Анализ ДНК-полиморфизма гороха посевного : Pisum sativum L.

• Автор: Дрибноходова, Ольга Павловна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 154 с. : ил.

Содержание

Список сокращений.

Введение

Цель работы.

Обзор литературы

Организация ядерного генома высших растений

Изучение полиморфизма генома растений

Проблема генетического картирования у растений

Картирование генома гороха

Изучение молекулярногенетического полиморфизма

ЯАРОмаркеры
маркеры
Изучение влияния условий космического полета на геном
высших растений.
Заключение.
Материалы и методы
Исходный материал
Получение гибридов и расщепляющихся популяций 2.
Определение гетерозиготности но транслокации.
Выделение тотальной ДНК из листьев гороха
Полимеразная цепная реакция
Фракционирование продуктов амплификации
Обработка результатов генетического анализа
Результаты и обсуждение .
Анализ межлинейного полиморфизма
Полиморфизм по марксрам
Полиморфизм по маркерам
Анализ межлинейного полиморфизма.
Анализ генетических различий.
Анализ мутантов.
Идентификация линий и сортов
Анализ внутрилинейного полиморфизма.
Картирование
Картирование гена хлорофилл .
Картирование па основе скрещивания Хлорофилл2 х 8 Изучение влияния условий длительного космического полета на геном гороха.
Заключение
Выводы
Список литературы


При этом в составе генома выделяется несколько фракции уникальные последовательности, умеренно повторяющиеся последовательности и высокоповторяющиеся последовательности. Уникальные последовательности чаще всего представлены генами и встречаются в геноме один или небольшое число раз. К группе умеренных повторов, представленных в числе нескольких ДОСЯ I ков или сотен копий, принадлежат тандемные повторы генов рибосомальнмх РНК, пистонов и некоторых других активно синтезирующихся продуктов. К высокоповторяющимся последовательностям, число которых в геноме достигает К6 копий, относятся мобильные генетические элементы, а также различные вариан ты пов торов определенного мотива. Мобильные генетические элементы являются основным компонентом большинства эукариотических геномов. У большинства растений они составляют генома, однако в некоторых случаях, как, например, у ряда лилейных, доля трапспозопов может достигать . , . РНК и ДНКтраиспозоны мобильные элементы второго типа, перемещающиеся непосредственно в виде фрагментов ДНК. Ретротранспозоны по строению делятся па два типа. транспозоны i имеют длинные прямые терминальные повторы и содержат по крайней мерс два гена и , обеспечивающие их перемещение. кодирует камеидоподобпый белок, сложный белок, имеющий нротеазиую, обратнотраискриптазиую, РНКазиую и интегразную активности. Неавтономные элементы имеют делении кодирующих участков. К траиспозопам относятся семейства II 1 у гороха посевного, 1 у кукурузы и II у гороха посевного, I у арабидопсиса . Vii . . ретротранспозоиы делятся на I I и I I . Трапспозоиы обеих групп оканчиваются простым повтором, обычно нолиА. В последовательности Iэлементов содержатся промотор РНК полимеразы И и две рамки считывания, кодирующие подобный белок, эндонуклеазу и обратную транскриптазу. группе Iэлементов относятся трапспозоиы i4 кукурузы и Размер транспозопов типа I составляет около 6 кВ, Iэлементы намного короче менее 0 п. В их основной последовательности около 5 конца имеется промотор РНК полимеразы III, по нет открытых рамок считывания, а 3 концевой участок гомологичен соответствующему району Iэлементов того же генома, чьи ферментные системы они используют для перемещения . i . ДМКтранспозопы имеют на концах инвертированные повторы и прямые дупликации определенного участка сайта встраивания. Обе реакции обеспечиваются ферментом граненозазой, которая закодирована в последовательности мобильного элемента. Неавтономные ДНКтранспозоиы, как и неавтономные рстротранспозопы, имеют нарушения в аппарате транспозиции и перемещаются, паразитируя на активных трапспозопах своей группы. Среди представителей ДНКтрапспозонов можно назвать мобильные элементы кукурузы Ас автономный и неавтономный, за открытие которых Барбара МакКлинток получила Нобелевскую премию в г. i . Мобильные элементы оказывают значительное воздействие на геном растений. Помимо увеличения общего количества ядерпой ДНК, ипсерции транспозопов в кодирующие последовательности могут приводить к инактивации генов, а при внедрении в рщуияториыс элементы к изменению экспрессии. Рекомбинация по последовательностям транспозопов вызывает появление хромосомных перестроек. Повидимому, наибольшее воздействие па организацию и эволюцию растительных геномов оказали ретротранспозопы и ДНКтрапспозопы типа МГП2, встраивающиеся преимущественно в нскодирующис участки растительных генов. Тем не менее, высококопийныс транспозоиы, имеющие наибольший вклад в эволюцию геномов, в основном неактивны . Анализ последовательностей транспозопов, особенно , позволяет получить информацию об эволюции генома растений и филогенетических отношениях между видами . Vii . .