Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы

• Автор: Шмидт, Татьяна Юрьевна
• Шифр специальности: 03.00.23
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Боровск
• Количество страниц: 145 с. : ил

СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Г енетические маркеры в селекции животных

1.2 Генетическое картирование генома крупного рогатого скота

1.3 Генетические карты сельскохозяйственных животных

1.4 Использование микросателлитных маркеров для поиска ассоциации с локусами хозяйственнополезных признаков

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1 Использованные материалы и объекты исследований

2.2 Выделение ДНК

2.3 Электрофоретическое разделение ДНК

2.4 Амплификационный анализ образцов ДЖ
2.5 Определение полиморфизма микросателлитных маркеров
2.6 Препаративное выделение ДНКфрагментов из геля с помощью раствора гуанидинизотиоцианата
2.7 Клонирование продуктов амплификации в рвЕМТ векторе
2.8 Определение нуклеотидной последовательности
2.9 Статистическая обработка данных
3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕН И Е
3.1 Формирование базы данных микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота
3.2 Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров. Популяционногенетические параметры
3.3 Исследование полиморфизма микросателлитных маркеров девятой хромосомы
3.4 Исследование полиморфизма микросателлитных маркеров шестой хромосомы
3.5 Определение новых аллелей локусов ВМ9, ВМБЗбО и
3.6 Соотношение фактических и теоретически ожидаемых гено
типов исследованных животных 1 и
3.7 Уровень гетерозиготности изучаемых маркеров
3.8 Ретроспективный анализ генотипов быков
3.9 Определение связи альтернативных аллелей, изучаемых микросателлитных локусов, наследованных потомками быков Иона3 и Погожего с признаками молочной продуктивности.
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Анализ белков позволяет тестировать изменения только в белоккодирующих последовательностях ДНК, и только у экспрессирующихся генов. Если учесть, что в геноме высших эукариот значительную часть составляют повторяющиеся последовательности, а гены сильно интронированы, то становиться очевидным, что при анализе белкового полиморфизма от внимания исследователя ускользает генома Сулимова Г. Е., . Прогресс в изучении генома наметился, когда был предложен способ анализа генетического полиморфизма на уровне ДНК Захаров, . С появлением генетических маркеров связывают возникновение особого направления в животноводстве маркернаправленной маркерзависимой селекции оценке потенциальных возможностей животных по их внутренним морфофизиологическим и генетическим особенностям. Оценки полиморфности ДНК, проведенные на основании отличий последовательностей ДНК разных индивидуумов, показали, что каждые два не родственных индивидуума отличаются не менее чем тремя миллионами пар оснований. Различия между двумя геномами не сосредоточены в какойлибо из его специфических областей, а разбросаны по всему геному, и в основном они концентрируются в некодирующих областях генов. Характерной особенностью эукариотического генома является то, что кодирующие последовательности гены составляют лишь малую долю наследственного материала 5 у млекопитающих. И только небольшое число различий приводит к наблюдаемым на уровне фенотипа изменениям Свердлов Е. Д., . Сейчас внимание генетиков все больше занимают открытые в последнее десятилетие последовательности, принадлежащие повторяющейся фракции геномной ДНК мини и микросателлиты, необычайно высокий уровень полиморфизма которых заключается в вариациях количества повторяющихся единиц. Одной из основных задач генетики крупного рогатого скота является выявление локусов, определяющих формирование хозяйственнополезных признаков. Для е успешного решения необходимым условием является наличие легко детектируемых высокополиморфных маркеров с кодоминантным типом наследования. В настоящее время доминирующую роль в качестве таких маркеров играют микросателлитные последовательности ДНК. С их использованием построена самая подробная генетическая карта крупного рогатого скота, которая легла в основу работ по поиску локусов хозяйственнополезных признаков с помощью ДНКмаркеров. С открытием микросателлитных маркеров связывают переход от классической прямой генетики, двигавшейся к идентификации генов от признаков, кодируемых этими генами, к так называемой обратной генетике, которая сначала идентифицирует фрагмент генома, а затем занимается выяснением, какой признак определяется этим фрагментом Свердлов Е. Д., . Этот, казалось бы, неочевидный подход, называемый, позиционным клонированием, объясняется тем, что геном эукариот имеет сложную организацию, в котором гены не являются независимыми изолированными компонентами, и фенотипические признаки детерминируются сложной цепью взаимоотношений между генами. Известно, что множество фенотипических признаков, в частности количественные признаки сельскохозяйственных животных, являются полигенными, и то, что одни и те же фенотипические проявления могут быть следствием мутации разных генов. Поэтому для определения генетической структуры, определяющей тот или иной фенотипический признак, необходимо установить связь между признаком и локусом генома, который легко детектируется посредством какоголибо маркера. В качестве таких маркеров доминирующую роль играют микросателлитные последовательности, обеспечившие настоящий прорыв в изучении генома млекопитающих М. Характеристика микросателлитных маркеров, их функциональная роль. Микросателлиты относятся к классу тандемных повторов, которые составляют значительную часть эукариотического генома, и в частности, генома крупного рогатого скота . Микросателлитные блоки достаточно равномерно распределены по всему эухроматину и присутствуют в составе как транскрибируемых, так и не транскрибируемых последовательностей ДНК М. Микросателлитам свойственно мснделевское наследование, множественность аллелей и высокая гетерозиготность.