Полиморфизм электрофоретических кариотипов макронуклеуса у видов-двойников комплекса Paramecium aurelia (ciliata)

• Автор: Некрасова, Ирина Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.25
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 173 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Видыдвонники у инфузорий и методы их исследования

Наиболее известные вильтдвойники у инфузорий

ii.
i ii
i . ii
i iii.
i
i ii
Географическое распределение видовдвойников
Методы, используемые для сравнительного изучения
видовдвойников.
Мзоферментный анализ
.
Гибридизация i i
Филогенетический анализ и секвенирование нуклеотидных
последовательностей.
Гетероморфный ядерный аппарат инфузорий как критерий для сравнения и возможная причина возникновения видов
двойников.
Организация ядерного аппарата инфузорий
Два типа ядер.
Организация генома МАК
Электрофоретический анализ генома МАК как метод сравнительного
исследования видовдвойников у инфузорий
Электрофорез
Пульсэлектрофорез.
ЦЕЛИ И ЗАДАЧИ.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
I. Материалы
Использованные культуры.
II. Методы
1 Методы лабораторной работы с инфузориями
Культивирование
Синхронизация
2 Окраска препаратов по Фльгену.
3 Пульсэлектрофорез
Приготовление препаратов для НЭФ
Проведение ПЭФ
4. Гибридизация по Саузерну
Полимеразная цепная реакция.
Гибридизация по Саузерну
Детекция сигнала
РЕЗУЛЬТАТЫ.
Сравнительное исследование геномов
макронуклеусов представителей комплекса . i
методом ПЭФ.
Влияние старения МАК на ПЭФпрофили.
ПЭФпрофнли МАК представителей комплекса . i
. ii.
. ii
. ii.
. i
. i
. xi
. i.
. i.
. vi.
. i.
. i.
. i.
. i.
. i.
. ii
Гибрндизация по Саузерну.
Г н кальмодулина
Повтор Р6.
Гены минихромосомы 1 . i
2 I
.
Гены минихромосомы 2 . i
.
ОБСУЖДЕНИЕ
ПЭФпрофиль является постоянной характеристикой каждого клона и отражает реальное распределение молекул ДНК в МАК
Получаемые электрофоретические кариотипы
являются электрофоретическими кариотипами МАК
Природа полос в ПЭФпроФштях . i
Результаты гибридизации по Саузерну
Влияние старения МАК на ПЭФпроФили
Электрофоретические кариотипы МАК видовдвойников комплекса Р, i
Внутривидовой полиморфизм ПЭФпрофилей.
Межвидовой полиморфизм ПЭФпрофилей
Сопоставление полученных данных с данными
о других видахдвойниках у инфузорий.
Причины возникновения изменений в ПЭФпрофилях Две возможные причины возникновения изменений
в сгруктуре ПЭФпрофилей.
Г ибрндизация по Саузерну
Электрофоретический кариотип МАК как
филогенетический маркер
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Если в дальнейшем две популяции встретятся, у образованных гибридов может возникать сочетание аллелей тогда такие гибриды будут стерильными или нежизнеспособными. В реальных же условиях в процесс возникновения репродуктивной изоляции могут быть вовлечены не две, а множество аллелей в различных локусах Огг, . Для трех видов дрожжей, vii, ii и i , был показан механизм возникновения репродуктивной изоляции и видообразования за счет потери различных генов в популяциях после дупликации предкового генома i . В результате в гибридах некоторые хромосомные сегмента оказываются делегированными, а некоторые дуплицировашшми, что приводит к их нежизнеспособности. Аналогичный механизм дивергенции видов может быть обнаружен и в случае видовдвойников инфузорий комплекса i i . Секвенирование генома одного из представителей комплекса . Р. i. При этом многие гены являются уникальными . Даже в пределах одного вида между географически изолированными популяциями могут встречаться разные варианты репродуктивной изоляции. Так, репродуктивный барьер между непальскими и шриланкийскими землеройками возник за счет случайной фиксации в разных популяциях разных генов, влияющих на формирование половых клеток. Бородин, Рогачева, . Морфологически сходные виды встречаются в самых разных группах инфузорий. Поэтому проблема идентификации представителей разных видов является исключительно актуальной. Наличие сингепов см. Введение внутри многих морфологических видов еще больше запутывает ситуацию, поскольку возникает вопрос о том, с какого момента и на основании каких характеристик репродуктивно изолированную группу внутри вида синген следует считать самостоятельным видом. Даже для таких распространенных модельных объектов, как представители родов , i, , i, вопрос о статусе некоторых описанных морфологических видов и обнаруженных внутри них сингенов остается открытым. Кроме того, особый интерес вызывает вопрос о причинах возникновения такого разнообразия генетических видов у Инфузорий, механизмах видообразования. Для ответа на эти вопросы в первую очередь необходимо накопление и сопоставление огромного массива сравнительных исследований, выполненных различными методами. При этом отметим, что для многих признанных видов попрежнему не существует метода простого и быстрого определения видовой принадлежности вновь выделяемых в природе клонов. Представители рода достаточно широко используются как модельные объекты в различных исследованиях. Для всех представителей этого рода характерны яйцевидная форма клетки, длина которой варьирует от до 0 мкм, один изогнутый макронуклеус МАК и один микронуклеус МИК. Именно строение ресничного аппарата разных представителей i наряду с формой МАК являлось ключевой морфологической характеристикой в ранних сравнительных исследованиях и филогенетических построениях внутри рода см. i . В более поздних работах к числу критериев, используемых для филогенетического анализа представителей i, добавилось сравнительное изучение и сопоставление строения кортикальных структур, эндосимбионтов, данных морфометрического анализа и экологии Воггог, i, цит. i . Три вида i, Е. . v и . i . Так, виды . Е. i отличаются только по размерам клетки и по местоположению перистома. Результаты секвенирования последовательности рДНК видов рода i показали, что виды . . v и . i . В то же время, представители трех видов отличаются но некоторым экологическим особенностям. Так, несмотря на то, что все три вида, Е. . v и . . v служат одноклеточные водоросли, в то время как . Все три вида являются космополитичными и играют важную роль в морских литоральных экосистемах. Представители . Морфологическое сходство представителей трех видов в сочетании с их космополитичностью заставляет исследователей искать методы, позволяющие быстро определять видовую принадлежность выделяемых из природы особен.