста на способность i к росту
в присутствии солей двухвалентного бария
2.2.8.2.1Геста на способность i к разжижению желатина.
2.2.9. Разработка бактериологической схемы выделения и идентификации i.
2.2 Основные биохимические свойства выделенных штаммов i.
2.2 Выделение бактериофагов i
2.2 Характеристика выделенных фагов i
2.2 Разработка технологических параметров изготовления и контроля индикаторных бактериофагов i
2.2 Разработка оптимальных условий постановки реакции нарастания титра фага.
2.2 Использование РНФ для индикации бактерий i в объектах внешней среды.
2 Исследование с помощью РНФ прудовой воды, контаминированной бактериями i
2 Исследование с помощью РНФ патологического материала рыб, контаминированного бактериями i
2 Исследование с помощью РНФ овощей,
контаминированных бактериями i
Заключение
Список использованных литературных источников.
Приложения
Список условных сокращений
атм. атмосфера АТФ аденозингрифосфат ВАК Высшая Аттестационная Комиссия ВСА висмут сульфит агар ВСЭ ветеринарносанитарная экспертиза Г гуанин
ГИСК им. Л.А. Тарасовича Государствешшй научноисследовательский институт стандартизации и контроля медицинских биологических препаратов имени Л.А. Тарасевича
ГСХА Государственная сельскохозяйственная академия ГНЦ гематологический научный центр гкг грамм на килограмм ч
гл грамм на литр
ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота КОЕ колониеобразующие единицы ЛГТС липополисахарид м.к. микробная клетка
м.к.мл количество микробных клеток в 1 мл
м.к.г количество микробных клеток в 1 г
мкм микрометр
МПА мясопептонный агар
МПБ мясопептонный бульон
НПО научнопроизводственное объединение
ОФ окислениеферментация
РНФ реакция нарастания тизра фага
УФ ультрафиолет
Ц цитозин
ЦПХ цетилперидиния хлорид КЕЮР 2кето3деоксиглюконат6фосфат
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


По теме диссертации опубликовано 9 работ, из них 1 статья в журнале, рекомендованном ВАК РФ. Диссертация состоит из введения, двух глав обзора литературы, собственных исследований, состоящих из объекта, материалов и методов, результатов исследования и их обсуждения, заключения, выводов, практических предложений, списка использованных литературных источников, приложений. Материалы диссертации изложены на 5 страницах, включают таблицы и рисунок. Список использованных литературных источников включает 9 наименований, в том числе 7 зарубежных. Род описан . Наряду с родами i и i он был включен в состав семейства i. В описании рода, опубликованном в г, клетки бактерий характеризовались как цилиндрические, длинные или короткие иногда образующие небольшие нити, движущиеся с помощью полярных жгутиков число которых на одном полюсе колеблется от 1 до , чаще 1 или , спорообразование редко. То есть, первая классификациябактерий рода строилась на их морфологии, подвижности, характере расположения жгутиков. Среди видов рода первым был описан i . В начале прошлого столетиязначительный вклад в изучение рода внесли исследования . Используя различные органические соединения в качестве источников углерода, было выделено большое количество штаммов псевдомонад. Была показана способность выделенных бактерий к. Сделаны важные обобщения в области физиологии, экологии и систематики рода . Предложены новые подходы, к изучению псевдомонад, описан новый вид . В 1м издании определителя Берджи род был включен в порядок , семействоi, трибу i. Основное внимание в описании рода уделялось пигментам. Этот акцент сохранился во м изданиях. В 5м издании тезис . Однако характер нигментообразования долгое время оставался одним из важных критериев. Авторы 7го издания Берджи , , i, поместили род вместе с родами X и в семейство . Последнее описано С. Е. i в г. По определителю Берджи род представлял собой группу видов, оставшихся после исключения других родов. Последние были объединены в порядок . Определитель содержал описание 9 видов в том числе флюоресцирующих. Некоторые из них отличались образованием характерного пигмента пиоцианина, хлорорафина. Однако большинство видов было охарактеризовано крайне фрагментарно, а приведенные в определителе немногочисленные и малосущественные для идентификации признаки не позволяли различать эти виды. Классификационнаясхема 7го издания Берджи сохранена в определителе v , где описано 7 видов в том числе фитопатогенных. В определителе Н. А. Красильникова было описано более двухсот видов одних только флюоресцирующих бактерий. Периодом накопления экспериментальных данных, характеризующих с различных сторон биологические свойства бактерий рода явились е годы. М.Е. Удалось выделить группу, образованную штаммами . В свойствах остальных культур была обнаружена широкая гамма переходов. М.Е. Для описания рода и . М.Е. Было показано, что многие флюоресцирующие виды, описанные в 7м издании Берджи Р. Р. iii и др. Согласно М. Е. , штаммы . Последующие е годы знаменовались внедрением в микробиологию вычислительной техники и методов нумерической таксономии. Одна из первых работ в этой области принадлежит О. Н. Ii и К. Коллекция из 2 штаммов была разделена ими на три группы согласно экологии, характеру пигментации и некоторым физиологическим свойствам. О. . Более 0 штаммов, в том числе 4 штамма5, i, были изучены этим автором по признакам. Подробно охарактеризованы типовой вид рода . Изученная коллекция микроорганизмов была разделена О. Первуюгруппу составили штаммы . Работа О. Однако полученные выводы касались только флюоресцирующих бактерий. Кроме того, О. Важные описания были сделаны для видов . V i, , , . Ii, , . Классификация рода оставалась неупорядоченной, идентификация видов неразработанной. Данные о биологии псевдомонад и все более широкое использование в микробиологии биохимических методов исследования подготовили основу для ревизии рода , осуществленной в г. М. , В г. Успеху работы способствовало привлечение большого количества микробиологических, биохимических, генетических и других методов.