Полиморфные маркеры в геномной дактилоскопии и генетическом анализе ряда мультифакторных заболеваний

• Автор: Чистяков, Дмитрий Александрович
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 351 с. : ил

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АПФ ангиотензинпревращающий фермент

ДА диабетические ангиопатии

ДН диабетическая нефропатия

ДР диабетическая ретинопатия

ДСН додецилсульфат натрия

ДТЗ диффузнотоксический зоб

ДТТ дитиотрейтол

ГБ гипертоническая болезнь

ГКМП гипертрофическая кардиомиопатия

ГЛЖ гипертрофия левого желудочка

ИБС ишемическая болезнь сердца
ИЗСД инсулинзависимый сахарный диабет
ИМ инфаркт миокарда
ИНСД инсулиннезависимый сахарный диабет
ПААГ полиакриламидный гель
ПДРФ полиморфизм длины рестрикционных фрагментов
ii i
п.н. пара нуклеотидов
ГОДР полимеразная цепная реакция
i i
РАМН Российская академия медицинских наук
Р.АС ренинангиотензиновая система
СД сахарный диабет
т.п.н. тысяча пар нуклеотидов
тРНК транспортная РНК
ТХУ трихлоруксусная кислота
ЭДТА этилендиам и нтетрауксус ная кислота
ii i полиморфизм длины амплифицированных фрагментов
аденозинтрифосфорная кислота
ii ii олигонуклеотид, специфичный к
определенному аллелю сМ сантиморганида
2 дезоксиаденозинтрифосфорная кислота
2дезоксицитидинтрифосфорная кислота
2дсзоксигуанозинтрифосфорная кислота
2дезокситимидинтрифосфоркая кислота
2дсзоксинуклеозидтрифосфорная кислота
iiii разрешающая сила
I i ii информационное
содержание полиморфизма рМ ii вероятность случайного совпадения
генотипов двух наугад взятых индивидов
короткие тандемные повторы
i i i конформационный
полиморфизм одноцепочечной ДНК
V vi тандемные повторы с
изменяющимся числом копий
, , , тетраметилэтилендиамин
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ


Имеются три набора, каждый из которых содержит реактивы для одновременной амплификации 3 разных локусов 9, , 7 1, ТРОХ, ТН , , v с последующей детекцией продуктов ПЦР с помощью нитрата серебра. СМ 1 3 в конъюгате с щелочной фосфатазой . Еще более обширный ассортимент коммерческих наборов предлагает фирма iтег. К ним относятся уже вышеупомянутая система i из 9 и iш с флуоресцентными праймерами пяти цветов к 7 локусам амелогенин, 3, I, ТН, ТРОХ, 1, . Все эти локусы входят в состав унифицированной на территории США панели 1 . Отдельно предлагается набор дня амплификации высокополиморфного V МСТ8 1, обеспечивающий для трех основных этнических групп США значения от 0. Также имеются для продажи индикаторные полоски для экспресс
анализа ДНК в пятнах по группам крови и локусам 1, , , и , генотипирование с использованием которых дает значения в основных популяциях США европеоиды, негры, латиноамериканцы, выходцы из Азии от 0. Яркой демонстрацией возможностей идентификационного анализа с использованием локусов служат результаты работы по идентификации останков семьи русского императора Николая II, проведенной в период с по г. Из фрагментов костей 9 человеческих скелетов, изъятых из группового захоронения в окрестностях Екатеринбурга, была выделена ДНК. Типирование по локусу половой принадлежности гена амелогенина показало, что 4 скелета принадлежат мужчинам и 5 женщинам. С привлечением шести полиморфных vV, ТН, ЗА, и АСТВР2 было установлено, что 5 скелетов образуют семейную группу император Николай II, императрица Александра Федоровна и три их дочери с вероятностью не менее . ДНК мтДНК обнаружило у Николая II чрезвычайно редкое явление традиционней гетероплазмческой мутации, заключающееся в одновременном присутствии в одних и тех же костных останках двуоч форм мтДНК одна с цитозином, а другая с тимином в положении 9. Подобный феномен был показан и у родного брага императора Великого князя Георгия Романова, что повысило доказательственное значение позитивной идентификации исследованный скелет принадлежит именно Николаю И до . Действительно, в древних костных останках и в мягких тканях мумий степень сохранности мтДНК выше ввиду ее гораздо более простой организации и большей представленности десятки молекул в клетке по отношению к единичной ядерной хромосомной ДНК. ДНК 5. Гак, удалось расшифровать структуру гипервариабельной петли мтДНК мумифицированных человеческих останков возрастом около лет 2. Определение пола генетическими методами осуществимо для останков возрастом свыше лет 9. Этот V был открыт в г. МСТ8 в анонимном межгенном локусс 1 позднее 1 на хромосоме I рр 0. Тандемный повтор содержит коровую последовательность 9, 0. Проведен анализ около популяций, субпопуляций и генетических изолятов во всем мире. В разных выборках обнаружено от 7 до аллелей, содержащих от до членных повторов. Показано также наличие минимум 8 промежуточных аллелей с несовершенными повторами длиной менее п. Обнаружены и высокомолекулярные аллели длиной около п. ПЦР в результате образования гетеродуплексов между обычными низкомолекулярными аллелями 8. Наблюдаемая гстерозиготность локуса в разных популяциях варьирует от до . В европейских и арабских популяциях преобладают аллели с и повторами, у монголоидов аллели и в ряде популяций , и , у негроидов аллели , , , . Этот высокополиморфный локус широко используется в сравнительнопопуляционном и филогенетическом анализе 8, 4, генетических исследованиях ряда раковых и наследственных заболеваний , 6, 0, 0 и идентификации личности. В последнем случае сто успешное применение объясняется высокой информативностью и разрешающей способностью РЭ достигает 0. ДНК до пг и из широкого круга биологических источников вплоть до костного материала многолетней давности , 7, 0, 0. Изза большого числа аллелей и относительно небольших размеров повторяющегося мотива п. Коммерческий лэддер последнего поколения содержит основных аллелей МСТ8, содержащих от до повтора 8, 0, и может эффективно и полностью реамплифицироваться десятки раз .