Грибы рода Alternaria Nees на злаках: видовой состав и внутривидовое разнообразие

• Автор: Ганнибал, Филипп Борисович
• Шифр специальности: 03.00.24
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 158 с. : ил.

Оглавление
Введение.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Таксономия рода Аьтешаша

1.1.1. Современное состояние и проблемы таксономии рода АНегпапа.

1.1.2. Виды АИетага в микобиоте злаков и их таксономический статус

1.2. Филогения видов Аьтешаша.

1.3. Внутривидовое разнообразие и структура популяций видов Аьтешаша.

1.4. Паразитические свойства грибов рода Аьтешаша.

1.4.1. Альтернариозы злаков.

1.4.2. Патогенность.

1.4.3. Токсины
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Сбор растительного материала и изоляция грибов в чистую КУЛЬТУРУ.
2.2. Идентификация видов на основе изучения морфологокультуральных свойств
2.3. Молекулярногенетические методы
2.3.1. Общие методические подходы.
2.3.2. Экстракция ДНК.
2.3.3. КАРИ и УППЦР
2.3.4. АРЬР.
2.3.5. Конструирование специфичных праймеров
2.3.6. ПЦР со специфичными праймерами.
2.3.7. Секвенирование рДНК
2.4. Исследование физиологических свойств видов Аьтешаша
2.4.1. Патогенность.
2.4.2. Токсигенность
2.5. Обработка и анализ данных
Глава 3. ВИДОВОЙ СОСТАВ ГРИБОВ РОДА АЬТЕШАШ НА ЗЛАКАХ
3.1. Идентификация видов
3.1.1. Идентификация по морфологическим признакам и
культуральным свойствам.
3.1.2. ПЦРдиагностика
3.2. Уточнение таксономического положения видов и их
филогении.
3.2.1. Уточнение таксономии мелкоспоровых видов Акетапа
3.2.2. Дифференциация видов комплекса А. тесЮпа
3.2.3. Филогения мелкоспоровых видов АИегпапа.
Глава 4. РАСПРОСТРАНЕНИЕ ВИДОВ АЬТЕШАША НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ, ИХ ПАТОГЕННОСТЬ И ТОКСИГЕННОСТЬ
4.1. Распространение видов
4.2. Заражнность семян злаков видами Аьтешаша
4.3. Патогенность мелкоспоровых видов Аьтешаша.
4.4. Токсигенность мелокоспоровых видов Аьтеяшш
Глава 5. СТРУКТУРА ГЕОГРАФИЧЕСКИХ ПОПУЛЯЦИЙ А.
ТЕАТШ1МА
5.1. Сравнение популяций по фенотипическим признакам
5.2. Изучение структуры популяций по генетическим маркерам
Практические рекомендации.
Список литературы


Большое количество названий не вызывает удивлений, если учесть широкое распространение представителей i, их полиморфизм и те упомянутые выше ошибки и заблуждения, которые очень часто сопутствовали классификации данного рода. Рис. Соотношение количества легитимных названий видов рода i, их синонимов и незаконных видовых эпитетов. , . Мелкоспоровыми видами i именуют виды . i, длина спор которых при выращивание в чистой культуре в стандарте на картофельноморковном агаре не превышает мкм. Промежуточное положение занимают средние i, споры i, . Выбор концепции вида и чткое разграничение таксонов мелкоспоровых видов . i представляется весьма актуальной проблемой в виду того, что эта группа является наиболее распространнной среди прочих представителей рода. Сопряжнным с проблемами классификации оказывается вопрос разработки наиболее наджных и операциональных методов идентификации выделенных таксонов. При изучении мелкоспоровых видов Э. Симмонс и Р. Робертс i, , стали использовать такой признак, как габитус споруляции ii i характер расположения спороносящих структур в пространстве. Теперь наряду с формой и размером конидий, габитус споруляции является основным таксономическим признаком у видов . i, особенной мелкоспоровых. Внешний вид габитус спороношения является совокупным признаком, складывающимся из ряда следующих количество спор, несущих вто ричные конидиеносцы, место формирования вторичных конидиеносцев, их длина и количество конидиогенных локусов на них. Различается и место, где образуются первичные конидиеносцы субстратный или воздушный мицелий. Наблюдение всех перечисленных морфологических признаков проводят, выращивая изоляты на бедных углеводами питательных средах i, . Столкнувшись с тем, что некоторые виды имеют сходные габитусы споруляции ему пришлось ввести понятие видовой группы комплекс видов i, i x. Под видовой группой Э. Симмонс понимает группу морфологически различимых видов, имеющих сходные паттерны формирования конидий ii i v ii i ii, подчркивая, что данный термин применим только для отражения сходства морфологии и не может быть использован в филогенетических системах i, личное сообщение. Вариации габитуса споруляции позволили описать ряд новых мелкоспоровых видов i, , , , i, , . Целесообразность разделения видов рода i на основе паттернов спороношения в целом была подтверждена молекулярными и биохимическими данными , , Хотя некоторые исследователи попрежнему скептически относятся к такому подходу и в определнных случаях ратуют за укрупнение видов , , v . Помимо сравнительной морфологии, многими исследователями при классификации и определения видов i был опробован весь арсенал традиционных и современных методов изучение культуральных и биохимических характеристик, изоферментный анализ, различные молекулярногенетические методы. Была показана диагностическая ценность среды i x , , для целей таксономии и идентификации. Изоляты . С образуют тмнозелные колонии, . А. i желтоватооливковые . . ii белые, большинство . А. ii преимущественно зелные или светлозелные реже тмнозелные. Хотя наблюдалось некоторое варьирование окраски у разных изолятов одного вида . Вместо возможно использование и других богатых углеводами сред, например, картофельнодекстрозного агара , iii, . В таксономических исследованиях успешно применялось сравнение профилей метаболитов изолятов разных видов рода i , , . , i, . Многие виды можно различить по набору их фитотоксинов и других метаболитов.