Оценка генетического разнообразия сортов картофеля и родственных видов Solanum методом анализа умеренно повторяющихся последовательностей генома

• Автор: Бирюкова, Виктория Александровна
• Шифр специальности: 03.00.23
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 138 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1.ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Систематика рода i и происхождение картофеля.

1.1.1. Происхождение и систематика видов i, относящихся к серии i . или

1.1.2. История культивируемых видов i картофеля

1.2. Идентификация сортов и видов i на основе морфологических признаков и биохимических маркеров
1.3. Методы ДНК генотипирования растений и их использование в генетике, селекции и семеноводстве культурных растений
1.3.1. Полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов ii i, и его использование для генотипирования растений

1.3.2. Минисателлиты

1.3.3. Методы, основанные на полимеразной цепной реакции

1.3.3.1. Полиморфизм ДНК, амплифицированной случайным образом ii i ,

1.3.3.2. Охарактеризованная последовательность амплифицированного участка ДНК i ii i, .
1.3.3.3. Методы, основанные на полиморфизме микросателлитных последовательностей растительного генома
1.3.3.4. Последовательности между простыми повторяющимися последовательностями Ii , I
1.3.4. Методы, занимающие промежуточное положение между методами,
основанными на гибридизации, и методами.
1.3.4.1. Полиморфизм по длине амплифицированных фрагментов ii i,
1.3.4.2. Методы, основанные на полиморфизме амплифицированных ретротранспозонспецифических последовательностей
ii iii i,
1.З.4.З. Полиморфизм амплифицированных и отрестриктированных
последовательностей v ii i ,
1.4. Сравнительная оценка методов ДНК генотипирования
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Растительный материал.
2.2. Методы ДНК анализа
2.2.1. Выделение геномной ДНК из тканей растений.
2.2.1.1. Приготовление растворов, используемых для выделения геномной ДНК
2.2.2. Условия проведения ПЦР
2.2.3. Детекция продуктов реакции
2.3. Кластерный анализ.
2.4. Анализ результатов полиморфизма умеренных повторов
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Воспроизводимость метода
3.2. Полиморфизм умеренных повторов среди видов i.
3.3. Полиморфизм умеренных повторов внутри видов i
3.4. Изучение процесса интрогрессии генетического материала с помощью анализа полиморфизма умеренных повторов
3.5. Границы разрешения метода анализа полиморфизма умеренных
повторов
4. ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. Возможности использования метода анализа полиморфизма умеренных повторов для изучения генетического разнообразия форм i.
4.2. Исследование межвидовых связей рода с помощью полиморфизма умеренных повторов и сравнительный анализ полученных
результатов с данными фенотипической и молекулярной систематики
, полученными другими авторами.
4.3. Исследование полиморфизма умеренных повторов у разных форм
. и сравнение полученных результатов с селекционной историей сортов
4.3.1. Исследование полиморфизма умеренных повторов у раннеспелых сортов картофеля и сравнительный анализ полученных результатов с их родословными.
4.3.2. Исследование полиморфизма умеренных повторов у сортов картофеля, в селекции которых участвовал . i
4.3.3. Исследование полиморфизма умеренных повторов у сортов картофеля, в селекции которых участвовал . .
4.3.4. Исследование полиморфизма умеренных повторов у американских сортов картофеля и сравнительный анализ полученных результатов с их родословными.
4.3.5. Исследование полиморфизма умеренных повторов у нематодоустойчивых сортов картофеля и сравнительный анализ полученных
результатов с их родословными
5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Картофель относится к большому семейству Пасленовые, широко распространнному по всему миру. Внутри этого семейства выделяет родов и видов . Кроме картофеля, семейство включает несколько экономически ценных культурных растений баклажаны, сладкий и чили перец, петуния, табак, томаты и др. Картофель относится к обширному роду . Центральной и Южной Америки и Африки Жуковский, . Виды картофеля резко различаются по морфологическим признакам, биологическим и физиологическим особенностям и биохимическим свойствам. До настоящего времени ещ нет единой классификации клубнеобразующих видов Бацанов, . В систематике видов , используемых в селекции, существует три различных направления 1. С.М. Букасов и С. В. Юзепчук 2. Дж. Хоке 3. Д. Коррелл Букасов, . Серии секции i подразделяются на две географические группы южноамериканскую и североамериканскую. По форме венчика серии объединены в две группы 1 с колесовидным пятиугольным венчиком и 2 со звездчатым венчиком Букасов, . Форма венчика примитивная звездчатая или более продвинутая колесовидная является существенным таксономическим признаком для клубнеобразующих видов подсекции . Согласно , виды со звездчатым или
колесовидным венчиком должны объединяться в соответствующие надсерии. Примечательно, что как показали Vv . Согласно данным этих исследователей, надсерия , очевидно, имеет полифилетическую природу, и положение видов серии . Что касается морфологии , эти виды первоначально располагались вместе с . Букасов, , , , но позже были отнесены к сер. По данным Vv . Букасов включает в секцию i виды серий, перечисленных ниже. Эти серии объединены в пять подсекций. Южноамериканские 1. Букасов, . Серию Букасов и его сотрудники разделили на серии i, ii и ряд южноамериканских серий подсекций i и ii. Объм серии ограничили лишь тихоокеанскими видами. Серию ii . Букасов, . В целом система подсекций, серий и видов картофеля рода по Букасову выглядит так, как показано на рис. Система серий Букасова существенно отличается от системы Хокса. По сравнению с Букасовым , Хоке укрупнил некоторые серии и виды картофеля, в том числе и культурные. Секция i i . Секция i . Род Секция i . Подсети i . Подсети i . Североамериканские
Подсети i . Подсети i . Рис. Система подсекций, серий и видов по Букасову . Лаплатской низменности, а i занимает в основном предгорье Анд. Хоке считает серию ii единой, у Букасова она дифференцирована на собственно ii и Охусагра, так как Охусагра отличается от ii особенно длинными и в то же время узкими ягодами на тонких плодоножках. У Хокса серия очень обширна и включает как все возделываемые в Латинской Америке виды, так и ряд дикорастущих Будин, . В соответствии с последней полной таксономической трактовкой Хокса, культурный картофель выращиваемый во всем мире, включает семь культурных и 5 диких видов , . Культурные и дикие виды картофеля объединяются в род . Секции . Хоке разделил секцию на новые подсекции i , содержащую не образующую клубней серию и серию ii, и подсекцию , с клубнеобразующими сериями. Подсекция включает две надсерии надсерию , включающую 9 из серий, и отдельную надсерию , содержащую оставшиеся серий. Он признал новую серию iii и пополнил данными о названиях новых видов его таксономическую трактовку , сделал некоторые перемещения видов между сериями i, . Все виды разделены на две группы, заключающие в себе соответственно дикорастущие и культурные виды , . Хоке рассматривает виды как крупные комплексы вариаций. Он объединяет вид . Из изложенного можно заключить, что различия между системами Букасова и Хокса не оказывают влияния на основной принцип построения системы серий и видов клубненосных форм рода Будин, . В настоящее время, большинство учных пользуются классификацией Хокса. В данной работе мы также придерживаемся систематики по Хоксу рис. Систематика культурных сортов картофеля прошла два исторических этапа. На первом этапе систематики рассматривали так называемые коммерческие сорта картофеля Европы и США, возникшие в XIX и XX вв. Это были потомки немногих образцов аборигенных сортов чилийского и перуанского происхождения Букасов, .