Генетическая дивергенция в популяциях сельскохозяйственных животных

• Автор: Терлецкий, Валерий Павлович
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 1999
• Место защиты: Санкт-Петербург, Пушкин
• Количество страниц: 323 с. : ил.

Содержание
Введение

1. Обзор литературы.

1.1. Терминология.

1.2. Генетические процессы в популяциях животных.

1.2.1. Мутации

1.2.2. Миграция и генетический дрейф.

1.2.3. Естественный отбор.

1.2.4. Генетический драйв.

1.3. Структура и организация ядерного и митохондриального

генома животных.

1.4. Функциональное значение отдельных последовательностей
1.5. Гипервариабельные участки ДНК в геномах животных.
1.6. Фингерпринтинг ДНК в изучении генетической вариабельности
у животных
1.7. Методология расчета генетических параметров в популяции
животных
1.8. Методы выявления генетической вариабельности ДНК.
1.9. Филогенетические взаимоотношения в некоторых систематических
группах и породообразование у домашних животных.
2. Материалы и методы исследований.
2.1. Материал для исследований.
2.2. Секвенирование генов митохондриальной ДНК.
2.3. Флуориметрический анализ полиморфизма
последовательностей ДНК
2.4. Тотальная гибридизация с меченым ДНКзондом.
2.5. Фингернршггинг ДНК
2.5.1. Ферментативное расщепление ДНК
2.5.2. Электрофорез фрагментов ДНК в агарозном геле
2.5.3. Перенос фрагментов ДНК с геля на нейлоновый фильтр
2.5.4. Подготовка зондов ДНК.
2.5.5. Проведение молекулярной гибридизации зондов ДНК
с геномной ДНК животных
2.5.6. Детекция мест связывания меченой ДНК зондов на фильтрах.
2.5.7. Анализ распределения полос на картинах фингерпринтинга
3. Результаты исследования
3.1. Дивергенция последовательностей ДНК между крупными систематическими группами животных
1.2. Межвидовая генетическая дивергенция на примере животных семейства куницеобразных, отряда курообразных, осетровых рыб, домашней и дикой свиньи.
1.3. Генетическая дивергенция между разными породами животных в пределах одного биологического вида методами флуориметрии и рестрикционного полиморфизма.
1.4. Межпородная генетическая дивергенция на картинах фингерпринтинга у крупного рогатого скота.
1.5. Г енетическая вариабельность в породах кур
1.6. Генетическая дивергенция у овец различных
пород и популяций
1.7. Полиморфизм микросателлитпых последовательностей
ДНК на примере овец породы Тексель.
1.8. Г енетическая дивергенция у коз различных пород и популяций.
1.9. Ассоциация полос на картинах фингерпринтинга
с фенотипическими признаками.
4. Обсуждение.
Выводы.
Практические предложения.
Литература


Эта дупликация не является частью инсерционного элемента, а представляет собой результат нов горений сайгамишени, в который внедряется элемент. Впоследствии было изучено множество таких элементов, что дало основание к их классификации. Современные представления о мигрирующих по геному элементах сводятся к тому, что их можно разделить на несколько групп инсерционные элементы, транспозоны, ретроэлементы. Кроме этого, имеются геномные последовательности, появляющиеся путм ретропозиции РНК в геном, однако, лишенные возможности перемещаться самостоятельно. Они названы регропоследовательностями и представлены ретрогенами и рстропсевдогснами. Транспозоны представляют собой генетические элементы, сходные с инсерционными последовательностями, но обладают способностью нести какиелибо гены помимо генов, отвечающих за перемещение. Так как транспозоны несут дополнительные последовательности ДНК, обычно они длиннее инсерционных элементов и составляют в длину пар оснований Vi 1л, . Транспозоны различных типов представлены не только в бактериальных клетках, но и в геномах млекопитающих. Как отмечалось выше, имеются транспозоны, перемещающиеся путем ретропозиции. Все эти последовательности ДНК несут ген, кодирующий фермент обратную транскринтазу. i, . Таблица 2. Классификация ретроэлементов i, . Ретроэлемент Обратная транскриптаза Транспозиция Наличие 1К Вирус част. Среди представленных в таблице 2 генетических элементов наиболее высокоорганизованным является ретровирус. Их геном состоит, по крайней мере, из трех генов , и v i, . Ген кодирует полипротеид, который затем превращается в несколько небольших структурных белков вирусной частицы. Ген определяет первичную структуру фермента обратная транскриптаза. Ген v кодирует поверхностный белок вирусной частицы. Нефункционирующими ретропоследовательностями являются ретропсевдогены. Большинство из них происходит из зранскриптов РНК i А, . В принципе, ретропсевдогены могут возникать из любых транскриптов РНК, находящихся в клетке. К настоящему времени не известны только ретронсевдогены произошедшие из транскриптов РНКполимеразы I , , 5 5,8 и 5 тРНК. Ретропсевдогены очень широко представлены в геномах животных и человека. Практически любая иРНК может создать свои ретропсевдогены. Например, у человека известны ретропсевдогенов гена аргининсукцинат синтегазы, около гена Интересно отметить, что описанные выше короткие последовательности ДНК, I также являются одним из типов регропозонов. Они также могут размножаться через посредничество комплементарной ДНК, которая встраивается в геном животных. элемснты не содержа Различные подвижные элементы используют разные механизмы транспозиции. Единственным структурным требованием для транспозиции является наличие коротких концевых повторов, которые служат последовательностями узнавания. Каждая транспозиция представляет собой мутацию, имеющую или не имеющую фенотипическое проявление. Мобильные элементы могут инактивировать любой ген, в который они встраиваются, и многие спонтанные мутации, по видимому, являются результатом вставки мобильных элементов. Существует мнение, что транспозирующие элементы играют существенную роль в эволюционном процессе. Более того, даже многие формы злокачественных новообразований развиваются после генетических транспозиций i, . К повторяющимся элементам генома относятся также так называемые гипервариабельные участки генома. Они стали чрезвычайно широко использоваться как генетические маркеры. Этот тип последовательностей ДНК будет подробно обсуждн в разделе 1. Уникальные последовательности ДНК составляют в геномах животных около от общего содержания ДНК. В эту фракцию генома включаются большинство структурных генов. Поэтому даже самые незначительные изменения в этих участках ДНК могут иметь большой фенотипический эффект. Наиболее изученным процессом в уникальной ДНК является накопление точечных мутаций, ведущих к изменению структуры белков.